Дулааны зураг
Матрицын өгөгдлийн файлыг дулааны зураг зурахад ашигладаг бөгөөд энэ нь матрицын өгөгдлийг шүүх, хэвийн болгох, кластер хийх боломжтой.Энэ нь ихэвчлэн янз бүрийн дээжийн хоорондох генийн илэрхийллийн түвшинг кластер шинжилгээнд ашигладаг.
Генийн тайлбар
Генийн функцийн тайлбарыг FASTA файл дахь дарааллыг янз бүрийн мэдээллийн сантай харьцуулах замаар гүйцэтгэдэг.
Генийн тайлбар
Орон нутгийн зэрэгцүүлэх үндсэн хайлтын хэрэгсэл
CDS_UTR_Таамаглал
Энэ хэрэгсэл нь мэдэгдэж буй уургийн мэдээллийн бааз болон ORF таамаглалд тулгуурлан өгөгдсөн хуулбарын дарааллаар кодлох бүс (CDS) болон кодлогдоогүй бүс нутгийг (UTR) таамаглахад зориулагдсан.
Манхэттэний хуйвалдаан
Manhattan plot нь өгөгдлийг олон тооны өгөгдлийн цэгүүдээр харуулах боломжийг олгодог.Энэ нь ихэвчлэн геномын холбоо судалгаанд (GWAS) ашиглагддаг.
Цирко
CIRCOS диаграм нь геном дээрх SNP, InDeL, SV, CNV тархалтыг шууд харуулах боломжийг олгодог.
GO_Баяжилт
TopGO нь функцийг баяжуулахад зориулагдсан хэрэгсэл юм.TopGO-Bioconductor багц нь дифференциал илэрхийллийн шинжилгээ, GO баяжуулалтын шинжилгээ, үр дүнгийн дүрслэлээс бүрдэнэ.Энэ нь topGO_BP, topGO_CC болон topGO_MF-ийн үр дүнг агуулсан "График" нэртэй хавтас үүсгэх болно.
WGCNA
WGCNA нь генийн хамтын илэрхийлэлийн модулиудыг илрүүлэхэд өргөн хэрэглэгддэг өгөгдөл олборлох арга юм.Энэ нь дараагийн үеийн дараалалаас үүссэн микромассив өгөгдөл болон генийн илэрхийллийн өгөгдөл зэрэг янз бүрийн илэрхийллийн өгөгдлийн багцад хамаарна.
InterProScan
InterPro уургийн дарааллын шинжилгээ ба ангилал
GO_KEGG_Баяжилт
Энэхүү хэрэгсэл нь өгөгдсөн генийн багц болон холбогдох тайлбар дээр үндэслэн GO баяжуулалтын гистограмм, KEGG баяжуулалтын гистограмм болон KEGG баяжуулалтын замыг үүсгэх загвар юм.