Производи

Секвенционирање на РНК со едно јадро

Напредокот во зафаќањето на една клетка и техниката на изградба на индивидуална библиотека, комбинирана со секвенционирање со висок пропусен опсег овозможува проучување на генската експресија на основа клетка до клетка.Овозможува подлабока и комплетна системска анализа на сложени клеточни популации, во која во голема мера се избегнува маскирање на нивната хетерогеност со земање на просек од сите клетки.

Сепак, некои клетки не се погодни да се направат во едноклеточна суспензија, па затоа се потребни други методи за подготовка на примероци - екстракција на јадро од ткивата, односно јадрото директно се извлекува од ткивата или клетката и се подготвува во еднојадрена суспензија за едно- клеточно секвенционирање.

BMK обезбедува услуга за секвенционирање на едноклеточна РНК базирана на 10× Genomics ChromiumTM.Оваа услуга е широко користена во студии за студии поврзани со болести, како што се диференцијација на имуните клетки, хетерогеност на туморот, развој на ткиво итн.

Просторен транскриптомски чип: 10× Геномика

Платформа: Illumina NovaSeq платформа

Контактирајте не

Детали за услугата

Биоинформатика

Демо резултати

Технички принцип

Изолацијата на јадрата се постигнува со 10× Genomics ChromiumTM, кој се состои од осумканален микрофлуиден систем со двојни вкрстувања.Во овој систем, зрнца од гел со баркодови и прајмер, ензими и едно јадро се инкапсулирани во капка масло со големина на нанолитар, генерирајќи Гел Беад-во-емулзија (GEM).Откако ќе се формира ГЕМ, во секој ГЕМ се врши лиза на клетките и ослободување на баркодови.mRNA се транскрибираат обратно во cDNA молекули со 10× баркодови и UMI, кои понатаму се предмет на стандардна конструкција на библиотека за секвенционирање.

Ткивото не е погодно за подготовка на едноклеточна суспензија

Клетка / Ткиво	Причина
Несвежено замрзнато ткиво	Не може да се добијат свежи или долго зачувани организации
Мускулни клетки, мегакариоцити, маснотии…	Дијаметарот на ќелијата е преголем за да влезе во инструментот
Црниот дроб…	Премногу кревка за да се скрши, не може да разликува поединечни клетки
Невронска клетка, мозок…	Почувствителен, лесен за стрес, ќе ги промени резултатите од секвенционирањето
Панкреас, тироидна жлезда…	Богата со ендогени ензими, кои влијаат на производството на едноклеточна суспензија

Еднојадро наспроти Едноклетка

Едно-јадро	Едноклеточни
Неограничен дијаметар на ќелијата	Дијаметар на ќелија: 10-40 μm
Материјалот може да биде замрзнато ткиво	Материјалот мора да биде свежо ткиво
Низок стрес на замрзнатите клетки	Ензимскиот третман може да предизвика клеточна стресна реакција
Не треба да се отстрануваат црвените крвни зрнца	Црвените крвни зрнца треба да се отстранат
Нуклеарните изразуваат биоинформации	Целата клетка изразува биоинформации