МИКРОБ
Бионүүрсээр нянгийн нийцтэй байдал, хөдөлгөөнгүй байдал нь тебуконазолын задрал, хөрсний бичил биетний бүтэц, үйл ажиллагааг сайжруулсан.
Бүрэн хэмжээний 16S ампликоны дараалал |PacBio HiFi |Альфа олон янз байдал |Бета олон талт байдал
Энэхүү судалгаанд PacBio-ийн бүрэн хэмжээний 16S ампликоны дараалал, биоинформатик шинжилгээг Biomarker Technologies хийсэн.
Онцлох үйл явдал
Бионүүрсний хөдөлгөөнгүй тебуконазол задалдаг бактери Alcaligenes faecalis WZ-2 нь чөлөөт задралын омог WZ-2-тэй харьцуулахад тебуконазолоор бохирдсон хөрсөн дэх био задралын үр ашиг, нөлөөллийн талаар судалсан.
1. Бионүүрсээр хөдөлгөөнгүйжүүлсэн WZ-2 нь хөрсөн дэх тебуконазолын хагас задралын хугацааг 18.7 хоногоос 13.3 хоног болгон бууруулснаар чөлөөт WZ-2-тэй харьцуулахад тебуконазол илүү үр дүнтэй задралд өртдөг.
2. Бионүүрсээр идэвхгүйжүүлсэн WZ-2 нь уреаза, дегидрогеназа, инвертаза гэх мэт хөрсний уугуул бичил биетний ферментийн үйл ажиллагааг сэргээж чадсан.
3. Бионүүрсээр хөдөлгөөнгүй WZ-2 боловсруулсан хөрсөн дэх бичил биетний дүр төрх нь 16S-ийн бүрэн хэмжээний дараалалаар тогтоогдсон нь энэ систем нь тебуконазолын бохирдлын дор бактерийн бүлгүүдийн бүтцийг сайжруулснаар хөрсний эрүүл мэндийг сэргээж чадна гэдгийг баттай нотолж байна.
Туршилт (дараалалтай холбоотой)
Бүлэглэл: CK: Байгалийн хөрс;Т: Тебуконазолоор баяжуулсан хөрс;S: Тебуконазол нь WZ-2 чөлөөт омог агуулсан хөрс;МЭӨ: Тебуконазол агуулсан био нүүрс бүхий хөрс;BCS: Тебуконазол нь бионүүрсгүй WZ-2 бүхий хөрс агуулсан.
Дээж авах: 16S rDNA праймераар олшруулсан нийт хөрсний ДНХ-ийн олборлолт
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) ба 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),бүрэн хэмжээний 16S рДНХ-ийг төлөөлдөг
Дараалсан платформ: PacBio RS II
Дарааллын стратеги: CCS HIFI уншдаг
Мэдээллийн дүн шинжилгээ хийх:BMKCloudБиоинформатик платформ нь алтан загасыг загасны физиологи, хувьслын хувьд маш сайн генетикийн загвар систем болгодог.
Үр дүн
Хөрсний бичил биетний нийгэмлэгийн бүтцийг 16S rDNA дараалалаар тодорхойлсон.Систем бүрийн төрөл зүйлийн олон янз байдлыг илрүүлэхийн тулд Chao1, Ace, Shannon, Simpson зэрэг OTU-ийн баялаг, альфа олон янз байдлын индексийг үнэлэв.60 хоногийн инкубацийн дараа бүх индексүүд ижил төстэй хандлагыг харуулсан, өөрөөр хэлбэл тебуконазол нь хөрсний зүйлийн баялаг, олон янз байдлыг бууруулахад хүргэж болзошгүй юм.Гэсэн хэдий ч WZ-2 омгийг нэмснээр хөрсний бактерийн бүлгийг баялаг, олон янз байдлын хувьд хэсэгчлэн сэргээсэн.BC, BCS болон CK-ийн хооронд хязгаарлагдмал ялгаа ажиглагдсан нь био нүүрс болон био нүүрсээр хөдөлгөөнгүйжүүлсэн WZ-2 нь хөрсний биологийн эрүүл мэндийг үр дүнтэй сэргээж чадна гэдгийг харуулж байна.
Бүлэг хоорондын бета олон янз байдлыг харуулахын тулд энэ судалгаанд арифметик дундаж бүхий жингүй хос бүлгийн аргыг (UPGMA) ашигласан.Дараах зурагт үзүүлснээр, BC, BSC, CK нь T ба S бүлгийнхтэй харьцуулахад бичил биетний найрлагын илүү төстэй хэв шинжийг хуваалцсан бөгөөд энэ нь тебуконазолоор бохирдсон хөрсний био нөхөн сэргээлтэд био нүүрс нэвтрүүлэх нь хөрсөн дэх бичил биетний нэгдлийг нөхөн сэргээхэд ихээхэн хувь нэмэр оруулдаг болохыг харуулж байна.
Зураг.Янз бүрийн эмчилгээний дор бүлгийн түвшинд бактерийн нийгэмлэгийн UPGMA кластер
Лавлагаа
Sun, Tong, et al."Бионүүрсээр бактерийн нийцтэй байдал, хөдөлгөөнгүй байдал нь тебуконазолын задрал, хөрсний микробиомын бүтэц, үйл ажиллагааг сайжруулсан."Аюултай материалын сэтгүүл398 (2020): 122941.
Мэдээ, онцлох үйл явдал Хамгийн сүүлийн үеийн амжилттай тохиолдлуудыг Biomarker Technologies-тэй хуваалцах, шинжлэх ухааны шинэ ололт амжилт, судалгааны явцад ашигласан онцлох арга техникийг олж авах зорилготой.
Шуудангийн цаг: 2022-01-08