-
Raupapa Metagenomic -NGS
Ko te metagenome e pa ana ki te kohinga o nga rawa ira katoa o te hapori whakauru o nga rauropi, penei i te metagenome taiao, te metagenome tangata, me etahi atu.Ko te raupapa metagenomic he taputapu ngota e whakamahia ana ki te wetewete i nga rauemi ira iraro i tangohia mai i nga tauira taiao, e whakarato ana i nga korero taipitopito mo te kanorau me te nui o nga momo, te hanganga taupori, te hononga phylogenetic, nga ira mahi me te whatunga honohono me nga mea taiao.
Paparanga:Illumina NovaSeq Platform
-
Whakaraupapa Metagenomic-Nanopore
Ko te Metagenomics he taputapu rapoi e whakamahia ana ki te wetewete i nga rauemi genomic whakauru i tangohia mai i nga tauira taiao, e whakarato ana i nga korero taipitopito mo te kanorau me te nui o nga momo, te hanganga taupori, te hononga phylogenetic, nga ira mahi me te whatunga honohono me nga mea taiao, me etahi atu. ki nga rangahau metagenomic.Ko tana mahi tino pai i roto i te roa o te panui i whakarei ake i te tātari metagenomic o raro, ina koa te huihuinga metagenome.Ma te whai hua o te panui-roa, ka taea e te rangahau metagenomic-a-Nanopore te whakatutuki i nga huihuinga nui ake ki te whakataurite ki nga metagenomics pupuhi-pu.Kua whakaputahia ko te Nanopore-based metagenomics i pai te whakaputa i nga ira huakita oti me te kati mai i nga microbiomes (Moss, EL, et. al,Nature Biotech, 2020)
Paparanga:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Ko te waahanga iti i runga i te 16S me te 18S rRNA kei roto nga rohe e rua kua tino tiakina me nga rohe rerekee-nui he tapumati ngota mo te tohu rauropi prokaryotic me te eukaryotic.Ma te whakamahi i te raupapatanga, ka taea te whai i enei amplicons i runga i nga waahanga kua tiakina, ka taea te tino tohu i nga rohe rerekee mo te tautuhi moroiti e whai waahi ana ki nga rangahau e pa ana ki te tātaritanga kanorau moroiti, te taake, te phylogeny, me era atu. ) te raupapatanga o te papaaho PacBio ka taea te whiwhi i nga panui roa tino tika, ka taea te kapi i nga amplicons roa-katoa (tata ki te 1.5 Kb).Ko te tirohanga whanui mo te mara ira i tino whakanui ake i te taumira i roto i nga tohu momo i roto i nga huakita me te hapori harore.
Paparanga:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Ko te raupapatanga amplicon 16S/18S/ITS e whai ana ki te whakaatu i te momo tikanga, te taaketanga, me te nui o nga momo i roto i te hapori microbial ma te tirotiro i nga hua PCR o nga tohu ira tiaki whare kei roto nga waahanga tino korero me nga waahanga rerekee.Ko te whakaurunga o enei tapumati rapoi tino pai na Woeses et al,(1977) ka whakamana i te whakatakotoranga moroiti-kore-kore.Ma te raupapatanga o te 16S (huakita), 18S (harore) me te mokowhiti kua tuhia o roto(ITS, harore) ka taea te tautuhi i nga momo nui e rua me nga momo onge me te kore e mohiotia.Ko tenei hangarau kua tino whakamahia hei taputapu nui ki te tautuhi i te hanganga moroiti rerekee i roto i nga momo taiao, penei i te waha tangata, whekau, tai, aha atu.
Paparanga:Illumina NovaSeq Platform
-
Huakita me te harore Katoa te Whakaraupapa Anō i te Genome
He taputapu tino nui te whakaraupapa-a-ira-a-ira o te huakita me te harore ki te whakaoti i nga ira o te huakita me te harore e mohiotia ana, me te whakatairite i nga momo ira tangata maha, ki te mapi ranei i nga momo rauropi hou.He mea nui ki te raupapa ira ira katoa o te huakita me te harore kia taea ai te whakaputa ira tohutoro tika, ki te mahi tohu moroiti me etahi atu rangahau iraira whakatairite.
Paerewa: Illumina NovaSeq Platform
-
Whakaraupapa Metatranscriptome
Ko te raupapa metatranscriptome e whakaatu ana i te whakaputanga ira o nga moroiti (eukaryotes me te prokaryotes) i roto i nga taiao taiao (ara, te oneone, te wai, te moana, te tai, me te punuakau.) Inaa, ma enei ratonga ka taea e koe te tiki i nga whakaaturanga whakaaturanga ira katoa o nga hapori microbial uaua, tātaritanga taake. o nga momo, tātaritanga whakarangatira mahi o nga ira rerekee te whakaatu, me etahi atu.
Paerewa: Illumina NovaSeq Platform
-
Genome harore
Ko te Hangarau Biomarker e whakarato ana i te rangahau ira ira, ira pai me te pene-oti ira o te harore i runga i te whainga rangahau motuhake.Ko te raupapa ira, te huihuinga me te tuhinga mahi ka taea te whakatutuki ma te whakakotahi i te raupapa o muri-whakatupuranga + Te raupapa reanga tuatoru ki te whakatutuki i te huihuinga genome taumata-tiketike.Ka taea hoki te whakamahi hangarau Hi-C hei whakahaere i te huihuinga ira i te taumata chromosome.
Paparanga:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq Platform
-
Bacteria Complete Genome
Ko te Hangarau Biomarker e whakarato ana i te ratonga raupapa mo te hanga ira ira huakita katoa me te kore aputa.Ko te rerenga mahi matua o te huakita kua oti te hanga ira ko te raupapatanga o nga reanga tuatoru, te huihuinga, nga korero mahi me te tātari bioinformatic matatau ki te whakatutuki i nga whaainga rangahau motuhake.Ma te whakakitenga matawhānui o te ira ira huakita e kaha ana ki te whakaatu i nga tikanga taketake kei raro i a raatau mahi koiora, ka taea hoki te whakarato tohutoro nui mo nga rangahau ira i roto i nga momo eukaryotic teitei ake.
Paparanga:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq Platform
PacBio Sequel II
