BMKCloud Log in
条形ബാനർ-03

ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ

സ്പെസിഫിക്-ലോക്കസ് ആംപ്ലിഫൈഡ് ഫ്രാഗ്മെന്റ് സീക്വൻസിങ് (SLAF-Seq)

ഹൈ-ത്രൂപുട്ട് ജനിതകമാറ്റം, പ്രത്യേകിച്ച് വലിയ തോതിലുള്ള ജനസംഖ്യയിൽ, ജനിതക അസോസിയേഷൻ പഠനങ്ങളിലെ ഒരു അടിസ്ഥാന ഘട്ടമാണ്, ഇത് പ്രവർത്തനപരമായ ജീൻ കണ്ടെത്തൽ, പരിണാമ വിശകലനം മുതലായവയ്ക്ക് ജനിതക അടിസ്ഥാനം നൽകുന്നു. ആഴത്തിലുള്ള മുഴുവൻ ജീനോം പുനഃക്രമീകരണത്തിന് പകരം, പ്രാതിനിധ്യം കുറയ്ക്കുന്നു (RRGS. ) ജനിതക മാർക്കർ കണ്ടെത്തലിൽ ന്യായമായ കാര്യക്ഷമത നിലനിർത്തിക്കൊണ്ട് ഓരോ സാമ്പിളിനും സീക്വൻസിങ് ചെലവ് കുറയ്ക്കുന്നതിനാണ് അവതരിപ്പിക്കുന്നത്.നൽകിയിരിക്കുന്ന വലുപ്പ പരിധിക്കുള്ളിൽ നിയന്ത്രണ ശകലം വേർതിരിച്ചെടുക്കുന്നതിലൂടെയാണ് ഇത് സാധാരണയായി നേടുന്നത്, ഇതിനെ കുറച്ച പ്രാതിനിധ്യ ലൈബ്രറി (RRL) എന്ന് വിളിക്കുന്നു.പ്രത്യേക-ലോകസ് ആംപ്ലിഫൈഡ് ഫ്രാഗ്മെന്റ് സീക്വൻസിങ് (SLAF-Seq) എന്നത് ഒരു റഫറൻസ് ജീനോം ഉപയോഗിച്ചോ അല്ലാതെയോ എസ്എൻപി ജനിതകരൂപീകരണത്തിനുള്ള സ്വയം വികസിപ്പിച്ച തന്ത്രമാണ്.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina NovaSeq പ്ലാറ്റ്ഫോം


സേവന വിശദാംശങ്ങൾ

ഡെമോ ഫലങ്ങൾ

ഫീച്ചർ ചെയ്ത പ്രസിദ്ധീകരണങ്ങൾ

സേവന വിശദാംശങ്ങൾ

സാങ്കേതിക പദ്ധതി

111

വർക്ക്ഫ്ലോ

流程图

സേവന നേട്ടങ്ങൾ

ഉയർന്ന മാർക്കർ കണ്ടെത്തൽ കാര്യക്ഷമത- ഹൈ-ത്രൂപുട്ട് സീക്വൻസിങ് ടെക്‌നോളജി, മുഴുവൻ ജീനോമിനുള്ളിലും ലക്ഷക്കണക്കിന് ടാഗുകൾ കണ്ടെത്തുന്നതിന് SLAF-Seq-നെ സഹായിക്കുന്നു.

ജീനോമിൽ കുറഞ്ഞ ആശ്രിതത്വം- ഇത് ഒരു റഫറൻസ് ജീനോം ഉള്ളതോ അല്ലാതെയോ സ്പീഷിസുകളിൽ പ്രയോഗിക്കാവുന്നതാണ്.

ഫ്ലെക്സിബിൾ സ്കീം ഡിസൈൻ- സിംഗിൾ-എൻസൈം, ഡ്യുവൽ-എൻസൈം, മൾട്ടി-എൻസൈം ദഹനം, വിവിധ തരം എൻസൈമുകൾ എന്നിവയെല്ലാം വ്യത്യസ്ത ഗവേഷണ ലക്ഷ്യങ്ങൾ അല്ലെങ്കിൽ സ്പീഷീസുകൾ നിറവേറ്റുന്നതിനായി തിരഞ്ഞെടുക്കാം.ഒപ്റ്റിമൽ എൻസൈം ഡിസൈൻ ഉറപ്പാക്കാൻ സിലിക്കോയിലെ മുൻകൂർ മൂല്യനിർണ്ണയം ഉപയോഗിക്കുന്നു.

കാര്യക്ഷമമായ എൻസൈമാറ്റിക് ദഹനം- വ്യവസ്ഥകൾ ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്യുന്നതിനായി പ്രീ-പരീക്ഷണങ്ങൾ നടത്തി, ഇത് ഔപചാരിക പരീക്ഷണം സുസ്ഥിരവും വിശ്വസനീയവുമാക്കുന്നു.ശകലങ്ങളുടെ ശേഖരണ കാര്യക്ഷമത 95%-ൽ കൂടുതൽ നേടാൻ കഴിയും.

SLAF ടാഗുകൾ തുല്യമായി വിതരണം ചെയ്തു- SLAF ടാഗുകൾ എല്ലാ ക്രോമസോമുകളിലും തുല്യമായി വിതരണം ചെയ്യപ്പെടുന്നു, ഇത് 4 kb ന് ശരാശരി 1 SLAF നേടുന്നു.

ആവർത്തനങ്ങൾ ഫലപ്രദമായി ഒഴിവാക്കുക- SLAF-Seq ഡാറ്റയിലെ ആവർത്തന ക്രമം 5%-ൽ താഴെയായി കുറഞ്ഞു, പ്രത്യേകിച്ച് ഗോതമ്പ്, ചോളം മുതലായവ ഉയർന്ന തലത്തിലുള്ള ആവർത്തനങ്ങളുള്ള സ്പീഷീസുകളിൽ.

സമഗ്രമായ പരിചയം-സസ്യങ്ങൾ, സസ്തനികൾ, പക്ഷികൾ, പ്രാണികൾ, ജലജീവികൾ മുതലായവ ഉൾക്കൊള്ളുന്ന നൂറുകണക്കിന് ജീവിവർഗങ്ങളിൽ 2000-ലധികം അടച്ച SLAF-Seq പദ്ധതികൾ.

സ്വയം വികസിപ്പിച്ച ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക് വർക്ക്ഫ്ലോ- അന്തിമ ഔട്ട്‌പുട്ടിന്റെ വിശ്വാസ്യതയും കൃത്യതയും ഉറപ്പാക്കാൻ SLAF-Seq-നുള്ള ഒരു സംയോജിത ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക് വർക്ക്ഫ്ലോ BMKGENE വികസിപ്പിച്ചെടുത്തു.

 

സേവന സവിശേഷതകൾ

 

പ്ലാറ്റ്ഫോം

Conc.(ng/gl)

ആകെ (ug)

OD260/280

ഇല്ലുമിന നോവസെക്

>35

>1.6(വാല്യം>15μl)

1.6-2.5

കുറിപ്പ്: മൂന്ന് എൻസൈം സ്കീമുകളുള്ള മൂന്ന് സാമ്പിളുകൾ, പ്രീ-പരീക്ഷണത്തിനായി നടത്തും.

ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന സീക്വൻസിങ് സ്ട്രാറ്റജി

സീക്വൻസിംഗ് ഡെപ്ത്: 10X/ടാഗ്

ജീനോം വലിപ്പം

ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന SLAF ടാഗുകൾ

< 500 Mb

100K അല്ലെങ്കിൽ WGS

500 Mb- 1 Gb

100 കെ

1 ജിബി -2 ജിബി

200 കെ

ഭീമൻ അല്ലെങ്കിൽ സങ്കീർണ്ണ ജീനോമുകൾ

300 - 400K

 

അപേക്ഷകൾ

 

ശുപാർശ ചെയ്ത

ജനസംഖ്യാ സ്കെയിൽ

 

ക്രമപ്പെടുത്തൽ തന്ത്രവും ആഴവും

 

ആഴം

 

ടാഗ് നമ്പർ

 

GWAS

 

സാമ്പിൾ നമ്പർ ≥ 200

 

10X

 

 

 

 

 

ഇതനുസരിച്ച്

ജനിതക വലിപ്പം

 

ജനിതക പരിണാമം

 

ഓരോന്നിന്റെയും വ്യക്തികൾ

ഉപഗ്രൂപ്പ് ≥ 10;

ആകെ സാമ്പിളുകൾ ≥ 30

 

10X

 

ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന സാമ്പിൾ ഡെലിവറി

കണ്ടെയ്നർ: 2 മില്ലി സെൻട്രിഫ്യൂജ് ട്യൂബ്

മിക്ക സാമ്പിളുകളിലും, എത്തനോളിൽ സൂക്ഷിക്കരുതെന്ന് ഞങ്ങൾ ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു.

സാമ്പിൾ ലേബലിംഗ്: സാമ്പിളുകൾ വ്യക്തമായി ലേബൽ ചെയ്യുകയും സമർപ്പിച്ച സാമ്പിൾ വിവര ഫോമിന് സമാനമായിരിക്കുകയും വേണം.

കയറ്റുമതി: ഡ്രൈ-ഐസ്: സാമ്പിളുകൾ ആദ്യം ബാഗുകളിൽ പായ്ക്ക് ചെയ്യുകയും ഡ്രൈ-ഐസിൽ കുഴിച്ചിടുകയും വേണം.

സേവന വർക്ക്ഫ്ലോ

സാമ്പിൾ ക്യുസി
പൈലറ്റ് പരീക്ഷണം
SLAF പരീക്ഷണം
ലൈബ്രറി തയ്യാറാക്കൽ
ക്രമപ്പെടുത്തൽ
ഡാറ്റ വിശകലനം
വിൽപ്പനാനന്തര സേവനങ്ങൾ

സാമ്പിൾ ക്യുസി

പൈലറ്റ് പരീക്ഷണം

SLAF-പരീക്ഷണം

ലൈബ്രറി തയ്യാറാക്കൽ

ക്രമപ്പെടുത്തൽ

ഡാറ്റ വിശകലനം

വിൽപ്പനാനന്തര സേവനങ്ങൾ


  • മുമ്പത്തെ:
  • അടുത്തത്:

  • 1. മാപ്പ് ഫലത്തിന്റെ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ

    ചിത്രം1

    A1

    2. SLAF മാർക്കർ വികസനം

    A2

    3. വേരിയേഷൻ വ്യാഖ്യാനം

    A3

    വർഷം

    ജേണൽ

    IF

    തലക്കെട്ട്

    അപേക്ഷകൾ

    2022

    പ്രകൃതി ആശയവിനിമയങ്ങൾ

    17.694

    ട്രീ പിയോണിയുടെ ജിഗാ-ക്രോമസോമുകളുടെയും ഗിഗാ-ജീനോമിന്റെയും ജീനോമിക് അടിസ്ഥാനം

    പിയോണിയ ഓസ്റ്റി

    SLAF-GWAS

    2015

    പുതിയ ഫൈറ്റോളജിസ്റ്റ്

    7.433

    ഗാർഹിക കാൽപ്പാടുകൾ കാർഷിക പ്രാധാന്യമുള്ള ജനിതക മേഖലകളെ നങ്കൂരമിടുന്നു

    സോയാബീൻസ്

    SLAF-GWAS

    2022

    ജേണൽ ഓഫ് അഡ്വാൻസ്ഡ് റിസർച്ച്

    12.822

    ജി. ഹിർസ്യൂട്ടത്തിലേക്ക് ഗോസിപിയം ബാർബഡെൻസിന്റെ ജീനോം-വൈഡ് കൃത്രിമമായ കടന്നുകയറ്റങ്ങൾ

    പരുത്തി നാരുകളുടെ ഗുണനിലവാരവും വിളവും ഒരേസമയം മെച്ചപ്പെടുത്തുന്നതിന് മികച്ച സ്ഥാനം വെളിപ്പെടുത്തുക

    സ്വഭാവഗുണങ്ങൾ

    SLAF-പരിണാമ ജനിതകശാസ്ത്രം

    2019

    തന്മാത്രാ പ്ലാന്റ്

    10.81

    പോപ്പുലേഷൻ ജെനോമിക് അനാലിസിസും ഡി നോവോ അസംബ്ലിയും വീഡിയുടെ ഉത്ഭവം വെളിപ്പെടുത്തുന്നു

    ഒരു പരിണാമ ഗെയിമായി അരി

    SLAF-പരിണാമ ജനിതകശാസ്ത്രം

    2019

    പ്രകൃതി ജനിതകശാസ്ത്രം

    31.616

    സാധാരണ കരിമീൻ, സൈപ്രിനസ് കാർപ്പിയോയുടെ ജീനോം സീക്വൻസും ജനിതക വൈവിധ്യവും

    SLAF-ലിങ്കേജ് മാപ്പ്

    2014

    പ്രകൃതി ജനിതകശാസ്ത്രം

    25.455

    കൃഷി ചെയ്ത നിലക്കടലയുടെ ജീനോം പയർവർഗ്ഗ കാരിയോടൈപ്പുകൾ, പോളിപ്ലോയിഡ് എന്നിവയെക്കുറിച്ച് ഉൾക്കാഴ്ച നൽകുന്നു

    പരിണാമവും വിള വളർത്തലും.

    SLAF-ലിങ്കേജ് മാപ്പ്

    2022

    പ്ലാന്റ് ബയോടെക്നോളജി ജേണൽ

    9.803

    ST1 ന്റെ ഐഡന്റിഫിക്കേഷൻ വിത്ത് രൂപഘടനയുടെ ഹിച്ച്ഹൈക്കിംഗ് ഉൾപ്പെടുന്ന ഒരു തിരഞ്ഞെടുപ്പ് വെളിപ്പെടുത്തുന്നു

    സോയാബീൻ വളർത്തുന്ന സമയത്ത് എണ്ണയുടെ അളവ്

    SLAF-മാർക്കർ വികസനം

    2022

    ഇന്റർനാഷണൽ ജേണൽ ഓഫ് മോളിക്യുലാർ സയൻസസ്

    6.208

    ഒരു ഗോതമ്പ്-ലെയ്മസ് മോളിസ് 2Ns (2D)ക്കുള്ള ഐഡന്റിഫിക്കേഷനും DNA മാർക്കർ വികസനവും

    ഡിസോമിക് ക്രോമസോം സബ്സ്റ്റിറ്റ്യൂഷൻ

    SLAF-മാർക്കർ വികസനം

    ഒരു ഉദ്ധരണി എടുക്കൂ

    നിങ്ങളുടെ സന്ദേശം ഇവിടെ എഴുതി ഞങ്ങൾക്ക് അയക്കുക

    നിങ്ങളുടെ സന്ദേശം ഞങ്ങൾക്ക് അയക്കുക: