Te raupapa RNA karihi kotahi

Kotahi- karihi RNA Whakaraupapa Atahanga Whakaatu

Ko te anga whakamua i roto i te hopu putau kotahi me te tikanga hanga whare pukapuka takitahi me te whakahiatotanga teitei ka taea e nga rangahau whakaputanga ira i runga i te puutau-a-waa.Ka taea e ia he tātaritanga punaha hohonu me te whakaoti mo nga taupori pūtau uaua, ka karo i te huna i o raatau momo rereke ma te tango toharite o nga pūtau katoa.

Heoi ano, karekau etahi o nga pūtau e pai ki te hanga hei whakatārewatanga pūtau-kotahi, no reira me etahi atu tikanga whakarite tauira – te tangohanga karihi mai i nga kopa, ara, ka tangohia tika te karihi mai i nga kopa, i te pūtau ranei ka rite ki te whakatārewatanga karihi kotahi mo te kotahi- raupapa pūtau.

Ka whakaratohia e BMK te 10 × Genomics Chromium TM i runga i te ratonga raupapa RNA pūtau kotahi.Kua whakamahia nuitia tenei ratonga i roto i nga rangahau mo nga rangahau e pa ana ki nga mate, penei i te rereketanga o nga pūtau aukati, te rerekee o te puku, te whanaketanga o te kiko, me era atu.

Te maramara tuhi mokowhiti: 10× Genomics

Paerewa: Illumina NovaSeq Platform

Whakapā mai

Nga Taipitopito Ratonga

Bioinformatics

Hua Whakaaturanga

Tikanga Hangarau

Ko te wehenga o te karihi ka tutuki e te 10 × Genomics Chromium TM, kei roto i te punaha microfluidics e waru nga hongere me nga whakawhiti rua.I roto i tenei punaha, he pirepire reera me nga tohu tohu me te tuatahi, nga enzymes me te karihi kotahi ka whakauruhia ki roto i te topata hinu te rahi nanoliter, ka whakaputahia te Gel Bead-in-Emulsion (GEM).I te wa i hangaia ai te GEM, ka mahia te lysis pūtau me te tuku o nga tohu tohu ki ia GEM.Ko te mRNA ka huri whakamuri ki roto i nga ngota ngota cDNA me te 10x barcodes me te UMI, he mea ano ki te hanga whare pukapuka raupapa paerewa.

Ko te kopa e kore e pai mo te whakarite whakatara i nga pūtau kotahi

Pūtau / Tissue	Te take
Whakakorea te kiko tio	Kaore e taea te tiki whakahaere hou, kua tiakina roa ranei
Pūtau uaua, Megakaryocyte, Ngako…	He nui rawa te diameter o te pūtau hei uru ki te taputapu
ate…	He pakarukaru rawa ki te pakaru, kare e taea te wehewehe nga pūtau kotahi
Pūtau neuron, roro…	He tairongo ake, he ngawari ki te whakapouri, ka huri i nga hua raupapa
Pancreas, Thyroid…	He taonga i roto i nga enzymes endogenous, e pa ana ki te hanga o te whakatārewatanga pūtau kotahi

Kotahi-kaupapa vs Kotahi-pūtau

Kohanga-kotahi	Pūtau-kotahi
Te diameter pūtau mutunga kore	Te diameter pūtau: 10-40 μm
Ko te rauemi ka taea te kiko tio	Ko te rauemi me he kiko hou
Te ahotea iti o nga pūtau tio	Ka taea e te maimoatanga o te enzyme te tauhohenga o te ahotea pūtau
Kaore e tika kia tangohia nga toto toto whero	Me tango nga toto toto whero
Ko te Nuclear te whakaputa korero koiora	Ko te pūtau katoa e whakaatu ana i nga korero koiora