ഫംഗൽ ജീനോം
സേവന നേട്ടങ്ങൾ
● വ്യത്യസ്ത ഗവേഷണ ലക്ഷ്യങ്ങൾക്കായി ഒന്നിലധികം ക്രമപ്പെടുത്തൽ തന്ത്രങ്ങൾ ലഭ്യമാണ്
● 10,000-ലധികം പെൻ-കംപ്ലീറ്റ് ജീനോം അസംബിൾ ചെയ്ത ഫംഗസ് ജീനോം അസംബ്ലിയിൽ ഉയർന്ന പരിചയസമ്പന്നൻ.
● കൂടുതൽ നിർദ്ദിഷ്ട ഗവേഷണ ആവശ്യങ്ങൾ നിറവേറ്റുന്ന പ്രൊഫഷണൽ വിൽപ്പനാനന്തര സാങ്കേതിക പിന്തുണ ടീം.
സേവന സവിശേഷതകൾ
| സേവനം | സീക്വൻസിങ് സ്ട്രാറ്റജി | ഗുണനിലവാരം ഉറപ്പ് | കണക്കാക്കിയ തിരിയുന്ന സമയം |
| ഫംഗൽ ഫൈൻ മാപ്പ് | ഇല്ലുമിന 50X+നാനോപോർ 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 പ്രവൃത്തി ദിനങ്ങൾ |
| PacBio HiFi 30X | |||
| ഫംഗൽ പെൻ-പൂർണ്ണമായ മാപ്പ് | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | ക്രോമസോം ആങ്കറിംഗ് അനുപാതം> 90% | 45 പ്രവൃത്തി ദിനങ്ങൾ |
ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക്സ് വിശകലനങ്ങൾ
● റോ ഡാറ്റ ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണം
● ജീനോം അസംബ്ലി
● ജീനോം ഘടക വിശകലനം
● ജീൻ ഫംഗ്‌ഷൻ വ്യാഖ്യാനം
● താരതമ്യ ജീനോമിക് വിശകലനം
സാമ്പിൾ ആവശ്യകതകളും ഡെലിവറിയും
സാമ്പിൾ ആവശ്യകതകൾ:
വേണ്ടിഡിഎൻഎ എക്സ്ട്രാക്റ്റുകൾ:
| സാമ്പിൾ തരം | തുക | ഏകാഗ്രത | ശുദ്ധി |
| ഡിഎൻഎ എക്സ്ട്രാക്റ്റുകൾ | ＞ 1.2 μg | ＞ 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
ടിഷ്യു സാമ്പിളുകൾക്കായി:
| സാമ്പിൾ തരം | ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന സാമ്പിൾ ചികിത്സ | സാമ്പിൾ സംഭരണവും കയറ്റുമതിയും |
| ഏകകോശ ഫംഗസ് | സൂക്ഷ്മദർശിനിയിൽ യീസ്റ്റ് നിരീക്ഷിക്കുകയും അവയുടെ എക്സ്പോണൻഷ്യൽ ഘട്ടത്തിൽ ശേഖരിക്കുകയും ചെയ്യുക സംസ്കാരം (ഏകദേശം 3-4.5e9 സെല്ലുകൾ അടങ്ങിയത്) 1.5 അല്ലെങ്കിൽ 2 മില്ലി എപ്പൻഡോർഫിലേക്ക് മാറ്റുക.(ഐസിൽ സൂക്ഷിക്കുക) ബാക്ടീരിയ ശേഖരിക്കാനും സൂപ്പർനാറ്റന്റ് ശ്രദ്ധാപൂർവ്വം നീക്കം ചെയ്യാനും 14000 ഗ്രാം 1 മിനിറ്റ് ട്യൂബ് സെൻട്രിഫ്യൂജ് ചെയ്യുക ട്യൂബ് അടച്ച് കുറഞ്ഞത് 1-3 മണിക്കൂറെങ്കിലും ദ്രാവക നൈട്രജനിൽ ബാക്ടീരിയയെ ഫ്രീസ് ചെയ്യുക.ട്യൂബ് -80 ℃ ഫ്രിഡ്ജിൽ സൂക്ഷിക്കുക. | 3-4 മണിക്കൂർ ദ്രാവക നൈട്രജനിൽ സാമ്പിളുകൾ ഫ്രീസ് ചെയ്ത് ദ്രവ നൈട്രജൻ അല്ലെങ്കിൽ -80 ഡിഗ്രി മുതൽ ദീർഘകാല റിസർവേഷനിൽ സൂക്ഷിക്കുക.ഡ്രൈ-ഐസ് ഉള്ള സാമ്പിൾ ഷിപ്പിംഗ് ആവശ്യമാണ്. |
| മാക്രോ ഫംഗസ് | സജീവമായി വളരുന്ന ഘട്ടത്തിൽ ടിഷ്യു ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു. ടിഷ്യു എൻഡോടോക്സിൻ രഹിത വെള്ളം ഉപയോഗിച്ച് കഴുകുക, തുടർന്ന് 70% എഥോണൽ. സാമ്പിൾ ക്രയോ ട്യൂബുകളിൽ സൂക്ഷിക്കുക. |
സർവീസ് വർക്ക് ഫ്ലോ
സാമ്പിൾ ഡെലിവറി
ലൈബ്രറി നിർമ്മാണം
സീക്വൻസിങ്
ഡാറ്റ വിശകലനം
വിൽപ്പനാനന്തര സേവനങ്ങൾ
1. ഫംഗൽ ജീനോമിക് ഘടകങ്ങളെക്കുറിച്ചുള്ള സർക്കോസ് ഡയഗ്രം
2. താരതമ്യ ജീനോമിക്സ് വിശകലനം: ഫൈലോജെനെറ്റിക് ട്രീ
