Секвенционирање на транскриптом со целосна должина базирано на нанопори
Секвенционирањето на нанопорите се разликува од другите платформи за секвенционирање, со тоа што нуклеотидите се читаат директно без синтеза на ДНК и генерира долги читања со десетици килобази.Ова го овластува директното читање на преписите со целосна должина и справувањето со предизвиците во транскриптомските студии.
√ Ниска пристрасност специфична за низата
√ Целосно отчитување на cDNA до студии за генска структура
√ Потребни се помалку податоци за да се покрие ист број преписи
√ Идентификација на повеќе изоформи по ген
√ Квантификација на изразот на ниво на изоформа
Типичен гасовод за биоинформатика
Најнови успешни случаи со биомаркер технологии
1. Компаративните анализи на транскриптомите со целосна должина ја откриваат развојната динамика на стеблото Gnetum luofuense
Весник: Граници во генетиката
Објавено: март 2021 година
Клучни зборови: MinION |Алтернативно спојување |APA |lncRNA |Диференцијално изразени преписи
Прочитајте го целиот текст
2. Еднонасочно движење на малите РНК од пука до корени во меѓуспецифични хетерографти
Весник: Природни растенија
Објавено: јануари 2021 година
Клучни зборови: Нанопор |Илумина |мобилна мРНК детекција со целосна должина
3. Целосната транскриптомска анализа на корените на аспарагус го открива молекуларниот механизам на толеранција на сол предизвикан од арбукуларни микоризни габи
Весник: Environmental and Experimental Botany
Објавено: јануари 2021 година
Клучни зборови: MinION |Диференцијално изразени транскрипти |Фактори на транскрипција |Алтернативно спојување
4. Физиолошки карактеристични промени и целосен транскриптом на корените и лисјата од роза (Rosa chinensis) како одговор на стресот од суша
Весник: Физиологија на растенија и клетки
Објавено: октомври 2020 г
Клучни зборови: PromethION |Диференцијално изразени транскрипти |Функционално предвидување |Споени изоформи |TF и lncRNA
5. Анализа и сеопфатна споредба на PacBio и секвенционирање на РНК базирано на нанопори на транскриптомот Arabidopsis
Весник: Метод на растенија
Објавено: април 2020 г
Клучни зборови: GridION |PromethION |Продолжение на PacBio |Illumina NovaSeq |Порамнување на геномот |Идентификација на препис |Алтернативно спојување |РБС |LncRNA |Изоформна квантификација
Вести и моменти има за цел да ги сподели најновите успешни случаи со Biomarker Technologies, доловувајќи нови научни достигнувања, како и истакнати техники применети во текот на студијата.
Време на објавување: јануари-08-2022 година