Вести

Засилувањето на транспонираниот елемент (ТЕ) е препознаено како движечка сила што посредува во проширувањето и еволуцијата на големината на геномот, но последиците за обликувањето на 3D геномската архитектура остануваат во голема мера непознати кај растенијата.Овде, пријавуваме склопови на геном од референтна класа за три вида памук кои се движат трикратно во големината на геномот, именоGossypium rotundifolium(К2),G. arboreum(А2) иG. raimondii(Д5), користејќи Oxford Nanopore Technologies.Компаративните анализи на геномот ги документираат деталите за ТЕ засилувањето специфично за лозата што придонесува за големите разлики во големината на геномот (K2, 2,44 Gb; A2, 1,62 Gb; D5, 750,19 Mb) и укажуваат на релативно зачувана содржина на гени и синтенија меѓу геномите.Откривме дека приближно 17% од синтенските гени покажуваат промена на статусот на хроматин помеѓу активните („А“) и неактивни („Б“) одделенија, а засилувањето на ТЕ е поврзано со зголемувањето на процентот на одделот А во генските региони (~ 7.000 гени ) во K2 и A2 во однос на D5.Само 42% од границите на тополошки асоцијативниот домен (TAD) беа зачувани меѓу трите геноми.Нашите податоци имплицираат неодамнешно засилување на ТЕ по формирањето на границите на TAD специфични за лозата.Оваа студија фрла светлина врз улогата на експанзијата на геномот посредувана од транспосон во еволуцијата на структурата на хроматин од повисок ред кај растенијата.