ज्ञात जीवाणू आणि बुरशीचे जीनोम पूर्ण करण्यासाठी, तसेच अनेक जीनोमची तुलना करण्यासाठी किंवा नवीन जीवांचे जीनोम मॅप करण्यासाठी बॅक्टेरिया आणि बुरशीजन्य संपूर्ण जीनोम री-सिक्वेंसिंग हे एक महत्त्वपूर्ण साधन आहे.अचूक संदर्भ जीनोम तयार करण्यासाठी, सूक्ष्मजीव ओळखण्यासाठी आणि इतर तुलनात्मक जीनोम अभ्यास करण्यासाठी जीवाणू आणि बुरशीचे संपूर्ण जीनोम अनुक्रमित करणे खूप महत्वाचे आहे.