● Судалгааны янз бүрийн зорилгод зориулсан олон дарааллын стратеги
● Бактерийн бүрэн геном нь 0 Gap баталгаатай.
● 10,000 гаруй бүрэн геномыг нэгтгэсэн бактерийн геномын угсралтад өндөр туршлагатай.
● Илүү тодорхой судалгааны хэрэгцээг хангадаг борлуулалтын дараах мэргэжлийн техникийн дэмжлэг үзүүлэх баг.
ДараалалСтратеги | Номын сан | Чанарын баталгаатай | Тооцоолсон эргэлтийн хугацаа |
Nanopore 100X + Illumina 50X | Нанопор 20К PE150 | 0 зөрүү | 30 хоног |
PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
● Түүхий өгөгдлийн чанарын хяналт
● Геномын угсралт
● Геномын бүрэлдэхүүн хэсгүүдийн шинжилгээ
● Генийн функцийн тайлбар
● Харьцуулсан геномын шинжилгээ
Учир ньДНХ-ийн ханд:
Дээжийн төрөл | Дүн | Төвлөрөл | Цэвэр байдал |
ДНХ-ийн ханд | > 2 мкг | > 20 нг/мкл | OD260/280= 1.6-2.5 |
Эд эсийн дээжийн хувьд:
Дээжийн төрөл | Зөвлөмж болгож буй дээжийн эмчилгээ | Дээж хадгалах, тээвэрлэх |
Бактери | Бактерийг микроскопоор ажиглаж, тэдгээрийн экспоненциал үе шатанд бактерийг цуглуул Бактерийн өсгөвөр (ойролцоогоор 3-4.5e9 эс агуулсан) 1.5 эсвэл 2 мл эпендорф руу шилжүүлнэ.(Мөсөн дээр байлга) Бактерийг цуглуулахын тулд хоолойг 14000 граммаар 1 минутын турш центрифуг хийж, дээд давхаргыг сайтар зайлуулна. Хоолойг битүүмжилж, бактерийг шингэн азотоор 30 минутаас багагүй хугацаанд хөлдөөнө.Хоолойг -80 хэмийн хөргөгчинд хадгална. | Шингэн азотын дээжийг 3-4 цагийн турш хөлдөөж, шингэн азот буюу -80 хэмээс удаан хугацаагаар хадгална.Хуурай мөстэй дээж тээвэрлэх шаардлагатай. |
1. Бактерийн геномын цирк
2. Кодлох генийн таамаглал
3.Харьцуулсан геномикийн шинжилгээ: филогенетик мод