circRNA अनुक्रम-इलुमिना
वैशिष्ट्ये
● rRNA क्षीणता त्यानंतर दिशात्मक लायब्ररी तयार करणे, स्ट्रँड-विशिष्ट डेटा अनुक्रमित करणे सक्षम करणे.
● जैव सूचनात्मक कार्यप्रवाह circRNA अंदाज आणि अभिव्यक्ती प्रमाणीकरण सक्षम करते
सेवा फायदे
●अधिक व्यापक आरएनए लायब्ररी:आम्ही आमच्या प्री-लायब्ररी तयारीमध्ये रेखीय RNA कमी होण्याऐवजी rRNA क्षीणता वापरतो, अनुक्रम डेटामध्ये केवळ circRNA नाही तर mRNA आणि lncRNA देखील समाविष्ट आहे याची खात्री करून, या डेटासेटवर संयुक्त विश्लेषण सक्षम करते.
●स्पर्धात्मक अंतर्जात RNA (ceRNA) नेटवर्कचे पर्यायी विश्लेषण: सेल्युलर नियामक यंत्रणेमध्ये सखोल अंतर्दृष्टी प्रदान करणे
●विस्तृत कौशल्य: BMK येथे 20,000 हून अधिक नमुन्यांची प्रक्रिया करण्याच्या ट्रॅक रेकॉर्डसह, विविध प्रकारचे नमुने आणि lncRNA प्रकल्प व्यापून, आमचा कार्यसंघ प्रत्येक प्रकल्पासाठी भरपूर अनुभव घेऊन येतो.
●कठोर गुणवत्ता नियंत्रण: आम्ही नमुना आणि लायब्ररीच्या तयारीपासून अनुक्रम आणि बायोइन्फॉरमॅटिक्सपर्यंत सर्व टप्प्यांवर कोर नियंत्रण बिंदू लागू करतो.हे सूक्ष्म निरीक्षण सातत्याने उच्च-गुणवत्तेचे परिणाम प्रदान करते.
● विक्रीनंतरचे समर्थन: आमची वचनबद्धता 3 महिन्यांच्या विक्री-पश्चात सेवा कालावधीसह प्रकल्प पूर्ण होण्यापलीकडे आहे.या वेळी, आम्ही परिणामांशी संबंधित कोणत्याही शंकांचे निराकरण करण्यासाठी प्रोजेक्ट फॉलो-अप, समस्यानिवारण सहाय्य आणि प्रश्नोत्तर सत्रे ऑफर करतो.
नमुना आवश्यकता आणि वितरण
| लायब्ररी | प्लॅटफॉर्म | शिफारस केलेला डेटा | डेटा QC |
| पॉली ए समृद्ध | Illumina PE150 | 16-20 Gb | Q30≥85% |
नमुना आवश्यकता:
न्यूक्लियोटाइड्स:
| Conc.(ng/μl) | रक्कम (μg) | पवित्रता | सचोटी |
| ≥ १०० | ≥ ०.५ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 जेलवर मर्यादित किंवा कोणतेही प्रथिने किंवा डीएनए दूषित नाही. | वनस्पतींसाठी: RIN≥6.5; प्राण्यांसाठी: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; मर्यादित किंवा बेसलाइन उंची नाही |
● वनस्पती:
रूट, स्टेम किंवा पाकळी: 450 मिग्रॅ
पाने किंवा बियाणे: 300 मिग्रॅ
फळ: 1.2 ग्रॅम
● प्राणी:
हृदय किंवा आतडे: 450 मिग्रॅ
व्हिसेरा किंवा मेंदू: 240 मिग्रॅ
स्नायू: 600 मिग्रॅ
हाडे, केस किंवा त्वचा: 1.5 ग्रॅम
● आर्थ्रोपॉड्स:
कीटक: 9 ग्रॅम
क्रस्टेसिया: 450 मिग्रॅ
● संपूर्ण रक्त:2 नळ्या
● पेशी: 106 पेशी
● सीरम आणि प्लाझ्मा: 6 मिली
शिफारस केलेले नमुना वितरण
कंटेनर: 2 मिली सेंट्रीफ्यूज ट्यूब (टिन फॉइलची शिफारस केलेली नाही)
नमुना लेबलिंग: गट+प्रतिकृती उदा. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
शिपमेंट:
1. कोरडा बर्फ: नमुने पिशव्यामध्ये पॅक करणे आणि कोरड्या बर्फात पुरणे आवश्यक आहे.
2. RNAstable tubes: RNA नमुने RNA स्थिरीकरण ट्यूब (उदा. RNAstable®) मध्ये वाळवले जाऊ शकतात आणि खोलीच्या तापमानात पाठवले जाऊ शकतात.
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिझाइन
नमुना वितरण
आरएनए काढणे
ग्रंथालय बांधकाम
अनुक्रम
डेटा विश्लेषण
विक्रीनंतर सेवा
बायोइन्फॉरमॅटिक्स
circRNA अंदाज: क्रोमोसोमल वितरण
विभेदितपणे व्यक्त केलेले circRNA - ज्वालामुखी प्लॉट
विभेदकपणे व्यक्त केलेले सर्कर्एनए - श्रेणीबद्ध क्लस्टरिंग
circRNA च्या यजमान जनुकांचे कार्यात्मक संवर्धन
प्रकाशनांच्या क्युरेट केलेल्या संग्रहाद्वारे BMKGene' circRNA सिक्वेन्सिंग सेवांद्वारे सुलभ संशोधन प्रगती एक्सप्लोर करा.
वांग, एक्स आणि इतर.(2021) 'CPSF4 हेपॅटोसेल्युलर कार्सिनोमामध्ये circRNA निर्मिती आणि मायक्रोआरएनए मध्यस्थ जीन सायलेन्सिंग नियंत्रित करते', ऑन्कोजीन 2021 40:25, 40(25), pp. 4338–4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
झिया, के. आणि इतर.(2023) 'X oo-रिस्पॉन्सिव्ह ट्रान्सक्रिप्टोमने भातामधील OsARAB च्या अभिव्यक्तीचे नियमन करून रोग प्रतिकारशक्तीमध्ये वर्तुळाकार RNA133 ची भूमिका प्रकट केली', फायटोपॅथॉलॉजी रिसर्च, 5(1), pp. 1-14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. et al.(2023) 'CPSF3 हेपॅटोसेल्युलर कार्सिनोमामध्ये गोलाकार आणि रेखीय प्रतिलेखांचे संतुलन सुधारते'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
झांग, वाय. वगैरे.(2023) 'यकृत प्रत्यारोपणाच्या आधी आणि नंतर सिरोटिक कार्डिओमायोपॅथीमध्ये circRNAs चे व्यापक मूल्यांकन', इंटरनॅशनल इम्युनोफार्माकोलॉजी, 114, p.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
