പ്ലാറ്റ്ഫോം: NovaSeq പ്ലാറ്റ്ഫോം, PE150
ലൈബ്രറി തരം: 200-400bp ബൈസൾഫൈറ്റ് ചികിത്സിച്ച ഡിഎൻഎ ലൈബ്രറി ചേർക്കുക
സീക്വൻസിങ് സ്ട്രാറ്റജി: പെയർഡ്-എൻഡ് 150 ബിപി
ഡാറ്റ ഔട്ട്പുട്ട് ശുപാർശ ചെയ്യുക: 10 Gb റോ ഡാറ്റ/സാമ്പിൾ
DNA അളവ്: ≥ 2ug
DNA കോൺസൺട്രേഷൻ:≥ 20ng/μl.
ശുദ്ധി: OD260/280 = 1.8 മുതൽ 2.0 വരെ ഡീഗ്രേഡേഷനോ RNA മലിനീകരണമോ ഇല്ലാതെ
a.റഫറൻസ് ജീനോം വിന്യാസ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ
മാപ്പിംഗ് റീഡുകളുടെ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ
Sസി സൈറ്റിന്റെ ആഴവും കവറേജും ക്രമപ്പെടുത്തുന്നതിന്റെ കണക്കുകൾ
Aശേഖരിക്കപ്പെട്ട കവറേജ്
Dഓരോ സാമ്പിളിന്റെയും ദഹനക്ഷമത
b.മെഥിലേഷൻ സൈറ്റ് കണ്ടെത്തൽ
സി സൈറ്റിലെ മിഥിലേഷൻ ലെവലുകളുടെ ലിസ്റ്റ്
Bഎസ് പരിവർത്തനം
c.മെഥിലേഷൻ മാപ്പ്
Gഎനോം ഘടകം
d.സാമ്പിളുകൾ തമ്മിലുള്ള മിഥിലേഷൻ ലെവലുകളുടെ താരതമ്യം
Pസിജി മെഥൈലേഷന്റെ എയർവൈസ് കോറിലേഷൻ
d.വ്യത്യസ്തമായി മെഥിലേഷൻ വിശകലനം
SDMR-ന്റെ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ