1) Субклеточна резолуција: Секоја област за снимање содржи >2 милиони просторни баркодирани точки со дијаметар од 2,5 µm и растојание од 5 µm помеѓу точките центри, што овозможува просторна анализа на транскриптом со субклеточна резолуција (5 µm).
2) Анализа на резолуција на повеќе нивоа: Флексибилна анализа на повеќе нивоа која се движи од 100 μm до 5 μm за разрешување на различни карактеристики на ткивото со оптимална резолуција.
3) Сеопфатно профилирање на транскриптом: Транскриптите снимени од целиот ткивен слајд може да се анализираат, без ограничување на бројот на целните гени и целната област.
Библиотека | Стратегија за секвенционирање | Се препорачува излез на податоци |
S1000 cDNA библиотека | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Gb/примерок |
Пример | Број | Големина | Квалитет на РНК |
OCT вграден блок ткиво | 2-3 блока / примерок | Прибл.6,8х6,8х6,8 мм3 | RIN≥7 |
За повеќе детали за упатствата за подготовка на примероци и работниот тек на услугата, слободно разговарајте со aексперт за BMKGENE
Податоците генерирани од BMKMANU S1000 се анализираат со помош на софтверот „BSTMatrix“, кој е независно дизајниран од BMKGENE, вклучувајќи:
1) Генерирање на матрица на генска експресија
2) HE обработка на слика
3) Компатибилен со низводно софтвер од трета страна за анализа
4) Онлајн „BSTViewer“ помага да се добијат резултати од визуелизација со различни резолуции.
1.Групирање точки
2.Просторна дистрибуција
Nоте: Резолуцијаниво=13 (100 µm, лево); 7 (50 µm, нели)
3.Термичка карта за кластерирање на изобилство на маркер
4.Анализа на податоци меѓу примероците