-
Метагеномик дараалал -NGS
Метагеном гэдэг нь хүрээлэн буй орчны метагеном, хүний метагеном гэх мэт холимог организмын нийт генетикийн материалын цуглуулгыг хэлнэ. Энэ нь тариалж болох ба тариалах боломжгүй бичил биетний геномыг агуулдаг.Метагеномик дараалал нь хүрээлэн буй орчны дээжээс гаргаж авсан холимог геномын материалыг шинжлэхэд ашигладаг молекулын хэрэгсэл бөгөөд зүйлийн олон талт байдал, элбэгшил, популяцийн бүтэц, филогенетик харилцаа, функциональ ген, хүрээлэн буй орчны хүчин зүйлстэй корреляцийн сүлжээний талаар дэлгэрэнгүй мэдээлэл өгдөг.
Платформ:Illumina NovaSeq платформ
-
Метагеномик дараалал-нанопора
Метагеномикс нь хүрээлэн буй орчны дээжээс гаргаж авсан холимог геномын материалыг шинжлэхэд ашигладаг молекулын хэрэгсэл бөгөөд зүйлийн олон янз байдал, элбэг дэлбэг байдал, популяцийн бүтэц, филогенетик харилцаа, функциональ ген болон хүрээлэн буй орчны хүчин зүйлстэй харилцах сүлжээ гэх мэт дэлгэрэнгүй мэдээллийг өгдөг. Нанопорын дараалал тогтоох платформууд саяхан нэвтрүүлсэн. метагеномын судалгаанд.Унших уртын хувьд түүний гайхалтай гүйцэтгэл нь метагеномын шинжилгээ, ялангуяа метагеномын угсралтыг ихээхэн сайжруулсан.Унших уртын давуу талыг ашиглан Нанопород суурилсан метагеномын судалгаа нь бууны метагеномиктой харьцуулахад илүү тасралтгүй угсрах боломжтой юм.Нанопород суурилсан метагеномик нь микробиомоос бүрэн, хаалттай бактерийн геномыг амжилттай үүсгэсэн гэж нийтлэгдсэн (Moss, EL, et. al.,Байгалийн биотехнологи, 2020)
Платформ:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S ба 18S рРНХ-ийн өндөр хадгалалттай болон хэт хувьсах бүс нутгийг агуулсан дэд нэгж нь прокариот ба эукариот организмыг тодорхойлох төгс молекул хурууны хээ юм.Дарааллын давуу талыг ашиглан эдгээр ампликонуудыг хадгалсан хэсгүүдэд тулгуурлан чиглүүлж, хэт хувьсах бүс нутгийг бичил биетний олон янз байдлын шинжилгээ, ангилал зүй, филогени гэх мэт судалгаанд хувь нэмрээ оруулан бичил биетнийг таних зорилгоор бүрэн тодорхойлж болно. Нэг молекулын бодит цагийн (SMRT) ) PacBio платформын дараалал нь бүрэн хэмжээний ампликонуудыг (ойролцоогоор 1.5 Kb) хамрах өндөр нарийвчлалтай урт унших боломжийг олгодог.Генетикийн талбайг өргөнөөр харах нь бактери, мөөгөнцөрийн бүлгүүдийн зүйлийн тэмдэглэгээний нарийвчлалыг ихээхэн сайжруулсан.
Платформ:PacBio үргэлжлэл II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS ампликоны дараалал нь хоорондоо харилцан уялдаатай болон хэт хувьсах чадвартай хэсгүүдийг агуулсан гэр ахуйн генетикийн маркеруудын ПГУ-ын бүтээгдэхүүнийг судлах замаар бичил биетний бүлэгт филогени, ангилал зүй, зүйлийн элбэг дэлбэг байдлыг илрүүлэх зорилготой.Woeses нар (1977) эдгээр төгс молекул хурууны хээг нэвтрүүлсэн нь микробиомыг тусгаарлахгүйгээр профайлыг бий болгох боломжийг олгодог.16S (бактери), 18S (мөөгөнцөр) болон дотоод транскрипт зайлагч (ITS, мөөгөнцөр)-ийн дараалал нь элбэг, ховор, тодорхойгүй зүйлүүдийг хоёуланг нь тодорхойлох боломжийг олгодог.Энэхүү технологи нь хүний ам, гэдэс, ялгадас гэх мэт янз бүрийн орчинд микробын ялгавартай найрлагыг тодорхойлоход өргөн хэрэглэгдэж, гол хэрэгсэл болж байна.
Платформ:Illumina NovaSeq платформ
-
Бактери ба мөөгөнцрийн бүхэл геномын дараалал
Бактерийн болон мөөгөнцрийн бүхэл геномын дарааллыг тогтоох нь мэдэгдэж буй бактери, мөөгөнцрийн геномыг гүйцээх, мөн олон геномыг харьцуулах эсвэл шинэ организмын геномын зураглал хийх чухал хэрэгсэл юм.Нарийн лавлагаа геном гаргах, бичил биетнийг тодорхойлох болон бусад харьцуулсан геномын судалгааг хийхийн тулд нян, мөөгөнцөрийн геномыг бүхэлд нь дараалалд оруулах нь маш чухал юм.
Платформ: Illumina NovaSeq платформ
-
Метатранскриптомын дараалал
Метатранскриптомын дараалал нь байгалийн орчинд (хөрс, ус, далай, ялгадас, гэдэс дотор) микробын генийн илэрхийлэлийг (эукариот ба прокариот аль аль нь) тодорхойлдог. Ялангуяа энэ үйлчилгээ нь нарийн төвөгтэй бичил биетний бүлгүүдийн генийн экспрессийн профайлыг бүхэлд нь авах, ангилал зүйн шинжилгээ хийх боломжийг олгодог. зүйлийн төрөл, өөр өөр илэрхийлэгддэг генийн функциональ баяжуулалтын шинжилгээ гэх мэт.
Платформ: Illumina NovaSeq платформ
-
Мөөгөнцрийн геном
Biomarker Technologies нь судалгааны тодорхой зорилгоос хамааран геномын судалгаа, нарийн геном, мөөгөнцрийн бүрэн гүйцэд геномоор хангадаг.Геномын дараалал, угсралт, функциональ тайлбарыг дараагийн үеийн дараалал + Гурав дахь үеийн дарааллыг хослуулснаар өндөр түвшний геномын угсралтад хүрэх боломжтой.Хромосомын түвшинд геномын угсралтыг хөнгөвчлөхийн тулд Hi-C технологийг бас ашиглаж болно.
Платформ:PacBio үргэлжлэл II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq платформ
-
Бактерийн бүрэн геном
Biomarker Technologies нь тэг цоорхойтой бактерийн геномыг бүрэн бүтээх дарааллын үйлчилгээг үзүүлдэг.Бактерийн геномыг бүрэн бүрдүүлэх үндсэн ажлын урсгал нь судалгааны тодорхой зорилгыг хангасан гурав дахь үеийн дараалал, угсралт, функциональ тайлбар, дэвшилтэт биоинформатик шинжилгээг агуулдаг.Бактерийн геномын дэлгэрэнгүй мэдээлэл нь тэдний биологийн үйл явцын үндсэн механизмыг илрүүлэх боломжийг олгодог бөгөөд энэ нь дээд эукариот зүйлийн геномын судалгаанд үнэ цэнэтэй лавлагаа болж чадна.
Платформ:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq платформ
PacBio үргэлжлэл II
