ГЕНОМ
Хромосомын хэмжээний цуглуулга, биомассын ургац Miscanthus lutarioriparius геномын шинжилгээ
Нано нүх сүвний дараалал |Иллумина |Hi-C |РНХ дараалал |Филогенез
Энэхүү судалгаанд Biomarker Technologies нь нанопорын дараалал, шинэ геномын угсралт, Hi-C-ийн тусламжтай угсралт гэх мэт техникийн дэмжлэг үзүүлсэн.
Хийсвэр
Мискантус, үндэслэг иштэй олон наст ургамал нь өндөр биомасс, стресс тэсвэрлэх чадвараараа биоэнерги үйлдвэрлэх асар их нөөцтэй.Бид хромосомын хэмжээний цугларалтыг мэдээлдэгMiscanthus lutarioripariusОксфордын Nanopore дараалал болон Hi-C технологийг хослуулснаар геном.2.07 Гб багтаамжтай угсралт нь геномын 96.64%-ийг хамардаг ба N50-ийн хэмжээ 1.71 Mb байна.Центромер ба теломерын дарааллыг бүх 19 хромосом, 10-р хромосомын хувьд тус тус цуглуулдаг.M. lutarioriparius-ийн аллотетраплоид гарал үүслийг центромерийн хиймэл дагуулын давталтуудыг ашиглан баталгаажуулдаг.Тетраплоид геномын бүтэц, сорготой харьцуулахад хэд хэдэн хромосомын өөрчлөлтүүд тодорхой харагдаж байна.Тандем давхардсан генүүдM. lutarioripariusЭдгээр нь зөвхөн стрессийн хариу урвалаас гадна эсийн хананы биосинтезийн үйл ажиллагаатай холбоотой юм.Өвчний эсэргүүцэл, эсийн хананы биосинтез, металлын ионы тээвэрлэлттэй холбоотой генийн гэр бүлүүд ихээхэн өргөжиж, хөгжиж байна.Эдгээр гэр бүлийн өргөтгөл нь гайхалтай шинж чанарыг сайжруулахад чухал геномын үндэс суурь болж магадгүй юмM. lutarioriparius.
Геномын угсралтын гол статистик
Зураг.M. lutarioriparius геномын чуулганы тойм
Мэдээ, онцлох үйл явдал Хамгийн сүүлийн үеийн амжилттай тохиолдлуудыг Biomarker Technologies-тэй хуваалцах, шинжлэх ухааны шинэ ололт амжилт, судалгааны явцад ашигласан онцлох арга техникийг олж авах зорилготой.
Шуудангийн цаг: 2022-01-05