● Целен регион за кодирање на протеини: со зафаќање и секвенционирање на протеинскиот кодирање на регионот, hWES се користи за откривање на варијанти поврзани со структурата на протеините;
● Висока точност: со голема длабочина на секвенционирање, hWES го олеснува откривањето на вообичаени варијанти и ретки варијанти со фреквенции помали од 1%;
● Ефикасно: hWES дава приближно 85% од мутациите на човечки болести од 1% од човечкиот геном;
● Пет строги процедури за КК кои го покриваат целиот процес со загарантирана Q30>85%.
Платформа
| Библиотека
| Exon Capture Strategy
| Препорачај стратегија за секвенционирање
|
Платформа Illumina NovaSeq
| PE150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 IDT xGen Exome Hyb панел V2 | 5 GB 10 GB |
Тип на примерок
| износ(Qubit®)
| Волумен
| Концентрација
| Чистота (NanoDrop™) |
Геномска ДНК
| ≥ 300 ng | ≥ 15 μL | ≥ 20 ng/μL | OD260/280=1,8-2,0 без деградација, без контаминација
|
За Менделови нарушувања/ретки болести: ефективна длабочина на секвенционирање над 50×
За примероци од тумор: ефективна длабочина на секвенционирање над 100×
1.Статистика за усогласување
Табела 1 Статистика на резултат на картата
Табела 2 Статистика на заробување на егзом
2.Откривање на варијации
Слика 1 Статистика на SNV и InDel
3.Напредна анализа
Слика 2 Циркос заплет на штетни SNV и InDel ширум геномот
Табела 3 Скрининг на гени кои предизвикуваат болест