●Платформи:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten и BGI-DNB-T7
●Режими на секвенционирање:PE50, PE100, PE150, PE250
●Контрола на квалитетот на библиотеките пред секвенционирање
●Секвенционирање на испорака на податоци и КК:испорака на извештај за QC и необработени податоци во формат fastq по демултиплексирање и филтрирање на читањата на Q30.
●Разновидност на услугите за секвенционирање:клиентот може да избере да се секвенционира по лента, ќелија за проток или количина на податоци.
●Разновидност на платформи:DNB библиотеките може да се пренесат на платформите на Illumina
●Огромно искуство на платформата за секвенционирање на Illumina:со илјадници затворени проекти со различни видови.
●Испорака на секвенционен извештај за КК:со квалитетни метрики, точност на податоците и севкупни перформанси на проектот за секвенционирање.
●Процес на зрело секвенционирање:со кратко време на пресврт.
●Ригорозна контрола на квалитетот: спроведуваме строги барања за КК за да гарантираме испорака на постојано висококвалитетни резултати.
Износ на податоци (X) | Концентрација (qPCR/nM) | Волумен |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Платформа | Концентрација (qPCR/nM) | Волумен |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Покрај концентрацијата и вкупната количина, потребна е и соодветна шема на врвови.
Извештај за квалитетот на библиотеката е даден пред секвенционирање, проценка на количината на библиотеката и фрагментација.
Табела 1. Статистика за секвенционирање на податоци.
ИД на примерок | BMKID | Суровини чита | Необработени податоци (bp) | Чисти читања (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 часот | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Слика 1. Дистрибуција на квалитет заедно со читањата во секој примерок
Слика 2. Дистрибуција на основна содржина
Слика 3. Распределба на прочитаните содржини во податоците за секвенционирање