Te raupapa RNA iti-Illumina
Ngā āhuatanga
● Te kowhiringa rahi o te RNA i mua i te whakarite whare pukapuka
● Ko te tātari bioinformatic e arotahi ana ki te matapae miRNA me o raatau whaainga
Painga Ratonga
●Te tātari bioinformatic matawhānui:ka taea te tautuhi i nga miRNA e mohiotia ana me nga miRNA hou, te tautuhi i nga whaainga miRNA me nga tohu mahi me te whakarangatira me nga papaa raraunga maha (KEGG, GO)
●Mana Mana Kounga: ka whakatinanahia e matou nga tohu whakahaere matua puta noa i nga waahanga katoa, mai i te tauira me te whakarite whare pukapuka ki te raupapatanga me te bioinformatics.Ma tenei aro turuki e whakarite te tukunga o nga hua o te kounga teitei.
●Tautoko i muri i te Hokonga: Ko ta matou herenga ka toro atu ki tua atu i te otinga kaupapa me te 3 marama i muri i te hokonga ratonga.I roto i tenei wa, ka tukuna e matou he kaupapa whai, he awhina rapurongoa, me nga huihuinga Q&A hei whakatika i nga patai e pa ana ki nga hua.
●Tohunga Nui: me te rekoata mo te katinga angitu i runga i nga kaupapa sRNA maha e kapi ana i nga momo 100 neke atu i roto i nga momo rohe rangahau, he maha nga wheako ka kawea mai e to taatau roopu ki ia kaupapa.
Nga Whakaritenga Tauira me te Tukunga
| Whare Pukapuka | Paerewa | Raraunga e taunaki ana | Raraunga QC |
| Rahi kua tohua | Ilumina SE50 | 10M-20M panui | Q30≥85% |
Whakaritenga Tauira:
Nucleotides:
| Conc.(ng/μl) | Rahi (μg) | Maamaa | Te tapatahi |
| ≥ 80 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 He iti, karekau he pūmua, he poke DNA ranei e whakaatuhia ana i runga i te gel. | RIN≥6.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; he iti, he kore ranei te taumata teitei |
● Nga tipu:
Putake, Kakau, Petal ranei: 450 mg
Rau, Kakano ranei: 300 mg
Hua: 1.2 g
● Kararehe:
Te Manawa, Te Wokao ranei: 450 mg
Viscera roro ranei: 240 mg
Te uaua: 600 mg
Koiwi, makawe, kiri ranei: 1.5g
● Angahuri:
Nga pepeke: 9g
Crustacea: 450 mg
● Te toto katoa: 2 ngongo
● Pūtau: 106 pūtau
● Serum me te Plasma:6 mL
Tukunga Tauira Manakohia
Ipu:
2 ml ngongo centrifuge (Kāore i te tūtohutia te konumohe tine)
Tauira tapanga: Rōpū+whakaritea tauira A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Tukunga:
1.Dry-tio: Me kiki nga tauira ki roto i nga putea ka tanumia ki te huka-maroke.
2.Nga ngongo RNAstable: Ka taea te whakamaroke i nga tauira RNA ki te ngongo whakapumau RNA(hei tauira RNAstable®) ka tukuna ki te pāmahana rūma.
Te Rerenga Mahi Ratonga
Hoahoa whakamatautau
Te tuku tauira
tangohanga RNA
Te hanga whare pukapuka
Whakaraupapa
Te tātari raraunga
Nga ratonga muri-hoko
Bioinformatics
Te tautuhi i te miRNA: te hanganga me te hohonu
Te whakaputanga rereke o te miRNA - te kohinga hiearchical
Tuhituhi mahi mo te whaainga o nga miRNA rerekee te whakaatu
Te torotoro i nga mahi rangahau i whakahaerea e nga ratonga raupapa sRNA a BMKGene ma te kohinga whakaputanga.
Chen, H. et al.(2023) 'Ko nga mate huaketo ka aukati i te koiora saponin me te whakaahua i te Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, wh.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) ' Ko te tipu FYVE rohe-kei roto i te pūmua FREE1 e hono ana ki nga waahanga microprocessor ki te peehi i te miRNA biogenesis ', EMBO reports, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) 'Ko te MicroRNA Ame-Bantam-3p e whakahaere ana i te Whanaketanga Pupal Larval na roto i te Whakatairanga i nga Waahanga Epidermal Growth Factor-like Domains 8 Gene (megf8) i roto i te Honeybee, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), p .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al.(2018) 'Te Taatari Whakakotahi o te MiRNA me nga Ira e hono ana ki te Kounga Mīti e whakaatu ana ko te Gga-MiR-140-5p e pa ana ki te Whakapae Ngako Intramuscular i roto i nga heihei', Cellular Physiology and Biochemistry, 46(6), wharangi 2421–2433.doi: 10.1159/000489649.
