Фиоката за топлинска карта се користи за цртање на топлинска карта, која може да ги филтрира, нормализира и кластерира податоците од матрицата. Најмногу се користи за кластерска анализа на нивото на генска експресија помеѓу различни примероци.
Прикачување биолошки функции на секвенци во датотеката FASTA со порамнување на секвенците во базата на податоци, вклучувајќи NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam.
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) е алгоритам и програма за наоѓање региони со слични биолошки секвенци.Ги споредува овие секвенци со бази на податоци за секвенци и ја пресметува статистичката значајност.BLAST се состои од четири типа алатки засновани на типот на секвенца: blastn, lastp, blastx и tblastn.