● Обилни случаи на проекти: од своето основање во 2009 година, BMKGENE има завршено стотици проекти за видови во истражувањето на популацијата GWAS, им помогна на истражувачите да објават повеќе од 100 статии, а кумулативниот фактор на влијание достигна 500.
● Професионални аналитичари.
● Краток циклус на анализа.
● Точно ископување податоци.
Тип | Скала на население | Стратегија и длабочина на секвенционирање |
SLAF-GWAS | Број на примерок ≥200 | Големина на геном < 400M, со реф-геном, се препорачува WGS |
Големина на геном ≤ 1G, 100K ознаки и 10X | ||
1G ≤ Големина на геном ≤ 2G, 200K ознаки и 10X | ||
Големина на геном > 2G, 300K ознаки и 10X | ||
WGS-GWAS | Број на примерок ≥200 | 10X за секој примерок |
Различни сорти, подвидови, локални раси/банки на гени/мешани семејства/диви ресурси
Различни сорти, подвидови, предели
Семејство со полу-сиб/семејство со полно-сиб/диви ресурси
● Анализа на асоцијација на ниво на геном
● Анализа и скрининг на значајни SNP
● Функционална прибелешка на генот кандидат
а.Фенотип QC
Хистограм на дистрибуција на фреквенција
Статистика на фенотипови
б.Анализа на асоцијација (модел: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
Операција заговор
Заплет на Менхетен
година | Весник | IF | Наслов |
2022 година | NC | 17.69 | Геномска основа на гига-хромозомите и гига-геномот на дрвото божур Paeonia ostii |
2015 година | NP | 7.43 | Отпечатоците за припитомување ги закотвуваат геномските региони од агрономско значење во сојата |
2018 година | MP | 9.32 | Ресеквенцирањето на целиот геном на светска колекција на семе од репка открива генетска основа на нивната екотипска дивергенција |
2022 година | HR | 7.29 | Анализата на асоцијација на ниво на геном обезбедува молекуларни сознанија за природната варијација на големината на семето од лубеница |