-
वनस्पती/प्राणी डी नोव्हो जीनोम सिक्वेन्सिंग
डी नोव्होसीक्वेन्सिंग म्हणजे संदर्भ जीनोम नसताना, सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञान, उदा. PacBio, Nanopore, NGS, इ. वापरून प्रजातीच्या संपूर्ण जीनोमचे बांधकाम.तिसऱ्या पिढीच्या सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञानाच्या वाचनाच्या लांबीमधील उल्लेखनीय सुधारणेमुळे जटिल जीनोम एकत्र करण्यासाठी नवीन संधी उपलब्ध झाल्या आहेत, जसे की उच्च विषमता, पुनरावृत्ती क्षेत्रांचे उच्च गुणोत्तर, पॉलीप्लॉइड इ. पुनरावृत्ती घटकांचे निराकरण करणे, असामान्य GC सामग्री असलेले प्रदेश आणि इतर अत्यंत जटिल प्रदेश.
प्लॅटफॉर्म: PacBio सिक्वेल II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq6000
-
हाय-सी आधारित जीनोम असेंब्ली
हाय-सी ही प्रोबिंग प्रॉक्सिमिटी-आधारित परस्परसंवाद आणि उच्च-थ्रूपुट अनुक्रम एकत्र करून गुणसूत्र कॉन्फिगरेशन कॅप्चर करण्यासाठी डिझाइन केलेली पद्धत आहे.या परस्परसंवादाची तीव्रता गुणसूत्रावरील भौतिक अंतराशी नकारात्मकरित्या संबंधित असल्याचे मानले जाते.म्हणून, हाय-सी डेटा ड्राफ्ट जीनोममध्ये एकत्रित केलेल्या अनुक्रमांचे क्लस्टरिंग, क्रम आणि ओरिएंटिंग आणि विशिष्ट संख्येच्या गुणसूत्रांवर अँकरिंग करण्यासाठी मार्गदर्शन करू शकतो.लोकसंख्या-आधारित अनुवांशिक नकाशाच्या अनुपस्थितीत हे तंत्रज्ञान गुणसूत्र-स्तरीय जीनोम असेंब्ली सक्षम करते.प्रत्येक जीनोमला हाय-सी आवश्यक आहे.
प्लॅटफॉर्म: इलुमिना नोव्हासेक6000 / डीएनबीएसईक्यू
-
उत्क्रांती आनुवंशिकी
उत्क्रांती आनुवंशिकी ही SNPs, InDels, SVs आणि CNVs सह अनुवांशिक भिन्नतेवर आधारित दिलेल्या सामग्रीच्या उत्क्रांतीविषयक माहितीचे सर्वसमावेशक अर्थ प्रदान करण्यासाठी डिझाइन केलेली एक पॅक सिक्वेन्सिंग सेवा आहे.हे उत्क्रांतीवादी बदल आणि लोकसंख्येच्या अनुवांशिक वैशिष्ट्यांचे वर्णन करण्यासाठी आवश्यक असलेले सर्व मूलभूत विश्लेषण प्रदान करते, जसे की लोकसंख्येची रचना, अनुवांशिक विविधता, फायलोजेनी संबंध, इ. यामध्ये जनुक प्रवाहावरील अभ्यास देखील समाविष्ट आहेत, जे प्रभावी लोकसंख्येच्या आकाराचा अंदाज, विचलन वेळ यांना सक्षम करते.
-
तुलनात्मक जीनोमिक्स
तुलनात्मक जीनोमिक्सचा शाब्दिक अर्थ आहे भिन्न प्रजातींच्या संपूर्ण जीनोम अनुक्रम आणि संरचनांची तुलना करणे.या शिस्तीचे उद्दिष्ट प्रजाती उत्क्रांती, जनुक कार्य, जीनोम स्तरावर जनुक नियामक यंत्रणा प्रकट करणे हे अनुक्रम संरचना आणि घटक ओळखून विविध प्रजातींमध्ये संरक्षित किंवा वेगळे केले जाते.ठराविक तुलनात्मक जीनोमिक्स अभ्यासामध्ये जीन कुटुंबातील विश्लेषणे, उत्क्रांती विकास, संपूर्ण जीनोम डुप्लिकेशन, निवडक दाब इ.
-
मोठ्या प्रमाणात सेग्रेगंट विश्लेषण
बल्क्ड सेग्रेगंट अॅनालिसिस (BSA) हे फिनोटाइपशी संबंधित अनुवांशिक मार्कर पटकन ओळखण्यासाठी वापरले जाणारे तंत्र आहे.BSA च्या मुख्य कार्यप्रवाहामध्ये अत्यंत विरोधी फिनोटाइप असलेल्या व्यक्तींचे दोन गट निवडणे, सर्व व्यक्तींचे DNA एकत्र करून दोन मोठ्या प्रमाणात DNA तयार करणे, दोन पूलांमधील भिन्नता क्रम ओळखणे समाविष्ट आहे.हे तंत्र वनस्पती/प्राणी जीनोममधील लक्ष्यित जनुकांशी मजबूतपणे संबंधित अनुवांशिक मार्कर ओळखण्यासाठी मोठ्या प्रमाणावर वापरले गेले आहे.
