-
Ургамал/Амьтны De novo геномын дараалал
De novoдараалал гэдэг нь лавлагаа геном байхгүй үед PacBio, Nanopore, NGS гэх мэт дараалал тогтоох технологийг ашиглан зүйлийн бүх геномыг бүтээхийг хэлнэ.Гурав дахь үеийн дарааллын технологийн унших уртын гайхалтай сайжруулалт нь өндөр гетерозигот, давтагдах бүсүүдийн өндөр харьцаа, полиплоид гэх мэт нарийн төвөгтэй геномуудыг нэгтгэх шинэ боломжийг авчирсан. Унших урт нь хэдэн арван килобазын түвшинд байдаг тул эдгээр дарааллын уншилтууд нь давтагдах элементүүд, хэвийн бус GC агууламжтай бүсүүд болон бусад нарийн төвөгтэй бүс нутгуудыг шийдвэрлэх.
Платформ: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq6000
-
Hi-C дээр суурилсан Геномын Ассемблей
Hi-C нь ойрын зайд суурилсан харилцан үйлчлэл болон өндөр дамжуулалтын дарааллыг хослуулан хромосомын тохиргоог авах зорилготой арга юм.Эдгээр харилцан үйлчлэлийн эрч хүч нь хромосом дахь физик зайтай сөргөөр хамааралтай гэж үздэг.Тиймээс, Hi-C өгөгдөл нь ноорог геном дахь угсарсан дарааллыг бөөгнөрөх, эрэмбэлэх, чиглүүлэх, тэдгээрийг тодорхой тооны хромосомд холбоход чиглүүлж чадна.Энэ технологи нь популяцид суурилсан генетикийн зураг байхгүй үед хромосомын түвшний геномын угсралтыг идэвхжүүлдэг.Геном бүрт Hi-C хэрэгтэй.
Платформ: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Хувьслын генетик
Хувьслын генетик нь SNP, InDels, SV, CNV зэрэг генетикийн өөрчлөлтүүд дээр үндэслэн өгөгдсөн материалын хувьслын мэдээллийн талаар иж бүрэн тайлбар өгөх зорилготой багц дарааллын үйлчилгээ юм.Энэ нь популяцийн бүтэц, генетикийн олон янз байдал, филогенийн хамаарал гэх мэт хувьслын өөрчлөлт, удамшлын онцлогийг тайлбарлахад шаардлагатай бүх үндсэн шинжилгээг өгдөг. Мөн популяцийн хэмжээ, ялгарах хугацааг үр дүнтэй тооцоолох боломжийг олгодог генийн урсгалын талаархи судалгааг агуулдаг.
-
Харьцуулсан геномик
Харьцуулсан геномик гэдэг нь янз бүрийн зүйлийн геномын бүрэн дараалал, бүтцийг харьцуулах гэсэн үг юм.Энэхүү сахилга бат нь төрөл зүйлийн хувьсал, генийн үйл ажиллагаа, генийн зохицуулалтын механизмыг геномын түвшинд янз бүрийн зүйлүүдэд хадгалагдаж, ялгагдах дарааллын бүтэц, элементүүдийг тодорхойлоход чиглэгддэг.Ердийн харьцуулсан геномикийн судалгаанд генийн гэр бүл, хувьслын хөгжил, бүхэл геномын давхардал, сонгомол даралт гэх мэт шинжилгээ орно.
-
Бөөнөөр тусгаарлагдсан шинжилгээ
Бөөн тусгаарлах шинжилгээ (BSA) нь фенотиптэй холбоотой генетикийн маркеруудыг хурдан тодорхойлоход ашигладаг арга юм.BSA-ийн үндсэн ажлын урсгал нь маш эсрэг тэсрэг фенотип бүхий хоёр бүлгийг сонгох, бүх хүмүүсийн ДНХ-ийг нэгтгэх, ДНХ-ийн хоёр хэсгийг бүрдүүлэх, хоёр цөөрмийн хоорондох дифференциал дарааллыг тодорхойлох явдал юм.Энэ аргыг ургамал/амьтны геномын зорилтот генүүдтэй хүчтэй холбоотой генетикийн маркеруудыг тодорхойлоход өргөнөөр ашигладаг.
