-
Метатранскриптомско секвенционирање
Секвенционирањето на метатранскриптом ја идентификува генската експресија на микробите (и еукариотите и прокариотите) во природните средини (т.е. почва, вода, море, измет и цревата). на видови, анализа на функционално збогатување на различно изразени гени и друго.
Платформа: Illumina NovaSeq платформа
-
Габичен геном
Технологиите на биомаркер обезбедуваат истражување на геномот, фин геном и целосен геном на пена на габи во зависност од специфичната цел на истражувањето.Секвенционирањето на геномот, склопувањето и функционалната прибелешка може да се постигнат со комбинирање на секвенционирање од следната генерација + секвенционирање од трета генерација за да се постигне склопување на геном на високо ниво.Технологијата Hi-C, исто така, може да се користи за да се олесни склопувањето на геномот на ниво на хромозом.
Платформа:Продолжение на PacBio II
Nanopor PromethION P48
Платформа Illumina NovaSeq
-
Алатки
BMKCloud е водечка биоинформатска платформа која обезбедува еднократно решение за геномски програми, на кои им веруваат истражувачите во различни области, вклучувајќи медицински, земјоделски, еколошки итн. , компјутерски ресурси, јавна база на податоци, биоинформтички онлајн курсеви итн. BMKCloud има различни често користени биоинформатички алатки кои вклучуваат генетска прибелешка, еволутивни генетски алатки, ncRNA, контрола на квалитетот на податоците, склопување, усогласување, екстракција на податоци, мутации, статистика, генератор на бројки, секвенца анализа итн.
-
Целосен геном на бактерии
Biomarker Technologies обезбедува услуга за секвенционирање за конструирање на целосен геном на бактерии со нула празнина.Главниот работен тек на комплетната конструкција на геномот на бактерии вклучува секвенционирање од трета генерација, склопување, функционална прибелешка и напредна биоинформатска анализа што исполнува специфични истражувачки цели.Посеопфатното профилирање на геномот на бактериите го поттикнува откривањето на фундаменталните механизми кои се во основата на нивните биолошки процеси, што исто така може да обезбеди вредна референца за геномски истражувања кај повисоките еукариотски видови
Платформа:Нанопор PromethION P48 + Illumina NovaSeq платформа
Продолжение на PacBio II
-
мала РНК
Малите РНК се тип на кратка некодирачка РНК со просечна должина од 18-30 nt, вклучувајќи miRNA, siRNA и piRNA.Овие мали РНК масовно се пријавени дека се вклучени во различни биолошки процеси како што се разградување на мРНК, инхибиција на транслација, формирање на хетерохроматин, итн. секвенционирање анализа платформа се состои од стандардна анализа и напредни податоци за рударство.Врз основа на податоците од RNA-seq, стандардната анализа може да постигне идентификација и предвидување на miRNA, предвидување на целниот ген на miRNA, анализа на прибелешки и изразување.Напредната анализа овозможува приспособено пребарување и екстракција на miRNA, генерирање на Венов дијаграм, градење на miRNA и целна генска мрежа.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS е целосна платформа за анализа на ресеквенционирање на геном, која е развиена врз основа на богато искуство во Biomarker Technologies.Оваа лесна за употреба платформа овозможува брзо поднесување на интегриран работен тек на анализа со едноставно поставување на неколку основни параметри, кои одговараат на податоците за секвенционирање на ДНК генерирани и од платформата Illumina и од платформата за секвенционирање BGI.Оваа платформа е распоредена на компјутерски сервер со високи перформанси, кој овозможува високо ефикасна анализа на податоци во многу ограничено време.Персонализираното рударство на податоци е достапно врз основа на стандардна анализа, вклучувајќи барање за мутирани гени, дизајн на прајмер PCR, итн.
-
mRNA (Референца)
Транскриптомот е врската помеѓу геномската генетска информација и протеомот на биолошката функција.Регулацијата на транскрипциското ниво е најважниот и најпроучен начин на регулација на организмите.Секвенционирањето на транскриптом може да го секвенционира транскриптомот во кое било време или под било кој услов, со резолуција точна на еден нуклеотид. Може динамички да го одразува нивото на генска транскрипција, истовремено да ги идентификува и квантифицира ретките и нормалните транскрипти и да обезбеди структурни информации за примерок специфични преписи.
Во моментов, технологијата за секвенционирање на транскриптом е широко користена во агрономијата, медицината и другите истражувачки полиња, вклучувајќи регулација на развојот на животните и растенијата, адаптација на животната средина, имунолошка интеракција, локализација на гените, генетска еволуција на видовите и откривање на тумори и генетски болести.
-
Метагеномика (NGS)
Оваа платформа за анализа е дизајнирана за анализа на метагеномски податоци од пушка врз основа на долгогодишно искуство.Се состои од интегриран работен тек кој содржи различни вообичаено потребни метагеномски анализи, вклучувајќи обработка на податоци, студии на ниво на видови, студии на ниво на генска функција, поврзување на метагеном, итн. , поставување параметри, персонализирано генерирање фигури итн.
-
LncRNA
Долгите некодирачки РНК (lncRNA) се вид на транскрипти со должина подолга од 200 nt, кои не се способни да кодираат протеини.Акумулативните докази сугерираат дека повеќето од lncRNAs имаат голема веројатност да бидат функционални.Технологиите за секвенционирање со висок пропус и алатките за биоинформатска анализа нè овластуваат поефикасно да ги откриваме секвенците на lncRNA и информациите за позиционирање и нè наведуваат да откриеме lncRNA со клучни регулаторни функции.BMKCloud е горд што им нуди на нашите клиенти платформа за анализа на секвенционирање lncRNA за да постигне брза, сигурна и флексибилна lncRNA анализа.
-
GWAS
Студијата за асоцијација на ниво на геном (GWAS) има за цел да ги идентификува генетските варијанти (генотип) кои се поврзани со специфични особини (фенотип).Студиите на GWA истражуваат генетски маркери вкрстени во целиот геном на голем број индивидуи и предвидуваат асоцијации на генотип-фенотип преку статистичка анализа на ниво на популација.Ресеквенцирањето на целиот геном потенцијално може да ги открие сите генетски варијанти.Спојувајќи се со фенотипски податоци, GWAS може да се обработи за да се идентификуваат SNP поврзани со фенотип, QTL и кандидатски гени, што силно го поддржува модерното одгледување животни/растенија.SLAF е самостојно развиена поедноставена стратегија за секвенционирање на геном, која открива дистрибуирани маркери низ целиот геном, SNP.Овие SNP, како молекуларни генетски маркери, може да се обработат за студии за асоцијација со целни особини.Тоа е рентабилна стратегија за идентификување на сложени карактеристики поврзани со генетските варијации.
-
Нанопорна транскриптомика со целосна должина
Сложените и променливи алтернативни изоформи во организмите се важни генетски механизми за регулирање на генската експресија и разновидноста на протеините.Точната идентификација на структурите на транскриптите е основа за длабинско проучување на шемите на регулација на генската експресија.Платформата за секвенционирање нанопори успешно ја донесе транскриптомската студија на ниво на изоформа.Оваа платформа за анализа е дизајнирана да ги анализира податоците од RNA-Seq генерирани на платформата Nanopore врз основа на референтниот геном, со што се постигнуваат квалитативни и квантитативни анализи и на ниво на ген и на ниво на транскрипти.
-
circ-RNA
Кружна РНК (цирцРНК) е тип на некодирачка РНК, која неодамна беше откриено дека игра витална улога во регулаторните мрежи вклучени во развојот, отпорноста на животната средина итн. Различно од линеарните РНК молекули, на пр. mRNA, lncRNA, 3' и 5' краевите на circRNA се споени заедно за да формираат кружна структура, која ги спасува од дигестијата на егзонуклеазата и е постабилна од повеќето линеарни РНК.Утврдено е дека CircRNA има различни функции во регулирањето на генската експресија.CircRNA може да работи како ceRNA, која конкурентно ја врзува miRNA, позната како miRNA сунѓер.Платформата за анализа на секвенционирање на CircRNA ја поттикнува анализата на структурата и изразот на цирцРНК, предвидувањето на целта и заедничката анализа со други видови на молекули на РНК
