● Високо искуство: Преку 200.000 примероци се обработени во BMK кои покриваат различни типови примероци, вклучувајќи клеточна култура, ткиво, телесни течности итн. и над 7.000 проекти mRNA-Seq затворени кои покриваат различни области на истражување.
● Строг систем за контрола на квалитетот: Основните контролни точки за квалитет низ сите чекори, вклучувајќи подготовка на примероци, подготовка на библиотека, секвенционирање и биоинформатика се под строг мониторинг со цел да се дадат висококвалитетни резултати.
● Достапни се повеќе бази на податоци за прибелешки на функции и студии за збогатување за исполнување на различни истражувачки цели.
● Услуги по продажба: Услугите по продажба важат 3 месеци по завршувањето на проектот, вклучувајќи следење на проекти, решавање проблеми, прашања и одговори на резултатите итн.
Библиотека | Стратегија за секвенционирање | Препорачани податоци | Контрола на квалитет |
Поли А збогатен | Illumina PE150 | 6 GB | Q30≥85% |
Нуклеотиди:
Конк.(ng/μl) | Количина (μg) | Чистота | Интегритет |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ограничена или никаква контаминација на протеини или ДНК е прикажана на гелот. | За растенија: RIN≥6,5; За животни: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; ограничена или без основна елевација |
Ткиво: Тежина (суво):≥ 1 g
*За ткиво помало од 5 mg, препорачуваме да се испрати флеш замрзнато (во течен азот) примерок од ткиво.
Клеточна суспензија:Број на клетки = 3×106- 1×107
*Препорачуваме да се испорача замрзнат клеточен лизат.Во случај таа ќелија да брои помала од 5×105.
Примероци од крв:Волумен≥1 ml
Микроорганизам:Маса ≥ 1 g
Контејнер: Цевче за центрифуга од 2 ml (не се препорачува лимена фолија)
Обележување на примерокот: Група+реплика на пр. A1, A2, A3;Б1, Б2, Б3... ...
Испорака:
Биоинформатика
Еукариотски Работен тек на анализа на секвенционирање на mRNA
Биоинформатика
ØКонтрола на квалитетот на необработените податоци
ØРеферентно усогласување на геномот
ØАнализа на структурата на преписот
ØКвантификација на изразот
ØАнализа на диференцијални изрази
ØПрибелешка и збогатување на функцијата
1.mRNA Крива на заситеност на податоци
2.Анализа на диференцијални изрази-Вулканска парцела
3.KEGG прибелешка на DEG
4.GO класификација на DEG