BMKCloud Log in
条形 बॅनर-03

उत्पादने

DNA/RNA सिक्वेन्सिंग -PacBio सिक्वेन्सर

PacBio सिक्वेन्सिंग प्लॅटफॉर्म हे दीर्घ-वाचनीय अनुक्रमणिका प्लॅटफॉर्म आहे, जे थर्ड-जनरेशन सिक्वेन्सिंग (TGS) तंत्रज्ञानांपैकी एक म्हणून देखील ओळखले जाते.कोर तंत्रज्ञान, सिंगल-मॉलिक्युल रिअल-टाइम(SMRT), दहापट किलो-बेस लांबीसह वाचनाच्या निर्मितीस सक्षम करते."सिक्वेंसिंग-बाय-सिंथेसिस" च्या आधारावर, शून्य-मोड वेव्हगाइड (ZMW) द्वारे सिंगल न्यूक्लियोटाइड रिझोल्यूशन प्राप्त केले जाते, जेथे फक्त तळाशी मर्यादित खंड (रेणू संश्लेषणाची जागा) प्रकाशित केली जाते.याव्यतिरिक्त, SMRT अनुक्रम NGS प्रणालीमध्ये अनुक्रम-विशिष्ट पूर्वाग्रह मोठ्या प्रमाणात टाळते, लायब्ररी बांधकाम प्रक्रियेत बहुतेक PCR प्रवर्धन चरणांची आवश्यकता नसते.

 

प्लॅटफॉर्म: सिक्वेल II, Revio


सेवा तपशील

डेमो परिणाम

वैशिष्ट्ये

PacBio sequencer वर दोन क्रमवारी मोड: सतत लाँग रीड (CLR) आणि सर्कुलर कन्सेन्सस रीड (CCS)

अनुक्रम मोड लायब्ररीचा आकार सैद्धांतिक डेटाउत्पन्न (प्रति सेल) सिंगल-बेसअचूकता अर्ज
CLR 20Kb, 30Kb, इ. 80 Gb ते 130 Gb अंदाजे८५% डी नोव्हो, SV कॉलिंग इ.
CCS 15-20 Kb

14 ते 40 Gb/सेल (सिक्वेल II)

70 ते 110 Gb/सेल (Revio)

नमुन्यांवर अवलंबून असते

अंदाजे९९% डी नोव्हो, SNP/Indel/SV कॉलिंग, Iso-Seq,

Revio आणि Sequel II च्या कामगिरीची आणि वैशिष्ट्यांची तुलना

अटी

सिक्वेल II प्रणाली

Revio प्रणाली

वाढवा

जास्त घनता

8 दशलक्ष ZMWs

25 दशलक्ष ZMW

3x

स्वतंत्र टप्पे

1

4

4x

धावण्याच्या कमी वेळा

30 तास

24 तास

1.25x

30X HiFi मानवी जीनोम / वर्ष

88

१,३००

1एकूण 5x

सेवा फायदे

● PacBio सिक्वेन्सिंग प्लॅटफॉर्मवर विविध प्रजातींसह हजारो बंद प्रकल्पांसह 8 वर्षांचा अनुभव.

● अद्ययावत PacBio सिक्वेन्सिंग प्लॅटफॉर्मसह पूर्णपणे सुसज्ज आहे, पुरेशा सिक्वेन्सिंग थ्रूपुटची हमी देण्यासाठी Revio.

● जलद टर्न-अराउंड वेळ, उच्च डेटा उत्पन्न आणि अधिक अचूक डेटा.

● शेकडो उच्च-प्रभाव PacBio-आधारित प्रकाशनांमध्ये योगदान दिले.

नमुना आवश्यकता


नमुना प्रकार रक्कम एकाग्रता (Qubit®) खंड पवित्रता इतर
जीनोमिक डीएनए डेटा आवश्यकता अवलंबून ≥50 ng/μl ≥15μl OD260/280=1.7-2.2;
OD260/230=1.8-2.5;
260 nm वर स्पष्ट शिखर,कोणतेही प्रदूषण नाही
एकाग्रता क्यूबिट आणि क्यूबिट/नॅनोपोर = ०.८-२.५ द्वारे मोजली जाणे आवश्यक आहे
एकूण आरएनए ≥1.2μg ≥120 ng/μl ≥15μl OD260/280=1.7-2.5;
OD260/230=0.5-2.5;कोणतेही प्रदूषण नाही

RIN मूल्य ≥7.5

5≥28S/18S≥1

 

सेवा कार्यप्रवाह

नमुना तयार करणे

नमुना तयार करणे

लायब्ररीची तयारी

ग्रंथालय बांधकाम

अनुक्रम

अनुक्रम

डेटा विश्लेषण

डेटा विश्लेषण

नमुना QC

प्रकल्प वितरण


  • मागील:
  • पुढे:

  • 1. घरातील डेटा उत्पन्न

    63 CCS पेशींमधून (26 प्रजातींमधून) डेटा व्युत्पन्न

    डेटा-PacBio-CCS-15 Kb सरासरी कमाल मि मध्यक
    उत्पन्न - सबरीड (Gb) ४२१.१२ ५४४.२७ 221.38 ४२६.५८
    Yiled - CCS(Gb) २५.९३ ३८.५९ १०.८६ २५.४३
    पॉलिमरेझ एन 50 १४५,६५१ १७५,४३० 118,118 १४४,६८९
    सबब्रेड N50 १७,५०९ २३,९२४ १२,४८५ १७,५८४
    CCS N50 १४,४९० १९,०३४ ९,८७६ १४,७४७
    सरासरी लांबी-पॉलिमरेझ ६७,९९५ ८९,३७९ ४९,६६४ ६६,४३३
    सरासरी लांबी-सबब्रेड्स १५,८६६ २१,०३६ 11,657 १६,०१२
    सरासरी लांबी-CCS १४,४८९ १९,०७४ ८,५७५ १४,६५५

    16 CLR पेशींमधून व्युत्पन्न केलेला डेटा (76 प्रजातींमधून)

    DATA-PacBio-CLR-30Kb सरासरी कमाल मि मध्यक
    उत्पन्न - सबरीड (Gb) 142.20 २९१.४० ५०.५५ १४२.४९
    पॉलिमरेझ एन 50 ३९,४५६ १२१,१९१ १५,३८९ 35,231
    सबब्रेड N50 २८,४९० ४१,०१२ १४,४३० २९,०६३
    सरासरी लांबी-पॉलिमरेझ २२,०६३ ४८,८८६ ८,७४७ २१,५५५
    सरासरी लांबी-सबब्रेड्स १७,७२० २७,२२५ ८,२९३ १७,७७९

    2. डेटा QC - डेमोडेटा उत्पन्नावरील आकडेवारी

    नमुना

    ccs वाचन संख्या

    एकूण सीसीएस बेस (बीपी)

    ccs रीड्स N50 (bp)

    ccs सरासरी लांबी (bp)

    ccs सर्वात लांब वाचन (bp)

    सबरीड बेस (bp)

    सीसीएस दर(%)

    PB_BMKxxx

    ३,४४४,१५९

    ५४,१६४,१२२,५८६

    १५,७२८

    १५,७२६

    36,110

    ८६३,३२६,३३०,४६५

    ६.२७

     

    एक कोट मिळवा

    तुमचा संदेश इथे लिहा आणि आम्हाला पाठवा

    तुमचा संदेश आम्हाला पाठवा: