മുഴുവൻ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് സീക്വൻസിംഗ് - ഇല്ലുമിന
ഫീച്ചറുകൾ
● സമ്പൂർണ്ണ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം ക്രമപ്പെടുത്തുന്നതിന് ഇരട്ട ലൈബ്രറി: rRNA ശോഷണം, തുടർന്ന് PE150 ലൈബ്രറി തയ്യാറാക്കൽ, വലുപ്പം തിരഞ്ഞെടുക്കൽ, തുടർന്ന് SE50 ലൈബ്രറി തയ്യാറാക്കൽ
● പ്രത്യേക ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക്സ് റിപ്പോർട്ടുകളിൽ mRNA, lncRNA, circRNA, miRNA എന്നിവയുടെ സമ്പൂർണ്ണ ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക്സ് വിശകലനം
● ceRNA നെറ്റ്‌വർക്കുകളുടെ വിശകലനം ഉൾപ്പെടെ, സംയോജിത റിപ്പോർട്ടിലെ എല്ലാ RNA എക്‌സ്‌പ്രഷനുകളുടെയും സംയുക്ത വിശകലനം.
സേവന നേട്ടങ്ങൾ
●റെഗുലേറ്ററി നെറ്റ്‌വർക്കുകളുടെ ആഴത്തിലുള്ള വിശകലനം: ceRNA നെറ്റ്‌വർക്ക് വിശകലനം mRNA, lncRNA, circRNA, miRNA എന്നിവയുടെ സംയുക്ത ക്രമം വഴിയും സമഗ്രമായ ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക് വർക്ക്ഫ്ലോ വഴിയും പ്രവർത്തനക്ഷമമാക്കുന്നു.
●സമഗ്രമായ വ്യാഖ്യാനം: വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന ജീനുകളെ (DEGs) പ്രവർത്തനപരമായി വ്യാഖ്യാനിക്കുന്നതിനും അനുബന്ധ സമ്പുഷ്ടീകരണ വിശകലനം നടത്തുന്നതിനും ഞങ്ങൾ ഒന്നിലധികം ഡാറ്റാബേസുകൾ ഉപയോഗിക്കുന്നു, ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് പ്രതികരണത്തിന് അടിസ്ഥാനമായ സെല്ലുലാർ, മോളിക്യുലാർ പ്രക്രിയകളെക്കുറിച്ചുള്ള ഉൾക്കാഴ്ചകൾ നൽകുന്നു.
●വിപുലമായ വൈദഗ്ധ്യം: വിവിധ ഗവേഷണ ഡൊമെയ്‌നുകളിലായി 2000-ലധികം മുഴുവൻ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം പ്രോജക്‌റ്റുകൾ വിജയകരമായി അവസാനിപ്പിച്ചതിന്റെ ട്രാക്ക് റെക്കോർഡിനൊപ്പം, ഞങ്ങളുടെ ടീം ഓരോ പ്രോജക്‌റ്റിനും അനുഭവ സമ്പത്ത് നൽകുന്നു.
●കർശനമായ ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണം: സാമ്പിൾ, ലൈബ്രറി തയ്യാറാക്കൽ മുതൽ സീക്വൻസിംഗും ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക്‌സും വരെയുള്ള എല്ലാ ഘട്ടങ്ങളിലും ഞങ്ങൾ കോർ കൺട്രോൾ പോയിന്റുകൾ നടപ്പിലാക്കുന്നു.ഈ സൂക്ഷ്മ നിരീക്ഷണം സ്ഥിരമായി ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള ഫലങ്ങളുടെ ഡെലിവറി ഉറപ്പാക്കുന്നു.
● സമഗ്രമായ വ്യാഖ്യാനം: വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന ജീനുകളെ (DEGs) പ്രവർത്തനപരമായി വ്യാഖ്യാനിക്കുന്നതിനും അനുബന്ധ സമ്പുഷ്ടീകരണ വിശകലനം നടത്തുന്നതിനും ഞങ്ങൾ ഒന്നിലധികം ഡാറ്റാബേസുകൾ ഉപയോഗിക്കുന്നു, ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് പ്രതികരണത്തിന് അടിസ്ഥാനമായ സെല്ലുലാർ, മോളിക്യുലാർ പ്രക്രിയകളെക്കുറിച്ചുള്ള ഉൾക്കാഴ്ചകൾ നൽകുന്നു.
●വിൽപ്പനാനന്തര പിന്തുണ: ഞങ്ങളുടെ പ്രതിബദ്ധത 3 മാസത്തെ വിൽപ്പനാനന്തര സേവന കാലയളവിനൊപ്പം പ്രോജക്റ്റ് പൂർത്തീകരണത്തിനപ്പുറം വ്യാപിക്കുന്നു.ഈ സമയത്ത്, ഞങ്ങൾ പ്രോജക്റ്റ് ഫോളോ-അപ്പ്, ട്രബിൾഷൂട്ടിംഗ് സഹായം, ഫലങ്ങളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ഏത് ചോദ്യങ്ങളും പരിഹരിക്കുന്നതിന് ചോദ്യോത്തര സെഷനുകൾ എന്നിവ വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു.
സാമ്പിൾ ആവശ്യകതകളും ഡെലിവറിയും
| പുസ്തകശാല | ക്രമപ്പെടുത്തൽ തന്ത്രം | ഡാറ്റ ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു | ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണം |
| rRNA കുറഞ്ഞു | ഇല്ലുമിന PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| വലുപ്പം തിരഞ്ഞെടുത്തു | ഇല്ലുമിന SE50 | 10-20M വായിക്കുന്നു |
സാമ്പിൾ ആവശ്യകതകൾ:
ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ:
| Conc.(ng/μl) | തുക (μg) | ശുദ്ധി | സമഗ്രത |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ജെല്ലിൽ കാണിച്ചിരിക്കുന്ന പ്രോട്ടീനോ DNA മലിനീകരണമോ പരിമിതമോ ഇല്ലയോ. | സസ്യങ്ങൾ: RIN≥6.5 മൃഗം: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; പരിമിതമായ അല്ലെങ്കിൽ അടിസ്ഥാനപരമായ ഉയരം ഇല്ല |
ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന സാമ്പിൾ ഡെലിവറി
കണ്ടെയ്നർ:
2 മില്ലി സെൻട്രിഫ്യൂജ് ട്യൂബ് (ടിൻ ഫോയിൽ ശുപാർശ ചെയ്യുന്നില്ല)
സാമ്പിൾ ലേബലിംഗ്: ഗ്രൂപ്പ്+റെപ്ലിക്കേറ്റ് ഉദാ A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
കയറ്റുമതി:
1.ഡ്രൈ-ഐസ്: സാമ്പിളുകൾ ബാഗുകളിൽ പായ്ക്ക് ചെയ്യുകയും ഡ്രൈ-ഐസിൽ കുഴിച്ചിടുകയും വേണം.
2.ആർഎൻഎ-സ്റ്റബിൾ ട്യൂബുകൾ: ആർഎൻഎ സാമ്പിളുകൾ ആർഎൻഎ സ്റ്റബിലൈസേഷൻ ട്യൂബിൽ ഉണക്കി മുറിയിലെ ഊഷ്മാവിൽ അയയ്ക്കാം.
സർവീസ് വർക്ക് ഫ്ലോ
പരീക്ഷണ രൂപകൽപ്പന
സാമ്പിൾ ഡെലിവറി
ആർഎൻഎ വേർതിരിച്ചെടുക്കൽ
ലൈബ്രറി നിർമ്മാണം
ക്രമപ്പെടുത്തൽ
ഡാറ്റ വിശകലനം
വിൽപ്പനാനന്തര സേവനങ്ങൾ
ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക്സ്
RNA എക്സ്പ്രഷൻ അവലോകനം
വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന ജീനുകൾ
ceRNA വിശകലനം
വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന മൈആർഎൻഎകളും അനുബന്ധ ആർഎൻഎകളും
ക്യൂറേറ്റ് ചെയ്ത പ്രസിദ്ധീകരണങ്ങളുടെ ശേഖരത്തിലൂടെ BMKGene'ന്റെ മുഴുവൻ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം സീക്വൻസിംഗ് സേവനങ്ങളും സുഗമമാക്കിയ ഗവേഷണ പുരോഗതികൾ പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യുക.
ഡായ്, Y. et al.(2022) 'ആർഎൻഎ-സീക്വൻസിംഗ് വഴി തിരിച്ചറിഞ്ഞ കാഷിൻ-ബെക്ക് രോഗത്തിലെ എംആർഎൻഎ, എൽഎൻസിആർഎൻഎ, മൈആർഎൻഎ എന്നിവയുടെ സമഗ്രമായ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകൾ', മോളിക്യുലർ ഒമിക്സ്, 18(2), പേജ്. 154–166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
ലിയു, എൻ. നാൻ തുടങ്ങിയവർ.(2022) 'ഓവർ വിന്ററിംഗ് കാലയളവിൽ ചാങ്‌ബായ് പർവതത്തിലെ ആപിസ് സെറാനയുടെ ശീത-പ്രതിരോധത്തിന്റെ ഫുൾ ലെങ്ത് ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്‌റ്റോംസ് വിശകലനം.', ജീൻ, 830, പേജ്. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
വാങ്, XJ et al.(2022) 'മൾട്ടി-ഒമിക്സ് ഇന്റഗ്രേഷൻ-ബേസ്ഡ് പ്രയോറിറ്റൈസേഷൻ ഓഫ് കോംപറ്റിംഗ് എൻഡോജെനസ് ആർഎൻഎ റെഗുലേഷൻ നെറ്റ്‌വർക്കുകൾ ഇൻ സ്മോൾ സെൽ ലംഗ് ക്യാൻസർ: മോളിക്യുലാർ സ്വഭാവങ്ങളും ഡ്രഗ് കാൻഡിഡേറ്റുകളും', ഫ്രോണ്ടിയേഴ്സ് ഇൻ ഓങ്കോളജി, 12, പേജ്.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al.(2022) 'lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകളുടെ സംയോജിത വിശകലനം നിലക്കടലയിലെ റൂട്ട്-നോട്ട് നെമറ്റോഡുകളോടുള്ള പ്രതികരണമായി സാധ്യമായ സംവിധാനങ്ങളെക്കുറിച്ചുള്ള പുതിയ ഉൾക്കാഴ്ചകൾ വെളിപ്പെടുത്തുന്നു', BMC ജീനോമിക്‌സ്, 23(1), പേജ്. 1-12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
Yan, Z. et al.(2022) 'റെഡ് എൽഇഡി വികിരണം വഴി ബ്രോക്കോളിയിലെ വിളവെടുപ്പിന് ശേഷമുള്ള ഗുണനിലവാരം നിലനിർത്തുന്നതുമായി ബന്ധപ്പെട്ട തന്മാത്രാ സംവിധാനങ്ങളെ ഹോൾ-ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം ആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗ് എടുത്തുകാണിക്കുന്നു', പോസ്റ്റ് ഹാർവെസ്റ്റ് ബയോളജി ആൻഡ് ടെക്‌നോളജി, 188, പേ.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
