-
Метатранскриптомын дараалал
Метатранскриптомын дараалал нь байгалийн орчинд (хөрс, ус, далай, ялгадас, гэдэс дотор) микробын генийн илэрхийлэлийг (эукариот ба прокариот аль аль нь) тодорхойлдог. Ялангуяа энэ үйлчилгээ нь нарийн төвөгтэй бичил биетний бүлгүүдийн генийн экспрессийн профайлыг бүхэлд нь авах, ангилал зүйн шинжилгээ хийх боломжийг олгодог. зүйлийн төрөл, өөр өөр илэрхийлэгддэг генийн функциональ баяжуулалтын шинжилгээ гэх мэт.
Платформ: Illumina NovaSeq платформ
-
Мөөгөнцрийн геном
Biomarker Technologies нь судалгааны тодорхой зорилгоос хамааран геномын судалгаа, нарийн геном, мөөгөнцрийн бүрэн гүйцэд геномоор хангадаг.Геномын дараалал, угсралт, функциональ тайлбарыг дараагийн үеийн дараалал + Гурав дахь үеийн дарааллыг хослуулснаар өндөр түвшний геномын угсралтад хүрэх боломжтой.Хромосомын түвшинд геномын угсралтыг хөнгөвчлөхийн тулд Hi-C технологийг бас ашиглаж болно.
Платформ:PacBio үргэлжлэл II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq платформ
-
Хэрэгслийн хэрэгсэл
BMKCloud нь анагаах ухаан, хөдөө аж ахуй, байгаль орчин гэх мэт төрөл бүрийн салбарын судлаачдын итгэлийг хүлээсэн геномын программыг нэг цэгийн шийдлээр хангадаг тэргүүлэх биоинформатик платформ юм. BMKCloud нь биоинформатик шинжилгээний платформ, багаж хэрэгсэл зэрэг нэгдсэн, найдвартай, үр ашигтай үйлчилгээ үзүүлэх үүрэгтэй. , тооцоолох нөөц, олон нийтийн мэдээллийн сан, биоинформатик онлайн курс гэх мэт. BMKCloud нь генийн тайлбар, хувьслын генетик хэрэгсэл, ncRNA, өгөгдлийн чанарын хяналт, угсралт, зэрэгцүүлэх, өгөгдөл олборлох, мутаци, статистик, зураг үүсгэгч, дараалал зэрэг олон төрлийн биоинформатик хэрэгслүүдтэй. шинжилгээ гэх мэт.
-
Бактерийн бүрэн геном
Biomarker Technologies нь тэг цоорхойтой бактерийн геномыг бүрэн бүтээх дарааллын үйлчилгээг үзүүлдэг.Бактерийн геномыг бүрэн бүрдүүлэх үндсэн ажлын урсгал нь судалгааны тодорхой зорилгыг хангасан гурав дахь үеийн дараалал, угсралт, функциональ тайлбар, дэвшилтэт биоинформатик шинжилгээг агуулдаг.Бактерийн геномын дэлгэрэнгүй мэдээлэл нь тэдний биологийн үйл явцын үндсэн механизмыг илрүүлэх боломжийг олгодог бөгөөд энэ нь дээд эукариот зүйлийн геномын судалгаанд үнэ цэнэтэй лавлагаа болж чадна.
Платформ:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq платформ
PacBio үргэлжлэл II
-
жижиг РНХ
Жижиг РНХ нь миРНХ, сиРНХ, пиРНХ зэрэг дунджаар 18-30 нт урттай богино кодчилдоггүй РНХ-ийн төрөл юм.Эдгээр жижиг РНХ нь мРНХ-ийн задрал, орчуулгыг дарангуйлах, гетерохроматин үүсэх гэх мэт янз бүрийн биологийн үйл явцад оролцдог гэж мэдээлсэн. SmallRNA дарааллын шинжилгээг амьтан/ургамлын хөгжил, өвчин, вирус гэх мэт судалгаанд өргөн ашигладаг. дарааллын шинжилгээний платформ нь стандарт шинжилгээ болон дэвшилтэт өгөгдөл олборлолтоос бүрдэнэ.РНХ-ийн өгөгдлийн үндсэн дээр стандарт шинжилгээ нь миРНХ-ийг тодорхойлох, урьдчилан таамаглах, миРНХ-ийн зорилтот генийг урьдчилан таамаглах, тэмдэглэгээ, экспрессийн шинжилгээ хийх боломжтой.Нарийвчилсан шинжилгээ нь тохируулсан миРНХ-ийн хайлт, олборлолт, Венн диаграм үүсгэх, миРНХ болон зорилтот генийн сүлжээг бий болгох боломжийг олгодог.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS нь Biomarker Technologies-ийн арвин туршлага дээр үндэслэн боловсруулсан геномын дахин дараалал тогтоох шинжилгээний платформ юм.Ашиглахад хялбар энэхүү платформ нь Illumina платформ болон BGI дарааллын платформоос үүсгэсэн ДНХ-ийн дарааллын өгөгдөлд тохирох цөөн хэдэн үндсэн параметрийг тохируулснаар нэгдсэн шинжилгээний ажлын урсгалыг хурдан гаргах боломжийг олгодог.Энэхүү платформ нь өндөр хүчин чадалтай тооцоолох сервер дээр байрлуулсан бөгөөд энэ нь маш хязгаарлагдмал хугацаанд өндөр үр ашигтай өгөгдөлд дүн шинжилгээ хийх боломжийг олгодог.Хувийн мэдээлэл олборлолтыг стандарт шинжилгээний үндсэн дээр хийх боломжтой, үүнд мутацилагдсан генийн хайлт, ПГУ-ын праймер дизайн гэх мэт.
-
мРНХ(Лавлагаа)
Транскриптом нь геномын генетик мэдээлэл ба биологийн үйл ажиллагааны протеомын хоорондох холбоос юм.Транскрипцийн түвшний зохицуулалт нь организмын зохицуулалтын хамгийн чухал бөгөөд хамгийн өргөн судлагдсан хэлбэр юм.Транскриптомын дараалал нь транскриптомын дарааллыг ямар ч үед, ямар ч нөхцөлд, нэг нуклеотид хүртэл нарийвчлалтай тогтоох боломжтой. Энэ нь генийн транскрипцийн түвшинг динамикаар тусгаж, ховор, хэвийн транскриптийг нэгэн зэрэг тодорхойлж, тоон үзүүлэлтийг гаргаж, бүтцийн мэдээллээр хангадаг. тусгай хуулбарын дээж.
Одоогийн байдлаар транскриптомын дараалал тогтоох технологийг мал, ургамлын хөгжлийг зохицуулах, хүрээлэн буй орчны дасан зохицох, дархлааны харилцан үйлчлэл, генийн нутагшуулах, төрөл зүйлийн генетик хувьсал, хавдар, удамшлын өвчнийг илрүүлэх зэрэг агрономи, анагаах ухаан болон бусад судалгааны салбарт өргөнөөр ашиглаж байна.
-
Метагеномик (NGS)
Энэхүү шинжилгээний платформ нь олон жилийн туршлага дээр үндэслэн бууны метагеномын өгөгдөлд дүн шинжилгээ хийхэд зориулагдсан болно.Энэ нь өгөгдөл боловсруулах, зүйлийн түвшний судалгаа, генийн функцын түвшний судалгаа, метагеномын шинжилгээ гэх мэт түгээмэл хэрэгцээтэй төрөл бүрийн метагеномикийн шинжилгээг агуулсан нэгдсэн ажлын урсгалаас бүрдэнэ. Үүнээс гадна, ген, зүйлийн асуулга зэрэг стандарт шинжилгээний ажлын урсгалын дагуу захиалгат өгөгдөл олборлох хэрэгслийг ашиглах боломжтой. , параметрийн тохиргоо, хувь хүний дүрс үүсгэх гэх мэт.
-
LncRNA
Урт кодчилдоггүй РНХ (lncRNA) нь уургийг кодлох чадваргүй, 200 нт-ээс урт урттай транскриптийн төрөл юм.Хуримтлагдсан нотолгоо нь ихэнх lncRNA-ууд ажиллах чадвартай байдаг.Өндөр хүчин чадалтай секвенцийн технологи, биоинформатик шинжилгээний хэрэгслүүд нь lncRNA-ийн дараалал, байршлын мэдээллийг илүү үр дүнтэй илрүүлэх боломжийг бидэнд олгож, зохицуулалтын чухал үүрэгтэй lncRNA-г илрүүлэхэд хүргэдэг.BMKCloud нь үйлчлүүлэгчдээ хурдан, найдвартай, уян хатан lncRNA шинжилгээнд хүрэхийн тулд lncRNA дарааллын шинжилгээний платформоор хангаж байгаадаа баяртай байна.
-
GWAS
Геномын өргөн хүрээний нийгэмлэгийн судалгаа (GWAS) нь тодорхой шинж чанартай (фенотип) холбоотой генетикийн хувилбаруудыг (генотип) тодорхойлох зорилготой.GWA судалгаа нь олон тооны хүмүүсийн геномын бүхэл бүтэн геномоор дамждаг генетик маркеруудыг судалж, популяцийн түвшинд статистик дүн шинжилгээ хийх замаар генотип-фенотипийн холбоог урьдчилан таамагладаг.Бүтэн геномын дараалал нь бүх генетикийн хувилбаруудыг илрүүлэх боломжтой.Фенотипийн өгөгдөлтэй хослуулан GWAS-ийг фенотиптэй холбоотой SNP, QTL болон нэр дэвшигч генийг тодорхойлохын тулд боловсруулж болох бөгөөд энэ нь орчин үеийн амьтан/ургамлын үржлийг хүчтэй дэмждэг.SLAF бол геномын хэмжээнд тархсан маркер болох SNP-ийг илрүүлдэг өөрөө боловсруулсан хялбаршуулсан геномын дарааллын стратеги юм.Эдгээр SNP-ийг молекул генетикийн маркер болгон зорилтот шинж чанаруудтай холбоо тогтоох судалгаанд боловсруулж болно.Энэ нь нарийн төвөгтэй шинж чанаруудтай холбоотой генетикийн өөрчлөлтийг тодорхойлох зардал багатай стратеги юм.
-
Nanopore Бүрэн хэмжээний транскриптомик
Организм дахь цогц ба хувьсах өөр изоформууд нь генийн илэрхийлэл, уургийн олон янз байдлыг зохицуулах генетикийн чухал механизм юм.Транскриптийн бүтцийг нарийн тодорхойлох нь генийн илэрхийллийн зохицуулалтын хэв маягийг гүнзгий судлах үндэс суурь болдог.Нанопорын дарааллын платформ нь транскриптомийн судалгааг изоформын түвшинд амжилттай хүргэсэн.Энэхүү шинжилгээний платформ нь Nanopore платформ дээр үүсгэгдсэн RNA-Seq өгөгдлийг лавлагаа геномын үндсэн дээр шинжлэхэд зориулагдсан бөгөөд энэ нь генийн түвшин болон транскриптийн түвшинд чанарын болон тоон шинжилгээг хийдэг.
-
тойрог-РНХ
Дугуй РНХ(circRNA) нь кодчилдоггүй РНХ-ийн нэг төрөл бөгөөд сүүлийн үед хөгжиж, хүрээлэн буй орчны эсэргүүцэл зэрэгт оролцдог зохицуулалтын сүлжээнд чухал үүрэг гүйцэтгэдэг нь тогтоогдсон. Шугаман РНХ молекулуудаас ялгаатай, жишээ нь mRNA, lncRNA, 3′ ба 5′ ЦиркРНХ-ийн төгсгөлүүд хоорондоо нийлж дугуй хэлбэртэй бүтэц үүсгэдэг бөгөөд энэ нь тэдгээрийг экзонуклеазын задралаас хамгаалдаг бөгөөд ихэнх шугаман РНХ-ээс илүү тогтвортой байдаг.ЦиркРНХ нь генийн илэрхийлэлийг зохицуулах олон төрлийн үүрэг гүйцэтгэдэг болохыг тогтоожээ.ЦиркРНХ нь миРНХ хөвөн гэгддэг миРНХ-г өрсөлдөх чадвартай холбодог ceRNA-ийн үүргийг гүйцэтгэж чаддаг.CircRNA дарааллын шинжилгээний платформ нь circRNA бүтэц, илэрхийллийн шинжилгээ, зорилтот таамаглал, бусад төрлийн РНХ молекулуудтай хамтарсан шинжилгээ хийх боломжийг олгодог.
