-
Хроматин дархлалын тунадасжилтын дараалал (ChIP-seq)
ChIP-Seq нь гистоны өөрчлөлт, транскрипцийн хүчин зүйлс болон ДНХ-тэй холбоотой бусад уургийн ДНХ-ийн зорилтот геномын өргөн хүрээг хамарсан профайлыг өгдөг.Энэ нь тодорхой уураг-ДНХ-ийн цогцолборыг сэргээхэд хроматин дархлалын хур тунадасны (ChIP) сонгомол чанарыг нэгтгэж, сэргээгдсэн ДНХ-ийн өндөр үр дүнтэй дараалал тогтоох дараагийн үеийн дарааллын (NGS) хүчин чадалтай.Нэмж дурдахад, уураг-ДНХ-ийн цогцолборууд нь амьд эсээс сэргээгддэг тул холбогдох газруудыг өөр өөр эсийн төрөл, эд эс эсвэл өөр өөр нөхцөлд харьцуулж болно.Програмууд нь транскрипцийн зохицуулалтаас эхлээд хөгжлийн зам, өвчний механизм, цаашлаад олон янз байдаг.
Платформ: Illumina NovaSeq платформ
-
Бүтэн геномын бисульфитын дараалал
Цитозины (5-mC) тав дахь байрлал дахь ДНХ-ийн метилизаци нь генийн илэрхийлэл, эсийн идэвхжилд үндсэн нөлөө үзүүлдэг.Хэвийн бус метиляци нь хорт хавдар гэх мэт хэд хэдэн нөхцөл, өвчинтэй холбоотой байдаг.WGBS нь нэг суурь нарийвчлалтайгаар геномын хэмжээнд метилжилтийг судлах алтан стандарт болсон.
Платформ: Illumina NovaSeq платформ
-
Өндөр дамжуулалтын дараалал бүхий Транспозазын хүртээмжтэй хроматины шинжилгээ (ATAC-seq)
ATAC-seq нь генийн илэрхийлэлд дэлхий даяар эпигенетик хяналт тавихад чухал ач холбогдолтой геномын өргөн хроматин хүртээмжийг шинжлэх өндөр үр дүнтэй дарааллын арга юм.Нээлттэй хроматин бүсүүдэд дарааллын адаптеруудыг гиперактив Tn5 транспозазын тусламжтайгаар оруулдаг.ПГУ-ын олшруулсны дараа дарааллын номын сан байгуулна.Бүх нээлттэй хроматин бүсүүдийг зөвхөн транскрипцийн хүчин зүйл, эсвэл тодорхой гистоныг өөрчилсөн бүс нутгийг холбох газруудаар хязгаарлагдахгүй, тодорхой орон зай-цаг хугацааны нөхцөлд олж авч болно.
-
Багасгасан төлөөллийн бисульфит дараалал (RRBS)
ДНХ-ийн метиляцийн судалгаа нь өвчний судалгааны хамгийн чухал сэдэв байсаар ирсэн бөгөөд генийн илэрхийлэл, фенотипийн шинж чанаруудтай нягт холбоотой байдаг.RRBS нь ДНХ-ийн метиляцийн судалгааны үнэн зөв, үр ашигтай, хэмнэлттэй арга юм.Промотор болон CpG арлын бүс нутгийг ферментийн задралаар (Msp I) баяжуулж, бисульфитын дараалалтай хослуулснаар ДНХ-ийн метилжилтийг өндөр нарийвчлалтай илрүүлдэг.
Платформ: Illumina NovaSeq платформ
