-
Секвенционирање на имунопреципитација на хроматин (ChIP-seq)
ChIP-Seq обезбедува геномски профилирање на цели на ДНК за модификација на хистони, фактори на транскрипција и други протеини поврзани со ДНК.Тој ја комбинира селективноста на имуно-преципитацијата на хроматин (ChIP) за враќање на специфичните протеинско-ДНК комплекси, со моќта на секвенционирањето на следната генерација (NGS) за секвенционирање со висок пропуст на обновената ДНК.Дополнително, бидејќи протеинско-ДНК комплексите се обновуваат од живите клетки, местата за врзување може да се споредат во различни типови на клетки и ткива, или под различни услови.Апликациите се движат од транскрипциска регулација до развојни патишта до механизми на болеста и пошироко.
Платформа: Illumina NovaSeq платформа
-
Метагеномско секвенционирање -NGS
Метагеномот се однесува на збирка од вкупен генетски материјал на мешана заедница на организми, како што се метагеном на животната средина, човечки метагеном, итн. Содржи геноми на микроорганизми кои можат да се одгледуваат и не се одгледуваат.Метагеномското секвенционирање е молекуларна алатка која се користи за анализа на мешаните геномски материјали извлечени од примероците од животната средина, која обезбедува детални информации за разновидноста и изобилството на видовите, структурата на популацијата, филогенетскиот однос, функционалните гени и корелацијата мрежа со факторите на животната средина.
Платформа:Платформа Illumina NovaSeq
-
Метагеномско секвенционирање-Нанопор
Метагеномијата е молекуларна алатка што се користи за анализа на мешаните геномски материјали извлечени од примероци од животната средина, која обезбедува детални информации за разновидноста и изобилството на видовите, структурата на популацијата, филогенетскиот однос, функционалните гени и мрежата на корелација со факторите на животната средина итн. Платформите за секвенционирање нанопори неодамна беа воведени до метагеномски студии.Неговите извонредни перформанси во должината на читање во голема мера ја подобрија метагеномската анализа на долниот тек, особено склопувањето на метагеномот.Искористувајќи ги предностите на должината на читање, метагеномската студија заснована на Nanopore може да постигне поконтинуирано склопување во споредба со метагеномијата со пушки.Објавено е дека метагеномијата базирана на Нанопор успешно генерира целосни и затворени бактериски геноми од микробиомите (Moss, EL, et. al.,Nature Biotech, 2020)
Платформа:Nanopor PromethION P48
-
Секвенционирање на бисулфит на целиот геном
ДНК метилацијата на петтата позиција во цитозин (5-mC) има фундаментално влијание врз генската експресија и клеточната активност.Абнормалните обрасци на метилација се поврзани со неколку состојби и болести, како што е ракот.WGBS стана златен стандард за проучување на метилацијата на целиот геном при резолуција на една база.
Платформа: Illumina NovaSeq платформа
-
Анализа за хроматин достапен до транспозаза со секвенционирање со висок пропусен опсег (ATAC-seq)
ATAC-seq е метод за секвенционирање со висок процент за анализа на достапноста на хроматин ширум геномот, што е важно за глобалната епигенетска контрола на генската експресија.Адаптери за секвенционирање се вметнуваат во отворени хроматински региони со хиперактивна Tn5 транспозаза.По PCR засилување, се конструира библиотека за секвенционирање.Сите отворени хроматински региони можат да се добијат под специфична просторно-временска состојба, не само ограничени на местата за врзување на факторот на транскрипција или одреден регион модифициран со хистон.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Подединицата на 16S и 18S rRNA која содржи и високо конзервирани и хиперпроменливи региони е совршен молекуларен отпечаток за идентификација на прокариотски и еукариотски организми.Искористувајќи ги предностите на секвенционирањето, овие ампликони може да се таргетираат врз основа на зачуваните делови и хиперпроменливите региони може целосно да се карактеризираат за микробна идентификација што придонесува за студии кои опфаќаат анализа на микробиолошка разновидност, таксономија, филогенија итн. Едномолекула во реално време (SMRT ) секвенционирањето на платформата PacBio овозможува добивање на високо прецизни долги отчитувања, кои би можеле да опфатат ампликони со целосна должина (приближно 1,5 Kb).Проширениот поглед на генетското поле значително ја подобри резолуцијата во прибелешката на видовите во заедницата на бактерии или габи.
Платформа:Продолжение на PacBio II
-
16S/18S/ITS Секвенционирање на засилувачи-NGS
Секвенционирањето на ампликони 16S/18S/ITS има за цел да ја открие филогенијата, таксономијата и изобилството на видови во микробната заедница со истражување на PCR производи на генетски маркери за домаќинство кои содржат и високоразговорени и хиперпроменливи делови.Воведувањето на овие совршени молекуларни отпечатоци од прсти од Woeses et al, (1977) го поттикнува профилирањето на микробиомот без изолација.Секвенционирањето на 16S (бактерии), 18S (габи) и внатрешен транскрибиран простор (ITS, габи) овозможува идентификација на обилните видови, како и на ретки и неидентификувани видови.Оваа технологија стана широко применета и главна алатка за идентификација на диференцијален микробиолошки состав во различни средини, како што се човечка уста, црева, измет итн.
Платформа:Платформа Illumina NovaSeq
-
Повторно секвенционирање на целиот геном на бактериски и габички
Повторното секвенционирање на целиот геном на бактерии и габи е критична алатка за комплетирање на геномите на познатите бактерија и габи, како и за споредување на повеќе геноми или за мапирање на геномите на нови организми.Од голема важност е да се секвенционираат цели геноми на бактерија и габи со цел да се генерираат точни референтни геноми, да се направи микробиолошка идентификација и други компаративни студии на геномот.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Секвенционирање на засилувачи на PacBio-целосна должина 16S/18S/ITS
Платформата Amplicon (16S/18S/ITS) е развиена со долгогодишно искуство во анализа на проекти за микробиолошка разновидност, која содржи стандардизирана основна анализа и персонализирана анализа: основната анализа ја покрива содржината на мејнстрим анализа на тековните микробиолошки истражувања, содржината на анализата е богата и сеопфатна, а резултатите од анализата се претставени во форма на проектни извештаи;Содржината на персонализираната анализа е разновидна.Може да се изберат примероци и параметрите може да се постават флексибилно во согласност со основниот извештај за анализа и целта на истражувањето, за да се реализираат персонализираните барања.Оперативен систем Windows, едноставен и брз.
-
PacBio-целосна транскриптом (не-референца)
Земајќи ги податоците за секвенционирање на изоформи на Pacific Biosciences (PacBio) како влез, оваа апликација може да идентификува секвенци на транскрипти со целосна должина (без склопување).Со мапирање на секвенци со целосна должина против референтниот геном, транскриптите може да се оптимизираат со познати гени, транскрипти, региони за кодирање итн. Во овој случај, може да се постигне попрецизна идентификација на структурите на mRNA, како што е алтернативно спојување итн.Заедничката анализа со податоците за секвенционирање на транскриптомите NGS овозможува посеопфатна прибелешка и попрецизно квантифицирање во изразот на ниво на транскрипција, што во голема мера има корист низводно диференцијално изразување и функционална анализа.
-
Секвенционирање на бисулфит со намалена застапеност (RRBS)
Истражувањето за метилација на ДНК отсекогаш било жешка тема во истражувањето на болестите и е тесно поврзано со генската експресија и фенотипските особини.RRBS е точен, ефикасен и економичен метод за истражување на метилација на ДНК.Збогатувањето на промотерските и CpG островските региони со ензимско расцепување (Msp I), во комбинација со секвенционирање на бисулфит, обезбедува детекција на метилација на ДНК со висока резолуција.
Платформа: Illumina NovaSeq платформа
-
Секвенционирање на прокариотска mRNA
Секвенционирањето на mRNA го поттикнува сеопфатното профилирање на сите транскрипти на mRNA во клетките под специфични услови.Оваа врвна технологија служи како моќна алатка, откривајќи сложени профили на генска експресија, генски структури и молекуларни механизми поврзани со различни биолошки процеси.Широко прифатено во фундаменталните истражувања, клиничката дијагностика и развојот на лекови, секвенционирањето на mRNA нуди увид во сложеноста на клеточната динамика и генетската регулација.Нашата обработка на примерок од прокариотска мРНК е прилагодена за прокариотски транскриптоми, што вклучува намалување на рРНК и подготовка на насочена библиотека.
Платформа: Illumina NovaSeq X
