प्लॅटफॉर्म | लायब्ररीचा आकार | सैद्धांतिक डेटा उत्पन्न (प्रति सेल) | सिंगल-बेस अचूकता | अर्ज |
नानोपोर | 8Kb, 10kb, 20kb, अल्ट्रालाँग, cDNA-PCR | 70-90Gb/सेल | ८५-९२% | एसव्ही कॉलिंग, डी नोव्हो, पूर्ण-लांबीचे अनुक्रम, आयसो-सेक, जीन भाष्य, डीएनए मेथिलेशन शोधणे |
● विविध प्रजातींसह हजारो बंद प्रकल्पांसह PacBio सिक्वेन्सिंग प्लॅटफॉर्मवर 5 वर्षांचा अनुभव.
● BMKGENE ड्युअल प्लॅटफॉर्म RNA/DNA प्रमाणपत्रासह ऑक्सफर्ड नॅनोपोरचा अधिकृत भागीदार आहे.
● संपूर्ण उपकरणे आणि पुरेशा सिक्वेन्सिंग थ्रूपुटसह सीक्वेन्सर्सचे मुख्य प्रवाहातील मॉडेल आहेत.
● नॅनोपोर प्लॅटफॉर्मवर आधारित, 10 हून अधिक प्राणी आणि वनस्पती डेनोवो संशोधन आंतरराष्ट्रीय ख्यातीच्या जर्नल्समध्ये प्रकाशित केले गेले आहेत.
नमुना प्रकार | रक्कम | एकाग्रता(Qubit®) | खंड | पवित्रता | इतर |
जीनोमिक डीएनए | डेटा आवश्यकता अवलंबून | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5; 260 nm वर क्लिअर पीक , कोणतेही प्रदूषण नाही | एकाग्रता क्यूबिट आणि क्यूबिट/नॅनोपोर ≤ 2 द्वारे मोजली जाणे आवश्यक आहे |
एकूण आरएनए | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5;दूषित नाही | RIN मूल्य ≥7.5 |
डीएनए नमुन्याचे डेटा गुणवत्ता मूल्यांकन
तक्ता 1. स्वच्छ डेटावरील आकडेवारी.
BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | cleanN50Len | cleanN90Len | cleanMeanLen | क्लीनमॅक्सलेन | cleanMeanQual |
DNA_BMK01 | १,२१८,२३९ | २६.३७ | 1,121,736 | २५.९० | २८,०१४ | १५,७६४ | २३,०९० | १४३,१८१ | 9 |
आरएनए नमुन्याचे डेटा गुणवत्ता मूल्यांकन
तक्ता 1. स्वच्छ डेटावरील आकडेवारी.
फाईलचे नाव | ClientID | ReadNum | BaseNum | N50 | मीनलांबी | कमाल लांबी | मीनक्यूस्कोर |
RNA_BMK001 | C2 | ८,९४७,७०८ | ४,०४७,२३०,०८३ | ३९८ | ४५२ | १२९,२२७ | Q12 |
आकृती 1. लांबीचे वितरण वाचा
आकृती 2. स्वच्छ डेटाचे गुणवत्ता स्कोअर वितरण
आकृती 3. स्वच्छ डेटाची लांबी आणि गुणवत्ता स्कोअर वितरण