-
BSA
Ko te tüäpapa o te tüäpapa o te tüäpapa o te tüäpapa o te tüäpapa o te tätari paerewa kotahi-taahiraa me te tätari matatau me te whakatakotoranga tawhā kua whakaritea.Ko te BSA he tikanga e whakamahia ana hei tautuhi tere i nga tohu tohu ira e pa ana.Ko te rerengamahi matua o te BSA kei roto: 1. te kowhiri i nga roopu e rua o nga tangata e tino whakahē ana nga tohu tohu;2. te whakakotahi i te DNA, te RNA, te SLAF-seq ranei (I hangaia e te Biomarker) o nga tangata katoa kia rua te nuinga o te DNA;3. te tautuhi i nga raupapa rereke ki te ira tohutoro, i waenga ranei, 4. te matapae i nga rohe hono a te kaitono ma te ED me te SNP-index algorithm;5. Te tātari mahi me te whakarangatira i nga ira i roto i nga rohe kaitono, me era atu. Kei te waatea ano te keri matatau i roto i nga raraunga tae atu ki te tirotiro tohu ira me te hoahoa tuatahi.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) papaaapapa kua whakawhanakehia me nga tau o te wheako i roto i te rangahau kaupapa kanorau moroiti, kei roto he tātari taketake me te tātaritanga whaiaro: ko te tātaritanga taketake e hipoki ana i nga ihirangi tātari auraki o te rangahau moroiti o naianei, he taonga me te matawhānui te ihirangi tātari, a ka whakaatuhia nga hua tātaritanga ki te ahua o nga ripoata kaupapa;He rereke nga korero o te tātaritanga whaiaro.Ka taea te kowhiri i nga tauira ka taea te whakarite ngawari i runga i te purongo tātari taketake me te kaupapa rangahau, ki te whakatutuki i nga whakaritenga whaiaro.Pūnaha whakahaere Windows, ngawari me te tere.
-
Ira Kunenga
Ko te ira kukuwhatanga he ratonga raupapa raupapa kua hangaia mo te whakamaarama matawhānui i runga i nga korero kunenga o nga rawa kua homai i runga i nga rereketanga ira, tae atu ki nga SNP, InDels, SV me CNV.Ka whakarato i nga tātaritanga taketake katoa e hiahiatia ana mo te whakaahua i nga huringa kunenga me nga ahuatanga ira o te taupori, penei i te hanganga taupori, te kanorau ira, te hononga phylogeny, me etahi atu. Kei roto ano hoki nga rangahau mo te rerenga ira, e whakamana ana i te whakatau tata mo te rahinga taupori whai hua, te wa rerekee.
-
Whakatauritenga Genomics
Ko te tikanga whakatairite ira ko te whakatairite i nga raupapa ira me nga hanganga o nga momo momo rereke.Ko tenei ako e whai ana ki te whakaatu i te kukuwhatanga momo, te mahi ira, te tikanga whakahaere ira i te taumata ira ma te tautuhi i nga hanganga raupapa me nga huānga i tiakina, i rereke ranei i nga momo momo.Ko te rangahau ira tangata whakatairite angamaheni ko nga tātaritanga i roto i te whanau ira, te whanaketanga o te kukuwhatanga, te taarua ira katoa, te pehanga whiriwhiri, aha atu.
-
Ira Kunenga
Ko te taupori me te tüäpapa tätari ira kunenga kua whakatüria i runga i te kaupapa o te wheako nui kua whakaemihia i roto i te roopu BMK R&D mo nga tau.He taputapu pai ki te kaiwhakamahi ina koa mo nga kairangahau karekau nei i te tino tohunga ki te koiora.Ma tenei papaaho e taea ai te tātari taketake e pa ana ki te ira kunenga, tae atu ki te hanga rakau phylogenetic, te tātaritanga herekoretanga hononga, te aromatawai kanorau ira, te tātari sweep whiriwhiri, te tātaritanga whanaungatanga, te PCA, te tātari hanganga taupori, aha atu.
-
Hi-C i runga Genome Assembly
Ko te Hi-C he tikanga i hangaia hei hopu i te whirihoranga chromosome ma te whakakotahi i nga tauwhitinga-a-tata-tata me te raupapa-a-teitei.Ko te kaha o enei taunekeneke e whakaponohia ana he kino te hono ki te tawhiti tinana o nga chromosomes.Na reira, ka taea e nga raraunga Hi-C te arahi i te rapoi, te ota me te whakatakotoranga o nga raupapa kua whakaemihia i roto i te tauira iraira me te punga i era ki runga i te maha o nga chromosomes.Ka whakamanahia e tenei hangarau he huihuinga ira ira taumata-chromosome me te kore he mapi ira-a-taupori.Me Hi-C ia ira tangata kotahi.
Paerewa: Illumina NovaSeq Platform / DNBSEQ
-
Te Tipu/Animal De Novo Genome Sequencing
De NovoKo te whakaraupapatanga e pa ana ki te hanga ira tangata katoa o te momo ma te whakamahi i nga hangarau raupapatanga, hei tauira, PacBio, Nanopore, NGS, me etahi atu, me te kore he tohutoro ira.Ko te tino pai ake o te roa o te panui o nga hangarau raupapa reanga tuatoru kua whai waahi hou ki te whakahiato ira ira uaua, penei i era he nui te heterozygosity, teitei ōwehenga o nga rohe tukurua, polyploids, me etahi atu. te whakatau i nga huānga tukurua, nga rohe he kino nga ihirangi GC me etahi atu rohe tino uaua.
Paerewa: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq Platform
-
Tangata Katoa Exome Sequencing
Ko te raupapatanga o waho katoa (WES) e kiia ana he rautaki raupapa whai hua mo te tautuhi i nga huringa mate-mate.Ahakoa he 1.7% noa iho o te ira ira tangata ka tangohia e nga exons, he tohu tika te ahua o nga mahi pūmua katoa.I roto i te ira tangata, kua korerohia he neke atu i te 85% o nga huringa e pa ana ki nga mate ka puta i roto i te rohe whakawaehere pūmua.
Kei te tuku a BMKGENE i nga ratonga whakamaarama whanui me te ngawari o te tangata me nga momo rautaki hopu exon e waatea ana ki te whakatutuki i nga whaainga rangahau.
Paerewa: Illumina NovaSeq Platform
-
Whakaraupapa Wāhanga Whakanuia Tauwhāiti-Locus (SLAF-Seq)
Ko te tohu-a-ira teitei, ina koa mo te taupori nui, he mahi nui i roto i nga rangahau hononga ira, e whakarato ana i te kaupapa ira mo te kitenga ira mahi, te tātaritanga kukuwhatanga, me era atu. ) ka whakaurua ki te whakaiti i te utu raupapa mo ia tauira, me te pupuri i te whai huatanga mo te kitenga tohu ira.Ka tutuki tenei ma te tango i te kongakonga here i roto i te awhe rahi kua tohua, e kiia nei ko te whare pukapuka whakaaturanga iti (RRL).Ko te raupapatanga kongakonga kua whakakaha ake i te waahi-motuhake (SLAF-Seq) he rautaki i whakawhanakehia e ia ake mo te tohu-ira SNP me te kore he tohutoro tohutoro.
Paerewa: Illumina NovaSeq Platform -
Illumina me BGI
Ko te hangarau raupapa Illumina, i runga i te Sequencing by Synthesis (SBS), he auahatanga NGS e awhi ana i te ao, he kawenga mo te whakaputa neke atu i te 90% o nga raraunga raupapa o te ao.Ko te maataapono o te SBS ko te whakamaarama i nga tohu kaporeihana ka taea te whakamuri i te wa e taapirihia ana ia dNTP, katahi ka wehea kia uru ai te turanga o muri.Me nga dNTP e wha kua herea ki te mutunga ka taea te huri i ia huringa raupapa, ka whakaitihia e te whakataetae taiao te rītaha whakauru.Ka tautokohia e tenei hangarau maha nga whare pukapuka panui kotahi me nga whare pukapuka takirua, e whakatutuki ana i nga momo tono ira tangata.Ko nga kaha o te raupapatanga o Illumina me te tino tika ka tuu hei kohatu kokonga mo te rangahau ira tangata, e whakamana ana i nga kaiputaiao ki te wetewete i nga riipene o nga momo ira me nga korero kore rite me te pai.
Ko te DNBSEQ, i whakawhanakehia e BGI, tetahi atu hangarau NGS hou i kaha ki te whakaheke i nga utu raupapa me te whakanui ake i nga utu.Ko te whakareri i nga whare pukapuka DNBSEQ ko te wehewehe DNA, te whakarite i te ssDNA me te whakakaha porowhita hurihuri kia whiwhi ai i te DNA nanoballs (DNB).Ka utaina enei ki runga i te mata totoka, ka whakaraupapahia e te whakakotahitanga Probe-Anchor Synthesis (cPAS).
Ko ta maatau ratonga raupapa pukapuka i hangaia i mua i te hanga i nga kaihoko ki te whakarite i o raatau whare pukapuka raupapa mai i nga puna rereke (mRNA, genome katoa, amplicon, me etahi atu).I muri mai, ka taea te tuku i enei whare pukapuka ki o maatau pokapū raupapa mo te whakahaere kounga me te raupapa i roto i nga papaaho Illumina, BGI ranei.
