-
Метагеномско секвенционирање -NGS
Метагеномот се однесува на збирка од вкупен генетски материјал на мешана заедница на организми, како што се метагеном на животната средина, човечки метагеном, итн. Содржи геноми на микроорганизми кои можат да се одгледуваат и не се одгледуваат.Метагеномското секвенционирање е молекуларна алатка која се користи за анализа на мешаните геномски материјали извлечени од примероците од животната средина, која обезбедува детални информации за разновидноста и изобилството на видовите, структурата на популацијата, филогенетскиот однос, функционалните гени и корелацијата мрежа со факторите на животната средина.
Платформа:Платформа Illumina NovaSeq
-
Метагеномско секвенционирање-Нанопор
Метагеномијата е молекуларна алатка што се користи за анализа на мешаните геномски материјали извлечени од примероци од животната средина, која обезбедува детални информации за разновидноста и изобилството на видовите, структурата на популацијата, филогенетскиот однос, функционалните гени и мрежата на корелација со факторите на животната средина итн. Платформите за секвенционирање нанопори неодамна беа воведени до метагеномски студии.Неговите извонредни перформанси во должината на читање во голема мера ја подобрија метагеномската анализа на долниот тек, особено склопувањето на метагеномот.Искористувајќи ги предностите на должината на читање, метагеномската студија заснована на Nanopore може да постигне поконтинуирано склопување во споредба со метагеномијата со пушки.Објавено е дека метагеномијата базирана на Нанопор успешно генерира целосни и затворени бактериски геноми од микробиомите (Moss, EL, et. al.,Nature Biotech, 2020)
Платформа:Nanopor PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Подединицата на 16S и 18S rRNA која содржи и високо конзервирани и хиперпроменливи региони е совршен молекуларен отпечаток за идентификација на прокариотски и еукариотски организми.Искористувајќи ги предностите на секвенционирањето, овие ампликони може да се таргетираат врз основа на зачуваните делови и хиперпроменливите региони може целосно да се карактеризираат за микробна идентификација што придонесува за студии кои опфаќаат анализа на микробиолошка разновидност, таксономија, филогенија итн. Едномолекула во реално време (SMRT ) секвенционирањето на платформата PacBio овозможува добивање на високо прецизни долги отчитувања, кои би можеле да опфатат ампликони со целосна должина (приближно 1,5 Kb).Проширениот поглед на генетското поле значително ја подобри резолуцијата во прибелешката на видовите во заедницата на бактерии или габи.
Платформа:Продолжение на PacBio II
-
16S/18S/ITS Секвенционирање на засилувачи-NGS
Секвенционирањето на ампликони 16S/18S/ITS има за цел да ја открие филогенијата, таксономијата и изобилството на видови во микробната заедница со истражување на PCR производи на генетски маркери за домаќинство кои содржат и високоразговорени и хиперпроменливи делови.Воведувањето на овие совршени молекуларни отпечатоци од прсти од Woeses et al, (1977) го поттикнува профилирањето на микробиомот без изолација.Секвенционирањето на 16S (бактерии), 18S (габи) и внатрешен транскрибиран простор (ITS, габи) овозможува идентификација на обилните видови, како и на ретки и неидентификувани видови.Оваа технологија стана широко применета и главна алатка за идентификација на диференцијален микробиолошки состав во различни средини, како што се човечка уста, црева, измет итн.
Платформа:Платформа Illumina NovaSeq
-
Повторно секвенционирање на целиот геном на бактериски и габички
Повторното секвенционирање на целиот геном на бактерии и габи е критична алатка за комплетирање на геномите на познатите бактерија и габи, како и за споредување на повеќе геноми или за мапирање на геномите на нови организми.Од голема важност е да се секвенционираат цели геноми на бактерија и габи со цел да се генерираат точни референтни геноми, да се направи микробиолошка идентификација и други компаративни студии на геномот.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Метатранскриптомско секвенционирање
Секвенционирањето на метатранскриптом ја идентификува генската експресија на микробите (и еукариотите и прокариотите) во природните средини (т.е. почва, вода, море, измет и цревата). на видови, анализа на функционално збогатување на различно изразени гени и друго.
Платформа: Illumina NovaSeq платформа
-
Габичен геном
Технологиите на биомаркер обезбедуваат истражување на геномот, фин геном и целосен геном на пена на габи во зависност од специфичната цел на истражувањето.Секвенционирањето на геномот, склопувањето и функционалната прибелешка може да се постигнат со комбинирање на секвенционирање од следната генерација + секвенционирање од трета генерација за да се постигне склопување на геном на високо ниво.Технологијата Hi-C, исто така, може да се користи за да се олесни склопувањето на геномот на ниво на хромозом.
Платформа:Продолжение на PacBio II
Nanopor PromethION P48
Платформа Illumina NovaSeq
-
Целосен геном на бактерии
Biomarker Technologies обезбедува услуга за секвенционирање за конструирање на целосен геном на бактерии со нула празнина.Главниот работен тек на комплетната конструкција на геномот на бактерии вклучува секвенционирање од трета генерација, склопување, функционална прибелешка и напредна биоинформатска анализа што исполнува специфични истражувачки цели.Посеопфатното профилирање на геномот на бактериите го поттикнува откривањето на фундаменталните механизми кои се во основата на нивните биолошки процеси, што исто така може да обезбеди вредна референца за геномски истражувања кај повисоките еукариотски видови
Платформа:Нанопор PromethION P48 + Illumina NovaSeq платформа
Продолжение на PacBio II
