-
Секвенционирање на имунопреципитација на хроматин (ChIP-seq)
ChIP-Seq обезбедува профилирање на целите на ДНК ширум геномот за модификација на хистони, фактори на транскрипција и други протеини поврзани со ДНК.Тој ја комбинира селективноста на имуно-преципитацијата на хроматин (ChIP) за враќање на специфичните протеинско-ДНК комплекси, со моќта на секвенционирањето на следната генерација (NGS) за секвенционирање со висока пропусност на обновената ДНК.Дополнително, бидејќи комплексите протеин-ДНК се обновуваат од живите клетки, местата за врзување може да се споредат во различни типови на клетки и ткива или под различни услови.Апликациите се движат од регулација на транскрипција до развојни патишта до механизми на болеста и пошироко.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Секвенционирање на бисулфит на целиот геном
ДНК метилацијата на петтата позиција во цитозин (5-mC) има фундаментално влијание врз генската експресија и клеточната активност.Абнормалните обрасци на метилација се поврзани со неколку состојби и болести, како што е ракот.WGBS стана златен стандард за проучување на метилацијата на целиот геном при резолуција на една база.
Платформа: Illumina NovaSeq6000
-
Анализа за хроматин достапен до транспозаза со секвенционирање со висок пропусен опсег (ATAC-seq)
ATAC-seq е метод за секвенционирање со висок процент за анализа на достапноста на хроматин ширум геномот, што е важно за глобалната епигенетска контрола на генската експресија.Адаптери за секвенционирање се вметнуваат во отворени хроматински региони со хиперактивна Tn5 транспозаза.По PCR засилување, се конструира библиотека за секвенционирање.Сите отворени хроматински региони можат да се добијат под специфична просторно-временска состојба, не само ограничени на местата за врзување на факторот на транскрипција или одреден регион изменет од хистон.
-
Секвенционирање на бисулфит со намалена застапеност (RRBS)
Истражувањето за метилација на ДНК отсекогаш било жешка тема во истражувањето на болестите и е тесно поврзано со генската експресија и фенотипските особини.RRBS е точен, ефикасен и економичен метод за истражување на метилација на ДНК.Збогатувањето на регионите на промоторот и островот CpG со ензимско расцепување (Msp I), во комбинација со секвенционирање на бисулфит, обезбедува детекција на метилација на ДНК со висока резолуција.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
