●Платформууд:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten болон BGI-DNB-T7
●Дарааллын горимууд:PE50, PE100, PE150, PE250
●Номын сангуудыг дараалалд оруулахаас өмнө чанарын хяналт
●Мэдээлэл хүргэх, чанарын хяналтыг дараалалд оруулах:Q30-ийн уншилтыг үржүүлж, шүүсний дараа QC тайлан болон түүхий өгөгдлийг fastq форматаар хүргэх.
●Дарааллын үйлчилгээний олон талт байдал:үйлчлүүлэгч эгнээ, урсгалын нүд эсвэл өгөгдлийн хэмжээгээр дарааллыг сонгох боломжтой.
●Платформуудын олон талт байдал:DNB номын санг Illumina платформ руу шилжүүлж болно
●Illumina секвенцийн платформ дээрх өргөн туршлага:янз бүрийн төрөл зүйл бүхий мянга мянган хаалттай төслүүдтэй.
●Чанарын хяналт шалгалтын дарааллын тайланг хүргэх:чанарын хэмжүүр, өгөгдлийн нарийвчлал, дарааллын төслийн ерөнхий гүйцэтгэлтэй.
●Насанд хүрсэн дарааллын үйл явц:богино эргэлтийн хугацаатай.
●Чанарын хатуу хяналт: Тогтвортой өндөр чанартай үр дүнг хүргэхийн тулд бид QC-ийн хатуу шаардлагыг хэрэгжүүлдэг.
Өгөгдлийн хэмжээ (X) | Төвлөрөл (qPCR/nM) | Эзлэхүүн |
X ≤ 50 Гб | ≥ 2 нМ | ≥ 20 мкл |
50 Гб ≤ X < 100 Гб | ≥ 3 нМ | ≥ 20 мкл |
X ≥ 100 Гб | ≥ 4 нМ | ≥ 20 мкл |
Платформ | Төвлөрөл (qPCR/nM) | Эзлэхүүн |
HiSeq X Ten | ≥ 2 нМ | ≥ 20 мкл |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 нМ | ≥ 25 мкл |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1.5 нМ | ≥ 25 мкл |
NovaSeq X | ≥ 1.5 нМ | ≥ 25 мкл |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1.5 нМ | ≥ 25 мкл |
Төвлөрөл, нийт хэмжээнээс гадна тохиромжтой оргил загвар шаардлагатай.
Номын сангийн чанарын талаарх тайланг дараалал, номын сангийн хэмжээ, хуваагдмал байдлыг үнэлэхийн өмнө өгдөг.
Хүснэгт 1. Өгөгдлийн дарааллын талаарх статистик.
Жишээ ID | BMKID | Түүхий уншдаг | Түүхий өгөгдөл (bp) | Цэвэр уншилт (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Зураг 1. Дээж бүрийн уншилтын дагуу чанарын хуваарилалт
Зураг 2. Үндсэн агуулгын тархалт
Зураг 3. Өгөгдлийн дараалалд уншсан контентын тархалт