Транскриптомот е врската помеѓу геномската генетска информација и протеомот на биолошката функција.Регулацијата на транскрипциското ниво е најважниот и најпроучен начин на регулација на организмите.Секвенционирањето на транскриптом може да го секвенционира транскриптомот во кое било време или под било кој услов, со резолуција точна на еден нуклеотид. Може динамички да го одразува нивото на генска транскрипција, истовремено да ги идентификува и квантифицира ретките и нормалните транскрипти и да обезбеди структурни информации за примерок специфични преписи.
Во моментов, технологијата за секвенционирање на транскриптом е широко користена во агрономијата, медицината и другите истражувачки полиња, вклучувајќи регулација на развојот на животните и растенијата, адаптација на животната средина, имунолошка интеракција, локализација на гените, генетска еволуција на видовите и откривање на тумори и генетски болести.
