ГЕНОМЫН ХУВЬСАЛ
байгаль
ХАРИЛЦАА
Геномын дараалал нь дэлхийн тархалтын замыг илрүүлж, далайн морины хувьсал дахь нэгдмэл генетикийн дасан зохицохыг санал болгож байна.
PacBio |Иллумина |Hi-C |WGS |Генетикийн олон янз байдал |Хүн ам зүйн түүх |Генийн урсгал
Pacbio дараалал, геном де ново угсралт, тэмдэглэгээний үйлчилгээг Biomarker Technologies компани хангасан.
Онцлох үйл явдал
1.Хромосомын түвшний өндөр чанарын далайн морины (Hippocampus erectus) геномыг N50 contig-тай 15.5 Mb авсан.
2.Дэлхий даяарх 21 төрлийн далайн морины 358 геномын дарааллыг өөрчилсөн.
3. Олигоцений сүүл үед үүссэн далайн морьд болон дэлхийн эргэн тойронд колоничлох замуудыг тодорхойлж, далайн урсгал болон далайн палео цаг хугацааны нээлхийн өөрчлөлтийн динамиктай холбосон.
4. Дахин давтагдах "ясны нуруу" дасан зохицох фенотипийн генетик үндэс нь хөгжлийн гол генийн бие даасан орлуулалттай холбоотой.
5. Далайн урсгалаар гулгах нь муу тархалтыг нөхөж, хурдан дасан зохицох нь шинэ амьдрах орчныг колоничлоход тусалдаг.
Амжилтууд
Зураг 1 Далайн морины 358 сорьцын генетикийн олон янз байдал ба филогенетик харилцаа
а22 хромосом дахь 21 төрлийн далайн морины нуклеотидын олон янз байдлын (π) загвар бүхий дээж авсан далайн морины газарзүйн түүвэрлэлтийн байршил.b 358 далайн морины геномын SNP-ээр барьсан хөрш зэргэлдээх мод.(a) дахь байршлын зүү тэмдэг болон (b) дахь салбар дэвсгэрийн тэмдэг нь хоорондоо тохирч байна.
Зураг 2 Далайн морины колоничлол ба хүн ам зүйн түүх
аДалайн адууны 21 зүйлийн филогенетик мод ба ялгарах цаг хугацааны тооцоо.Салбарын шугамын зузаан нь популяцийн хэмжээний тооцоололд (Ne) тохирч байгаа бөгөөд өнгө нь өөр өөр удам угсааг илэрхийлдэг.I-III тэмдэгтүүд нь тохируулгын цэгүүдийг заана.b–d Далайн морины колоничлолын урьдчилан таамагласан замууд (өнгөт сумууд) нь ялгарах хугацаа, тархалт, харилцан үйлчлэл, далайн урсгал (цагаан сум) дээр үндэслэсэн.b Далайн адуу 18-23 сая жилийн хугацаанд төрөлжиж, дэлхий даяар тархахаас өмнө Энэтхэг-Австралийн Архипелаг нь Гиппокамп овгийн гарал үүслийн төв (улаан тэмдэглэгээ) байсан.c Далайн адуунууд анх Тетианы нээлхий тэнгисээр дамжин Атлантын далайг колоничилж байсан бөгөөд энэ нь хаагдсаны дараа (7-13 сая жилийн эцсийн үйл явдал) энэ Тетианы удмыг Энэтхэгийн далай дахь эгч дүүсийн удам угсаагаас тусгаарлав.Сүүлд нь Арабын тэнгист хурдан төрөлжсөн (шар тэмдэглэгээ) нь далайн адууг төрөлжүүлэх хоёр дахь төвийг байгуулжээ.г Атлантын далайд далайн морины колоничлолын хоёр дахь үйл явдал Энэтхэгийн далайгаас Өмнөд Африкийн үзүүрийг дайран 5 сая орчим жил болж, эцэст нь нээлттэй Панамын тэнгисээр дамжин Зүүн Номхон далайд ойролцоогоор 3.6 сая орчим жил хүрчээ.
Зураг 3 Генийн урсгал ба үр дүнтэй популяцийн хэмжээний хэлбэлзэл
аӨмнөд Атлантын далайд амьдардаг зүйлүүдийн хооронд генийн урсгал илэрсэн.Генийн урсгалыг G-PhoCS-аас гаргасан шилжилт хөдөлгөөний хурдаар цагаан шугамын ойролцоо харуулав.Сумны зузаан ба чиглэл нь генийн урсгалын хурд, чиглэлтэй тохирч байна.b PSMC-ийн үр дүнтэй популяцийн тооны хэлбэлзэл.X тэнхлэг нь одоогоос өмнөх жилүүдийн хугацааг, у тэнхлэг нь хүн амын үр дүнтэй тоог илэрхийлдэг.Графикуудыг голчлон газарзүйн тархалтын дагуу янз бүрийн тархацтай зүйл бүрийн дагуу зохион байгуулдаг.c Сүүлийн 1 сая жилийн далайн түвшний өөрчлөлт метр33.Шар зураас нь дэлхийн хамгийн сүүлийн мөстлөг хоорондын оргилыг, харин хөх өнгийн сүүдэр нь мөстлөгийн хамгийн сүүлийн үеийг заана.
Зураг 4 Сээр нурууны хувьсал.
аЗүүн талд, далайн морины нурууны бие даасан хувьслыг харуулсан зүйлийн мод.Салбарын урт нь сайт бүрт орлуулах тоог заана.Дөрвөн төрлийн нугастай далайн морийг цэнхэр өнгөөр тодруулсан.Зузаан мөчрүүд нь bmp3 генийн синонимоос ижил утгатай орлуулалтын (dN/dS) өндөр хувьтай тохирч байна.bmp3 генийн каноник болон ерөнхийлсан McDonald and Kreitman тестийг (MKT) арын өнгөн өнгөөр тодруулсан ялгаатай нугастай ба сээр нуруугүй шинж чанартай гурван хос эгч төрөл зүйлд хийсэн бөгөөд тэдгээрийн ач холбогдлын түвшинг цэнхэр, улаан фонтоор p утгаар тус тус тэмдэглэв.Баруун талд, bmp3 уураг дахь амин хүчлийн орлуулалт, нугастай далайн морины полиморф ба тогтмол орлуулалтын харьцуулалтыг улаан, цэнхэр дугуйлангаар тус тусад нь харуулсан.b Нугастай далайн адуунд dN/dS утгын bmp3 дахь тархалт нь нуруулаг бус зүйлтэй харьцуулахад.c bmp3-ээр кодлогдсон уургийн хувьд сэргээн босгосон филогенетик модны бие даасан хувьсал.d Hippocampus erectus дахь bmp3-ийг бүхэлд нь суурилуулах газар дээр нь эрлийзжүүлэх.
Лавлагаа
Li C нар.Геномын дараалал нь дэлхийн тархалтын замыг илрүүлж, далайн морины хувьсал дахь нэгдмэл генетикийн дасан зохицож байгааг харуулж байна.Нат Коммун.2021 оны хоёрдугаар сарын 17;12(1):1094.
Мэдээ, онцлох үйл явдал Хамгийн сүүлийн үеийн амжилттай тохиолдлуудыг Biomarker Technologies-тэй хуваалцах, шинжлэх ухааны шинэ ололт амжилт, судалгааны явцад ашигласан онцлох арга техникийг олж авах зорилготой.
Шуудангийн цаг: 2022-01-06