Разгледајте го потенцијалот за проучување на диви разновидни истражувачки видови, што е пример за клучен случај од клиентите на BMKGENE.Неодамна објавена во овогодинешното издание на списанието Plant Biotechnology Journal, написот со наслов „Геномот на Wild Hevea brasiliensis на ниво на хромозом: зајакнување на геномското потпомогнато размножување и откривање на виталните места за зголемен принос на гума“ стои како вредна референца.
Бразилското гумено дрво (Hevea brasiliensis) стои високо како клучен природен извор на гума.Во текот на минатиот век, традиционалните методологии за одгледување предизвикаа извонреден шесткратен пораст на производството на гума.Сепак, основната генетска основа одговорна за потенцијалното зголемување на приносот на гумата останува загадочна.
Оваа студија започна со конструирање на геном на ниво на хромозом за дрвото од дива гума, користејќи синергија на долгопрочитаното секвенционирање на Nanopore, секвенционирањето на Illumina NGS и технологијата Hi-C.
Паралелно, се собраа збирка од 147 ресурси на герминација, кои опфаќаат варијации со висок принос, диви соеви и сродни видови, за сеопфатно ресеквенцирање на целиот геном (WGS) со користење на платформата Illumina.Последователните податоци за секвенционирање беа подложени на ригорозна популациска генетска анализа, овозможувајќи дисекција на структурата на населението, различноста и нерамнотежа на поврзаноста.Оваа анализа фрли светлина врз варијациите на припитомување меѓу популациите.
Понатамошните испитувања опфатија анализа која ги опфаќа Fst, π, Tajima's D и LD, со цел да се разоткријат сигналите за селекција кои произлегуваат од подобрениот принос на латекс, особено фокусирајќи се на клоновите на Викам.
Кулминирајќи со Анализа на асоцијација на ниво на геном (GWAS), маркерите поврзани со карактеристиките на приносот и последователно со гените поврзани со приносот беа прецизно назначени.Првичната валидација откри карактеристични транскрипциски активности кај различни мутанти за два ERF гени, обезбедувајќи прелиминарен увид во нивното функционално значење.Понатамошна потврда е закажана во рамките на претстојното истражување.
BMKGENE се гордее што придонесува за екстензивното ресеквенционирање на целиот геном на оваа значителна популација, заедно со значајната улога во биоинформатичката анализа.Нашето огромно искуство опфаќа секвенционирање на NGS/TGS и мултиомика биоинформатичка анализа низ низа од 1000+ видови.Со нетрпение ја очекуваме можноста за партнерство со вас на вашите претстојни проекти.
Кликнете овде за дадознајте повеќе за оваа студија
Време на објавување: 29.08.2023