МИКРОБИЛНИ
Бактериската компатибилност и имобилизацијата со биохард ја подобрија деградацијата на тебуконазолот, составот и функционирањето на микробиомот на почвата
Секвенционирање на ампликони со целосна должина 16S |PacBio HiFi |Алфа разновидност |Бета разновидност
Во оваа студија, секвенционирање на 16S ампликони со целосна должина од PacBio и биоинформатска анализа беа обезбедени од Biomarker Technologies.
Определување
Биокар имобилизирана бактерија која го разградува тебуконазолот Alcaligenes faecalis WZ-2 беше проучена за ефикасноста на биоразградување и влијанието на контаминираната почва со тебуконазол во споредба со сојот WZ-2 кој слободно разградува.
1. WZ-2 имобилизиран со биохард покажа поефикасна деградација на тебуконазол во споредба со слободниот WZ-2 со намалување на полуживотот на тебуконазол во почвата од 18,7 дена на 13,3 дена.
2. WZ-2, имобилизиран со биохард, можеше да ги врати ензимските ензимски активности на природните почви, вклучувајќи уреаза, дехидрогеназа и инвертаза, итн.
3. Микробен профил во почва третирана со WZ-2, имобилизирана со биохард, утврден со секвенционирање 16S со целосна должина, силно поддржува дека овој систем може да го врати здравјето на почвата со подобрување на структурата на бактериската заедница под контаминација со тебуконазол.
Експеримент (поврзано со секвенционирање)
Групирање: CK: Природна почва;Т: Почва зашиена со тебуконазол;S: Тебуконазол содржи почва со слободен сој WZ-2;п.н.е.: Тебуконазол содржи почва со биохар;BCS: Тебуконазол содржеше почва со биокар имобилизиран WZ-2.
Земање примероци: Вкупна екстракција на ДНК од почвата засилена со 16S rDNA прајмери
27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') и 1492R (5'-GGTTACCTTGTTACGA),16S rDNA со целосна должина
Платформа за секвенционирање: PacBio RS II
Стратегија за секвенционирање: CCS HIFI чита
Анализа на податоци:BMKCloudБиоинформатското платформирање ја прави златната рипка одличен генетски модел систем за физиологија и еволуција на рибите.
Резултат
Структурата на микробната заедница на почвата беше одредена со секвенционирање на 16S rDNA.ОТУ богатството и индексот на различноста на алфа, вклучувајќи ги индексите Chao1, Ace, Shannon и Simpson беа оценети за да се открие разновидноста на видовите во секој систем.По 60 дена инкубација, сите индекси покажаа сличен тренд, односно тебуконазолот може да предизвика намалување на богатството на видовите и разновидноста во почвата.Меѓутоа, со додавање на сојот WZ-2, заедницата на почвени бактерии беше делумно обновена во однос на богатството и различноста.Ограничена разлика беше забележана меѓу BC, BCS и CK, што укажува на тоа дека биокардот и WZ-2 имобилизираниот со биохард може ефикасно да го обноват биолошкото здравје на почвата.
Во оваа студија беше применет методот на непондерирана пар-група со аритметички средини (UPGMA) за да се покаже бета разновидност меѓу групите.Како што е прикажано на следната слика, BC, BSC и CK делеле повеќе сличен модел на микробиолошки состав во споредба со групата T и S, што дополнително покажа дека воведувањето на биокар во биоремедијацијата на почвата контаминирана со тебуконазол може во голема мера да го олесни обновувањето на микробната заедница во почвата.
Слика.UPGMA кластерирање на бактериска заедница на ниво на фил под различен третман
Референца
Сан, Тонг и др.„Бактериската компатибилност и имобилизацијата со биокар ја подобрија деградацијата на тебуконазолот, составот и функционирањето на микробиомот на почвата“.Весник за опасни материјали398 (2020): 122941.
Вести и моменти има за цел да ги сподели најновите успешни случаи со Biomarker Technologies, доловувајќи нови научни достигнувања, како и истакнати техники применети во текот на студијата.
Време на објавување: јануари-08-2022 година