ഉയർന്ന മാർക്കർ കണ്ടെത്തൽ കാര്യക്ഷമത- ഹൈ-ത്രൂപുട്ട് സീക്വൻസിങ് ടെക്നോളജി, മുഴുവൻ ജീനോമിനുള്ളിലും ലക്ഷക്കണക്കിന് ടാഗുകൾ കണ്ടെത്തുന്നതിന് SLAF-Seq-നെ സഹായിക്കുന്നു.
ജീനോമിൽ കുറഞ്ഞ ആശ്രിതത്വം- ഇത് ഒരു റഫറൻസ് ജീനോം ഉള്ളതോ അല്ലാതെയോ സ്പീഷിസുകളിൽ പ്രയോഗിക്കാവുന്നതാണ്.
ഫ്ലെക്സിബിൾ സ്കീം ഡിസൈൻ- സിംഗിൾ-എൻസൈം, ഡ്യുവൽ-എൻസൈം, മൾട്ടി-എൻസൈം ദഹനം, വിവിധ തരം എൻസൈമുകൾ എന്നിവയെല്ലാം വ്യത്യസ്ത ഗവേഷണ ലക്ഷ്യങ്ങൾ അല്ലെങ്കിൽ സ്പീഷീസുകൾ നിറവേറ്റുന്നതിനായി തിരഞ്ഞെടുക്കാം.ഒപ്റ്റിമൽ എൻസൈം ഡിസൈൻ ഉറപ്പാക്കാൻ സിലിക്കോയിലെ മുൻകൂർ മൂല്യനിർണ്ണയം ഉപയോഗിക്കുന്നു.
കാര്യക്ഷമമായ എൻസൈമാറ്റിക് ദഹനം- വ്യവസ്ഥകൾ ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്യുന്നതിനായി പ്രീ-പരീക്ഷണങ്ങൾ നടത്തി, ഇത് ഔപചാരിക പരീക്ഷണം സുസ്ഥിരവും വിശ്വസനീയവുമാക്കുന്നു.ശകലങ്ങളുടെ ശേഖരണ കാര്യക്ഷമത 95%-ൽ കൂടുതൽ നേടാൻ കഴിയും.
SLAF ടാഗുകൾ തുല്യമായി വിതരണം ചെയ്തു- SLAF ടാഗുകൾ എല്ലാ ക്രോമസോമുകളിലും തുല്യമായി വിതരണം ചെയ്യപ്പെടുന്നു, ഇത് 4 kb ന് ശരാശരി 1 SLAF നേടുന്നു.
ആവർത്തനങ്ങൾ ഫലപ്രദമായി ഒഴിവാക്കുക- SLAF-Seq ഡാറ്റയിലെ ആവർത്തന ക്രമം 5%-ൽ താഴെയായി കുറഞ്ഞു, പ്രത്യേകിച്ച് ഗോതമ്പ്, ചോളം മുതലായവ ഉയർന്ന തലത്തിലുള്ള ആവർത്തനങ്ങളുള്ള സ്പീഷീസുകളിൽ.
സമഗ്രമായ പരിചയം-സസ്യങ്ങൾ, സസ്തനികൾ, പക്ഷികൾ, പ്രാണികൾ, ജലജീവികൾ മുതലായവ ഉൾക്കൊള്ളുന്ന നൂറുകണക്കിന് ജീവിവർഗങ്ങളിൽ 2000-ലധികം അടച്ച SLAF-Seq പദ്ധതികൾ.
സ്വയം വികസിപ്പിച്ച ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക് വർക്ക്ഫ്ലോ- അന്തിമ ഔട്ട്പുട്ടിന്റെ വിശ്വാസ്യതയും കൃത്യതയും ഉറപ്പാക്കാൻ SLAF-Seq-നുള്ള ഒരു സംയോജിത ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക് വർക്ക്ഫ്ലോ BMKGENE വികസിപ്പിച്ചെടുത്തു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം | Conc.(ng/gl) | ആകെ (ug) | OD260/280 |
ഇല്ലുമിന നോവസെക് | >35 | >1.6(വാല്യം>15μl) | 1.6-2.5 |
സീക്വൻസിംഗ് ഡെപ്ത്: 10X/ടാഗ്
ജീനോം വലിപ്പം | ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന SLAF ടാഗുകൾ |
< 500 Mb | 100K അല്ലെങ്കിൽ WGS |
500 Mb- 1 Gb | 100 കെ |
1 ജിബി -2 ജിബി | 200 കെ |
ഭീമൻ അല്ലെങ്കിൽ സങ്കീർണ്ണ ജീനോമുകൾ | 300 - 400K |
അപേക്ഷകൾ
| ശുപാർശ ചെയ്ത ജനസംഖ്യാ സ്കെയിൽ
| ക്രമപ്പെടുത്തൽ തന്ത്രവും ആഴവും
| |
ആഴം
| ടാഗ് നമ്പർ
| ||
GWAS
| സാമ്പിൾ നമ്പർ ≥ 200
| 10X
|
ഇതനുസരിച്ച് ജനിതക വലിപ്പം
|
ജനിതക പരിണാമം
| ഓരോന്നിന്റെയും വ്യക്തികൾ ഉപഗ്രൂപ്പ് ≥ 10; ആകെ സാമ്പിളുകൾ ≥ 30
| 10X
|
കണ്ടെയ്നർ: 2 മില്ലി സെൻട്രിഫ്യൂജ് ട്യൂബ്
മിക്ക സാമ്പിളുകളിലും, എത്തനോളിൽ സൂക്ഷിക്കരുതെന്ന് ഞങ്ങൾ ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു.
സാമ്പിൾ ലേബലിംഗ്: സാമ്പിളുകൾ വ്യക്തമായി ലേബൽ ചെയ്യുകയും സമർപ്പിച്ച സാമ്പിൾ വിവര ഫോമിന് സമാനമായിരിക്കുകയും വേണം.
കയറ്റുമതി: ഡ്രൈ-ഐസ്: സാമ്പിളുകൾ ആദ്യം ബാഗുകളിൽ പായ്ക്ക് ചെയ്യുകയും ഡ്രൈ-ഐസിൽ കുഴിച്ചിടുകയും വേണം.
1. മാപ്പ് ഫലത്തിന്റെ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ
2. SLAF മാർക്കർ വികസനം
3. വേരിയേഷൻ വ്യാഖ്യാനം
വർഷം | ജേണൽ | IF | തലക്കെട്ട് | അപേക്ഷകൾ |
2022 | പ്രകൃതി ആശയവിനിമയങ്ങൾ | 17.694 | ട്രീ പിയോണിയുടെ ജിഗാ-ക്രോമസോമുകളുടെയും ഗിഗാ-ജീനോമിന്റെയും ജീനോമിക് അടിസ്ഥാനം പിയോണിയ ഓസ്റ്റി | SLAF-GWAS |
2015 | പുതിയ ഫൈറ്റോളജിസ്റ്റ് | 7.433 | ഗാർഹിക കാൽപ്പാടുകൾ കാർഷിക പ്രാധാന്യമുള്ള ജനിതക മേഖലകളെ നങ്കൂരമിടുന്നു സോയാബീൻസ് | SLAF-GWAS |
2022 | ജേണൽ ഓഫ് അഡ്വാൻസ്ഡ് റിസർച്ച് | 12.822 | ജി. ഹിർസ്യൂട്ടത്തിലേക്ക് ഗോസിപിയം ബാർബഡെൻസിന്റെ ജീനോം-വൈഡ് കൃത്രിമമായ കടന്നുകയറ്റങ്ങൾ പരുത്തി നാരുകളുടെ ഗുണനിലവാരവും വിളവും ഒരേസമയം മെച്ചപ്പെടുത്തുന്നതിന് മികച്ച സ്ഥാനം വെളിപ്പെടുത്തുക സ്വഭാവഗുണങ്ങൾ | SLAF-പരിണാമ ജനിതകശാസ്ത്രം |
2019 | തന്മാത്രാ പ്ലാന്റ് | 10.81 | പോപ്പുലേഷൻ ജെനോമിക് അനാലിസിസും ഡി നോവോ അസംബ്ലിയും വീഡിയുടെ ഉത്ഭവം വെളിപ്പെടുത്തുന്നു ഒരു പരിണാമ ഗെയിമായി അരി | SLAF-പരിണാമ ജനിതകശാസ്ത്രം |
2019 | പ്രകൃതി ജനിതകശാസ്ത്രം | 31.616 | സാധാരണ കരിമീൻ, സൈപ്രിനസ് കാർപ്പിയോയുടെ ജീനോം സീക്വൻസും ജനിതക വൈവിധ്യവും | SLAF-ലിങ്കേജ് മാപ്പ് |
2014 | പ്രകൃതി ജനിതകശാസ്ത്രം | 25.455 | കൃഷി ചെയ്ത നിലക്കടലയുടെ ജീനോം പയർവർഗ്ഗ കാരിയോടൈപ്പുകൾ, പോളിപ്ലോയിഡ് എന്നിവയെക്കുറിച്ച് ഉൾക്കാഴ്ച നൽകുന്നു പരിണാമവും വിള വളർത്തലും. | SLAF-ലിങ്കേജ് മാപ്പ് |
2022 | പ്ലാന്റ് ബയോടെക്നോളജി ജേണൽ | 9.803 | ST1 ന്റെ ഐഡന്റിഫിക്കേഷൻ വിത്ത് രൂപഘടനയുടെ ഹിച്ച്ഹൈക്കിംഗ് ഉൾപ്പെടുന്ന ഒരു തിരഞ്ഞെടുപ്പ് വെളിപ്പെടുത്തുന്നു സോയാബീൻ വളർത്തുന്ന സമയത്ത് എണ്ണയുടെ അളവ് | SLAF-മാർക്കർ വികസനം |
2022 | ഇന്റർനാഷണൽ ജേണൽ ഓഫ് മോളിക്യുലാർ സയൻസസ് | 6.208 | ഒരു ഗോതമ്പ്-ലെയ്മസ് മോളിസ് 2Ns (2D)ക്കുള്ള ഐഡന്റിഫിക്കേഷനും DNA മാർക്കർ വികസനവും ഡിസോമിക് ക്രോമസോം സബ്സ്റ്റിറ്റ്യൂഷൻ | SLAF-മാർക്കർ വികസനം |