ഹീറ്റ്മാപ്പ് ഡ്രോയിംഗ് ഹീറ്റ് മാപ്പ് ഡ്രോയിംഗിനായി ഉപയോഗിക്കുന്നു, ഇതിന് ക്ലസ്റ്റർ മാട്രിക്സ് ഡാറ്റ ഫിൽട്ടർ ചെയ്യാനും നോർമലൈസ് ചെയ്യാനും കഴിയും. വ്യത്യസ്ത സാമ്പിളുകൾക്കിടയിലുള്ള ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലിന്റെ ക്ലസ്റ്റർ വിശകലനത്തിനാണ് ഇത് കൂടുതലും ഉപയോഗിക്കുന്നത്.
NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam എന്നിവയുൾപ്പെടെ ഡാറ്റാബേസിലേക്ക് സീക്വൻസുകൾ വിന്യസിച്ചുകൊണ്ട് ഫാസ്റ്റ ഫയലിലെ സീക്വൻസുകളിലേക്ക് ബയോളജിക്കൽ ഫംഗ്ഷനുകൾ അറ്റാച്ചുചെയ്യുന്നു.
BLAST (ബേസിക് ലോക്കൽ അലൈൻമെന്റ് സെർച്ച് ടൂൾ) സമാന ജൈവ ക്രമങ്ങളുള്ള പ്രദേശങ്ങൾ കണ്ടെത്തുന്നതിനുള്ള ഒരു അൽഗോരിതവും പ്രോഗ്രാമുമാണ്.ഇത് ഈ സീക്വൻസുകളെ സീക്വൻസ് ഡാറ്റാബേസുകളുമായി താരതമ്യം ചെയ്യുകയും സ്റ്റാറ്റിസ്റ്റിക്കൽ പ്രാധാന്യം കണക്കാക്കുകയും ചെയ്യുന്നു.BLAST-ൽ സീക്വൻസ് തരം അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള നാല് തരം ടൂളുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു: blastn, lastp, blastx, tblastn.