-
ബിഎസ്എ
ബൾക്ക്ഡ് സെഗ്രഗന്റ് അനാലിസിസ് പ്ലാറ്റ്‌ഫോമിൽ ഒരു-ഘട്ട സ്റ്റാൻഡേർഡ് വിശകലനവും ഇഷ്‌ടാനുസൃതമാക്കിയ പാരാമീറ്റർ സജ്ജീകരണത്തോടുകൂടിയ വിപുലമായ വിശകലനവും അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു.ഫിനോടൈപ്പുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ജനിതക മാർക്കറുകൾ പെട്ടെന്ന് തിരിച്ചറിയാൻ ഉപയോഗിക്കുന്ന ഒരു സാങ്കേതികതയാണ് ബിഎസ്എ.BSA-യുടെ പ്രധാന വർക്ക്ഫ്ലോയിൽ ഇവ ഉൾപ്പെടുന്നു: 1. തികച്ചും വിരുദ്ധമായ പ്രതിഭാസങ്ങളുള്ള വ്യക്തികളുടെ രണ്ട് ഗ്രൂപ്പുകളെ തിരഞ്ഞെടുക്കൽ;2. എല്ലാ വ്യക്തികളുടെയും ഡിഎൻഎ, ആർഎൻഎ അല്ലെങ്കിൽ എസ്എൽഎഎഫ്-സെക് (ബയോമാർക്കർ വികസിപ്പിച്ചെടുത്തത്) രണ്ട് ബൾക്ക് ഡിഎൻഎ രൂപീകരിക്കുന്നു;3. റഫറൻസ് ജീനോം അല്ലെങ്കിൽ അതിനിടയിലുള്ള ഡിഫറൻഷ്യൽ സീക്വൻസുകൾ തിരിച്ചറിയൽ, 4. ED, SNP-ഇൻഡക്സ് അൽഗോരിതം എന്നിവ ഉപയോഗിച്ച് കാൻഡിഡേറ്റ് ലിങ്ക്ഡ് പ്രദേശങ്ങൾ പ്രവചിക്കുക;5. കാൻഡിഡേറ്റ് മേഖലകളിലെ ജീനുകളുടെ പ്രവർത്തനപരമായ വിശകലനവും സമ്പുഷ്ടീകരണവും. ജനിതക മാർക്കർ സ്ക്രീനിംഗും പ്രൈമർ ഡിസൈനും ഉൾപ്പെടെയുള്ള ഡാറ്റയിൽ കൂടുതൽ വിപുലമായ ഖനനവും ലഭ്യമാണ്.
-
ആംപ്ലിക്കൺ (16S/18S/ITS)
ആംപ്ലിക്കോൺ (16S/18S/ITS) പ്ലാറ്റ്ഫോം മൈക്രോബയൽ ഡൈവേഴ്‌സിറ്റി പ്രോജക്റ്റ് വിശകലനത്തിൽ വർഷങ്ങളോളം പരിചയമുള്ളതാണ്, അതിൽ സ്റ്റാൻഡേർഡ് അടിസ്ഥാന വിശകലനവും വ്യക്തിഗത വിശകലനവും അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു: അടിസ്ഥാന വിശകലനം നിലവിലെ മൈക്രോബയൽ ഗവേഷണത്തിന്റെ മുഖ്യധാരാ വിശകലന ഉള്ളടക്കം ഉൾക്കൊള്ളുന്നു, വിശകലന ഉള്ളടക്കം സമ്പന്നവും സമഗ്രവുമാണ്, കൂടാതെ വിശകലന ഫലങ്ങൾ പ്രോജക്ട് റിപ്പോർട്ടുകളുടെ രൂപത്തിൽ അവതരിപ്പിക്കുന്നു;വ്യക്തിഗത വിശകലനത്തിന്റെ ഉള്ളടക്കം വൈവിധ്യപൂർണ്ണമാണ്.വ്യക്തിഗത ആവശ്യകതകൾ സാക്ഷാത്കരിക്കുന്നതിന്, അടിസ്ഥാന വിശകലന റിപ്പോർട്ടിനും ഗവേഷണ ഉദ്ദേശ്യത്തിനും അനുസരിച്ച് സാമ്പിളുകൾ തിരഞ്ഞെടുക്കാനും പരാമീറ്ററുകൾ അയവുള്ള രീതിയിൽ സജ്ജീകരിക്കാനും കഴിയും.വിൻഡോസ് ഓപ്പറേറ്റിംഗ് സിസ്റ്റം, ലളിതവും വേഗതയും.
-
പരിണാമ ജനിതകശാസ്ത്രം
എസ്‌എൻ‌പികൾ, ഇൻ‌ഡെലുകൾ, എസ്‌വികൾ, സി‌എൻ‌വികൾ എന്നിവയുൾപ്പെടെയുള്ള ജനിതക വ്യതിയാനങ്ങളെ അടിസ്ഥാനമാക്കി നൽകിയിരിക്കുന്ന മെറ്റീരിയലുകളുടെ പരിണാമ വിവരങ്ങളെക്കുറിച്ചുള്ള സമഗ്രമായ വ്യാഖ്യാനം നൽകുന്നതിന് രൂപകൽപ്പന ചെയ്‌തിരിക്കുന്ന ഒരു പായ്ക്ക്ഡ് സീക്വൻസിങ് സേവനമാണ് പരിണാമ ജനിതകശാസ്ത്രം.ജനസംഖ്യാ ഘടന, ജനിതക വൈവിധ്യം, ഫൈലോജെനി ബന്ധങ്ങൾ മുതലായവ പോലുള്ള ജനസംഖ്യയുടെ പരിണാമപരമായ മാറ്റങ്ങളും ജനിതക സവിശേഷതകളും വിവരിക്കുന്നതിന് ആവശ്യമായ എല്ലാ അടിസ്ഥാന വിശകലനങ്ങളും ഇത് നൽകുന്നു. ഫലപ്രദമായ ജനസംഖ്യാ വലുപ്പം, വ്യതിചലന സമയം എന്നിവ കണക്കാക്കാൻ ഇത് പ്രാപ്തമാക്കുന്ന ജീൻ ഫ്ലോയെക്കുറിച്ചുള്ള പഠനങ്ങളും ഇതിൽ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു.
-
താരതമ്യ ജീനോമിക്സ്
താരതമ്യ ജീനോമിക്സ് എന്നാൽ വ്യത്യസ്ത ജീവിവർഗങ്ങളുടെ പൂർണ്ണമായ ജീനോം സീക്വൻസുകളും ഘടനകളും താരതമ്യം ചെയ്യുക എന്നാണ് അർത്ഥമാക്കുന്നത്.വിവിധ ജീവിവർഗങ്ങളിൽ സംരക്ഷിച്ചിരിക്കുന്നതോ വേർതിരിക്കുന്നതോ ആയ ക്രമ ഘടനകളും ഘടകങ്ങളും തിരിച്ചറിയുന്നതിലൂടെ ജീനോം തലത്തിൽ ജീവിവർഗങ്ങളുടെ പരിണാമം, ജീൻ പ്രവർത്തനം, ജീൻ റെഗുലേറ്ററി മെക്കാനിസം എന്നിവ വെളിപ്പെടുത്തുകയാണ് ഈ അച്ചടക്കം ലക്ഷ്യമിടുന്നത്.സാധാരണ താരതമ്യ ജീനോമിക്സ് പഠനത്തിൽ ജീൻ കുടുംബത്തിലെ വിശകലനങ്ങൾ, പരിണാമ വികസനം, മുഴുവൻ ജീനോം ഡ്യൂപ്ലിക്കേഷൻ, സെലക്ടീവ് മർദ്ദം മുതലായവ ഉൾപ്പെടുന്നു.
-
പരിണാമ ജനിതകശാസ്ത്രം
BMK R&D ടീമിൽ വർഷങ്ങളായി ശേഖരിച്ച വമ്പിച്ച അനുഭവത്തിന്റെ അടിസ്ഥാനത്തിലാണ് ജനസംഖ്യയും പരിണാമ ജനിതക വിശകലന പ്ലാറ്റ്ഫോം സ്ഥാപിച്ചത്.ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക്‌സിൽ പ്രാവീണ്യമില്ലാത്ത ഗവേഷകർക്ക് ഇത് ഒരു ഉപയോക്തൃ സൗഹൃദ ഉപകരണമാണ്.ഈ പ്ലാറ്റ്ഫോം ഫൈലോജെനെറ്റിക് ട്രീ നിർമ്മാണം, ലിങ്കേജ് അസന്തുലിതാവസ്ഥ വിശകലനം, ജനിതക വൈവിധ്യ വിലയിരുത്തൽ, സെലക്ടീവ് സ്വീപ്പ് വിശകലനം, ബന്ധുത്വ വിശകലനം, പിസിഎ, ജനസംഖ്യാ ഘടന വിശകലനം മുതലായവ ഉൾപ്പെടെയുള്ള അടിസ്ഥാന പരിണാമ ജനിതകവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട അടിസ്ഥാന വിശകലനം സാധ്യമാക്കുന്നു.
-
ഹൈ-സി അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ജീനോം അസംബ്ലി
പ്രോക്‌സിമിറ്റി അധിഷ്‌ഠിത ഇടപെടലുകളും ഹൈ-ത്രൂപുട്ട് സീക്വൻസിംഗും സംയോജിപ്പിച്ച് ക്രോമസോം കോൺഫിഗറേഷൻ ക്യാപ്‌ചർ ചെയ്യാൻ രൂപകൽപ്പന ചെയ്‌ത ഒരു രീതിയാണ് Hi-C.ഈ ഇടപെടലുകളുടെ തീവ്രത ക്രോമസോമുകളിലെ ശാരീരിക അകലവുമായി പ്രതികൂലമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നുവെന്ന് വിശ്വസിക്കപ്പെടുന്നു.അതിനാൽ, ഹൈ-സി ഡാറ്റയ്ക്ക് ഒരു ഡ്രാഫ്റ്റ് ജീനോമിൽ കൂട്ടിച്ചേർത്ത ശ്രേണികളുടെ ക്ലസ്റ്ററിംഗും ക്രമപ്പെടുത്തലും ഓറിയന്റിംഗും ഒരു നിശ്ചിത എണ്ണം ക്രോമസോമുകളിൽ ആങ്കർ ചെയ്യാനും കഴിയും.ജനസംഖ്യാടിസ്ഥാനത്തിലുള്ള ജനിതക ഭൂപടത്തിന്റെ അഭാവത്തിൽ ക്രോമസോം തലത്തിലുള്ള ജീനോം അസംബ്ലിയെ ഈ സാങ്കേതികവിദ്യ ശക്തിപ്പെടുത്തുന്നു.ഓരോ ജീനോമിനും ഒരു ഹൈ-സി ആവശ്യമാണ്.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: ഇല്ലുമിന നോവസെക് പ്ലാറ്റ്ഫോം / DNBSEQ
-
പ്ലാന്റ്/ആനിമൽ ഡി നോവോ ജീനോം സീക്വൻസിങ്
ഡി നോവോഒരു റഫറൻസ് ജീനോമിന്റെ അഭാവത്തിൽ സീക്വൻസിംഗ് സാങ്കേതികവിദ്യകൾ ഉപയോഗിച്ച് ഒരു സ്പീഷിസിന്റെ മുഴുവൻ ജീനോമും നിർമ്മിക്കുന്നതിനെയാണ് സീക്വൻസിങ് എന്ന് പറയുന്നത്.മൂന്നാം തലമുറ സീക്വൻസിംഗ് സാങ്കേതികവിദ്യകളുടെ വായനാ ദൈർഘ്യത്തിലെ ശ്രദ്ധേയമായ പുരോഗതി, സങ്കീർണ്ണമായ ജീനോമുകൾ കൂട്ടിച്ചേർക്കുന്നതിൽ പുതിയ അവസരങ്ങൾ കൊണ്ടുവന്നു, ഉയർന്ന ഹെറ്ററോസൈഗോസിറ്റി, ഉയർന്ന ആവർത്തന മേഖലകളുടെ അനുപാതം, പോളിപ്ലോയിഡുകൾ മുതലായവ. പതിനായിരക്കണക്കിന് കിലോബേസ് ലെവലിൽ റീഡ് ലെങ്ത് ഉപയോഗിച്ച്, ഈ സീക്വൻസിംഗ് റീഡുകൾ പ്രാപ്തമാക്കുന്നു. ആവർത്തന ഘടകങ്ങൾ, അസാധാരണമായ ജിസി ഉള്ളടക്കമുള്ള പ്രദേശങ്ങൾ, മറ്റ് വളരെ സങ്കീർണ്ണമായ പ്രദേശങ്ങൾ എന്നിവ പരിഹരിക്കുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq പ്ലാറ്റ്ഫോം
-
ഹ്യൂമൻ ഹോൾ എക്സോം സീക്വൻസിങ്
ഹോൾ എക്സോം സീക്വൻസിംഗ് (WES) എന്നത് രോഗം ഉണ്ടാക്കുന്ന മ്യൂട്ടേഷനുകൾ തിരിച്ചറിയുന്നതിനുള്ള ചെലവ് കുറഞ്ഞ സീക്വൻസിങ് തന്ത്രമായി കണക്കാക്കപ്പെടുന്നു.എക്സോണുകൾ മുഴുവൻ ജീനോമിന്റെ ഏകദേശം 1.7% മാത്രമേ എടുക്കുന്നുള്ളൂവെങ്കിലും, ഇത് പ്രോട്ടീൻ പ്രവർത്തനങ്ങളുടെ പ്രൊഫൈലിനെ നേരിട്ട് പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു.മനുഷ്യ ജീനോമിൽ, രോഗവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട 85% ത്തിലധികം മ്യൂട്ടേഷനുകളും പ്രോട്ടീൻ കോഡിംഗ് മേഖലയിൽ സംഭവിക്കുന്നതായി റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യപ്പെട്ടിട്ടുണ്ട്.
BMKGENE വിവിധ ഗവേഷണ ലക്ഷ്യങ്ങൾ കൈവരിക്കുന്നതിന് ലഭ്യമായ വിവിധ എക്‌സോൺ ക്യാപ്‌ചറിംഗ് തന്ത്രങ്ങളോടുകൂടിയ സമഗ്രവും വഴക്കമുള്ളതുമായ ഹ്യൂമൻ ഹോൾ എക്സോം സീക്വൻസിംഗ് സേവനങ്ങൾ വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina NovaSeq പ്ലാറ്റ്ഫോം
-
സ്പെസിഫിക്-ലോക്കസ് ആംപ്ലിഫൈഡ് ഫ്രാഗ്മെന്റ് സീക്വൻസിങ് (SLAF-Seq)
ഹൈ-ത്രൂപുട്ട് ജനിതകമാറ്റം, പ്രത്യേകിച്ച് വലിയ തോതിലുള്ള ജനസംഖ്യയിൽ, ജനിതക അസോസിയേഷൻ പഠനങ്ങളിലെ ഒരു അടിസ്ഥാന ഘട്ടമാണ്, ഇത് പ്രവർത്തനപരമായ ജീൻ കണ്ടെത്തൽ, പരിണാമ വിശകലനം മുതലായവയ്ക്ക് ജനിതക അടിസ്ഥാനം നൽകുന്നു. ആഴത്തിലുള്ള മുഴുവൻ ജീനോം പുനഃക്രമീകരണത്തിന് പകരം, പ്രാതിനിധ്യം കുറയ്ക്കുന്നു (RRGS. ) ജനിതക മാർക്കർ കണ്ടെത്തലിൽ ന്യായമായ കാര്യക്ഷമത നിലനിർത്തിക്കൊണ്ട് ഓരോ സാമ്പിളിനും സീക്വൻസിങ് ചെലവ് കുറയ്ക്കുന്നതിനാണ് അവതരിപ്പിക്കുന്നത്.നൽകിയിരിക്കുന്ന വലുപ്പ പരിധിക്കുള്ളിൽ നിയന്ത്രണ ശകലം വേർതിരിച്ചെടുക്കുന്നതിലൂടെയാണ് ഇത് സാധാരണയായി നേടുന്നത്, ഇതിനെ കുറച്ച പ്രാതിനിധ്യ ലൈബ്രറി (RRL) എന്ന് വിളിക്കുന്നു.പ്രത്യേക-ലോകസ് ആംപ്ലിഫൈഡ് ഫ്രാഗ്മെന്റ് സീക്വൻസിങ് (SLAF-Seq) എന്നത് ഒരു റഫറൻസ് ജീനോം ഉപയോഗിച്ചോ അല്ലാതെയോ എസ്എൻപി ജനിതകരൂപീകരണത്തിനുള്ള സ്വയം വികസിപ്പിച്ച തന്ത്രമാണ്.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina NovaSeq പ്ലാറ്റ്ഫോം -
ഇല്ലുമിനയും ബിജിഐയും
സീക്വൻസിംഗ് ബൈ സിന്തസിസ് (എസ്‌ബി‌എസ്) അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ഇലുമിന സീക്വൻസിംഗ് സാങ്കേതികവിദ്യ, ആഗോളതലത്തിൽ സ്വീകരിച്ച NGS നവീകരണമാണ്, ഇത് ലോകത്തിലെ 90% സീക്വൻസിംഗ് ഡാറ്റയും സൃഷ്ടിക്കുന്നതിന് ഉത്തരവാദിയാണ്.ഓരോ ഡിഎൻ‌ടി‌പിയും ചേർക്കുമ്പോൾ ഫ്ലൂറസെന്റ് ലേബൽ ചെയ്‌ത റിവേഴ്‌സിബിൾ ടെർമിനേറ്ററുകൾ ഇമേജിംഗ് ചെയ്യുന്നത് എസ്‌ബി‌എസിന്റെ തത്വത്തിൽ ഉൾപ്പെടുന്നു, തുടർന്ന് അടുത്ത ബേസ് സംയോജിപ്പിക്കാൻ അനുവദിക്കുന്നതിന് ക്ലീവ് ചെയ്യുന്നു.ഓരോ സീക്വൻസിംഗ് സൈക്കിളിലും നാല് റിവേഴ്‌സിബിൾ ടെർമിനേറ്റർ-ബൗണ്ട് dNTP-കൾ ഉള്ളതിനാൽ, സ്വാഭാവിക മത്സരം ഇൻകോർപ്പറേഷൻ ബയസ് കുറയ്ക്കുന്നു.വൈവിധ്യമാർന്ന ഈ സാങ്കേതികവിദ്യ ഒറ്റ-വായനയും പെയർ-എൻഡ് ലൈബ്രറികളും പിന്തുണയ്ക്കുന്നു.ഇല്ലുമിന സീക്വൻസിംഗിന്റെ ഉയർന്ന ത്രൂപുട്ട് കഴിവുകളും കൃത്യതയും അതിനെ ജീനോമിക്സ് ഗവേഷണത്തിലെ ഒരു മൂലക്കല്ലായി സ്ഥാപിക്കുന്നു, സമാനതകളില്ലാത്ത വിശദാംശങ്ങളോടും കാര്യക്ഷമതയോടും കൂടി ജീനോമുകളുടെ സങ്കീർണതകൾ അനാവരണം ചെയ്യാൻ ശാസ്ത്രജ്ഞരെ പ്രാപ്തരാക്കുന്നു.
BGI വികസിപ്പിച്ചെടുത്ത DNBSEQ മറ്റൊരു നൂതന NGS സാങ്കേതികവിദ്യയാണ്, അത് സീക്വൻസിംഗ് ചെലവ് കൂടുതൽ കുറയ്ക്കാനും ത്രൂപുട്ട് വർദ്ധിപ്പിക്കാനും കഴിഞ്ഞു.ഡിഎൻബിഎസ്ഇക്യു ലൈബ്രറികൾ തയ്യാറാക്കുന്നതിൽ ഡിഎൻഎ വിഘടനം, എസ്എസ്ഡിഎൻഎ തയ്യാറാക്കൽ, ഡിഎൻഎ നാനോബോളുകൾ (ഡിഎൻബി) ലഭിക്കുന്നതിന് റോളിംഗ് സർക്കിൾ ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്നു.ഇവ പിന്നീട് ഒരു സോളിഡ് പ്രതലത്തിൽ കയറ്റുകയും പിന്നീട് കോമ്പിനേറ്റോറിയൽ പ്രോബ്-ആങ്കർ സിന്തസിസ് (cPAS) വഴി ക്രമപ്പെടുത്തുകയും ചെയ്യുന്നു.
ഞങ്ങളുടെ പ്രീ-മേയ്ഡ് ലൈബ്രറി സീക്വൻസിങ് സേവനം ഉപഭോക്താക്കൾക്ക് അവരുടെ വിവിധ സ്രോതസ്സുകളിൽ നിന്ന് (mRNA, മുഴുവൻ ജീനോം, ആംപ്ലിക്കൺ, മറ്റുള്ളവയിൽ) നിന്ന് അവരുടെ സീക്വൻസിങ് ലൈബ്രറികൾ തയ്യാറാക്കാൻ സഹായിക്കുന്നു.തുടർന്ന്, ഈ ലൈബ്രറികൾ ഇലുമിനയിലോ BGI പ്ലാറ്റ്‌ഫോമുകളിലോ ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണത്തിനും സീക്വൻസിംഗിനുമായി ഞങ്ങളുടെ സീക്വൻസിംഗ് സെന്ററുകളിലേക്ക് ഷിപ്പുചെയ്യാനാകും.
