उत्पादने

*येथे दाखवलेले डेमो परिणाम सर्व BMKGENE सह प्रकाशित जीनोमचे आहेत

1. उत्क्रांती विश्लेषणामध्ये फायलोजेनेटिक वृक्ष, लोकसंख्येची रचना आणि अनुवांशिक फरकांवर आधारित पीसीएचे बांधकाम समाविष्ट आहे.

फायलोजेनेटिक वृक्ष सामान्य पूर्वज असलेल्या प्रजातींमधील वर्गीकरण आणि उत्क्रांती संबंधांचे प्रतिनिधित्व करते.
PCA चे उद्दिष्ट उप-लोकसंख्येमधील जवळीक पाहण्याचे आहे.
लोकसंख्येची रचना एलील फ्रिक्वेन्सीच्या संदर्भात अनुवांशिकदृष्ट्या वेगळ्या उप-लोकसंख्येची उपस्थिती दर्शवते.

चेन, इ.अल.,PNAS, २०२०

2.निवडक स्वीप

निवडक स्वीप म्हणजे अशा प्रक्रियेचा संदर्भ आहे ज्याद्वारे एक फायदेशीर साइट निवडली जाते आणि लिंक केलेल्या तटस्थ साइटची वारंवारता वाढविली जाते आणि लिंक न केलेल्या साइट्सची वारंवारता कमी केली जाते, परिणामी प्रादेशिक घट होते.

निवडक स्वीप क्षेत्रांवरील जीनोम-व्यापी शोधाची प्रक्रिया एका स्लाइडिंग विंडोमध्ये (100 Kb) ठराविक पायरीवर (10 Kb) सर्व SNP च्या जनुकीय अनुवांशिक निर्देशांक (π，Fst, Tajima's D) मोजून केली जाते.

न्यूक्लियोटाइड विविधता (π)

ताजिमाचे डी

फिक्सेशन इंडेक्स (Fst)

वू, इ.अल.,आण्विक वनस्पती, 2018

3.जीन फ्लो

वू, इ.अल.,आण्विक वनस्पती, 2018

4.लोकसंख्याशास्त्रीय इतिहास

झांग, इ.अल.,निसर्ग पर्यावरण आणि उत्क्रांती, २०२१

5. विचलन वेळ

झांग, इ.अल.,निसर्ग पर्यावरण आणि उत्क्रांती, २०२१

बीएमके केस

जीनोमिक व्हेरिएशन मॅप स्प्रिंग चायनीज कोबी (ब्रासिका रापा एसएसपी. पेकिनेन्सिस) निवडीच्या अनुवांशिक आधारावर अंतर्दृष्टी प्रदान करतो

प्रकाशित: आण्विक वनस्पती, 2018

अनुक्रम धोरण:

अनुक्रमण: अनुक्रम खोली: 10×

मुख्य परिणाम

या अभ्यासात, 10× च्या सरासरी खोलीसह 194 चायनीज कोबी पुन्हा अनुक्रमित करण्यासाठी प्रक्रिया करण्यात आली, ज्यातून 1,208,499 SNPs आणि 416,070 InDels मिळाले.या 194 ओळींच्या फायलोजेनेटिक विश्लेषणातून असे दिसून आले आहे की या रेषा वसंत ऋतु, उन्हाळा आणि शरद ऋतूतील तीन इकोटाइपमध्ये विभागल्या जाऊ शकतात.याव्यतिरिक्त, लोकसंख्येची रचना आणि पीसीए विश्लेषणाने असे सूचित केले आहे की स्प्रिंग चायनीज कोबीची उत्पत्ती चीनमधील शेडोंग येथील शरद ऋतूतील कोबीपासून झाली आहे.हे नंतर कोरिया आणि जपानमध्ये ओळखले गेले, स्थानिक रेषा ओलांडले गेले आणि त्यातील काही उशीरा-बोल्टिंग वाण चीनमध्ये परत आणले गेले आणि शेवटी स्प्रिंग चायनीज कोबी बनले.

निवडीवर स्प्रिंग चायनीज कोबी आणि शरद ऋतूतील कोबीजवरील जीनोम-व्यापी स्कॅनिंगमध्ये 23 जीनोमिक लोकी आढळून आले जे मजबूत निवडीमधून गेले आहेत, त्यापैकी दोन QTL-मॅपिंगवर आधारित बोल्टिंग-टाइम कंट्रोलिंग क्षेत्रासह आच्छादित आहेत.या दोन प्रदेशांमध्ये फुलांचे नियमन करणारे प्रमुख जीन्स आढळले, BrVIN3.1 आणि BrFLC1.ट्रान्सक्रिप्टोम अभ्यास आणि ट्रान्सजेनिक प्रयोगांद्वारे या दोन जनुकांचा बोल्टिंग वेळेत सहभाग असल्याची पुष्टी झाली.

चीनी कोबी वर लोकसंख्या संरचना विश्लेषण

चिनी कोबीच्या निवडीवर अनुवांशिक माहिती