Ko te tohu-a-ira teitei, ina koa mo te taupori nui, he mahi nui i roto i nga rangahau hononga ira, e whakarato ana i te turanga ira mo te kitenga ira mahi, te tātaritanga kukuwhatanga, me era atu. ) ka whakaurua ki te whakaiti i te utu raupapa mo ia tauira, me te pupuri i te whai huatanga mo te kitenga tohu ira.Ka whakatutukihia tenei ma te tango i te kongakonga here i roto i te awhe rahi kua tohua, e kiia nei ko te whare pukapuka whakaaturanga iti(RRL).Ko te raupapatanga kongakonga kua whakakaha ake i te waahi-motuhake(SLAF-Seq) he rautaki i whakawhanakehia e ia ake mo te kitenga SNP de novo me te whakaira-ira SNP o nga taupori nui.
rerengamahi hangarau
SLAF me nga tikanga RRL o naianei
Nga painga o te SLAF
He pai ake te kitenga tohu ira– Ka honoa me te hangarau whakahiato teitei, ka taea e SLAF-Seq te whakatutuki i nga rau mano o nga tohu i kitea i roto i te katoa o te ira hei whakatutuki i te tono o nga kaupapa rangahau kanorau, ahakoa he tohu tohutoro ranei.
Whakaritea&Honowari te hoahoa whakamatautau– Mo nga kaupapa rangahau rereke, momo momo ranei, he rerekee nga rautaki nakunaku enzymatic e waatea ana tae atu ki te nakunaku kotahi-enzyme, rua-enzyme me te nakunaku-maha.Ko te rautaki nakunaku ka arotakea i mua i roto i te silico hei whakapumau i te hoahoa whaamu tino pai.
He tino pai ki te nakunaku enzymatic– Ko te nakunakutanga enzymatic i mua i hoahoatia he nui ake te tohatoha o nga SLAF i runga i te chromosome.Ka taea e te kohinga kongakonga te 95%.
A ape i te raupapa tukurua- Ko te ōrau o te raupapa tukurua i roto i nga raraunga SLAF-Seq ka whakahekehia ki raro iho i te 5%, ina koa ki nga momo me te taumata teitei o nga huānga tukurua, penei i te witi, te kanga, me etahi atu.
Rerengamahi bioinformatic i whakawhanakehia e ia ano– I whakawhanakehia e BMK he rerengamahi bioinformatic whakauru e pa ana ki te hangarau SLAF-Seq hei whakarite i te pono me te tika o te putanga whakamutunga.
Te tono SLAF
Mahere hononga ira
Te hanga mapi ira tino kiato me te tautuhi i nga waahi e whakahaere ana i nga ahuatanga momo puawai i Chrysanthemum(Chrysanthemum x morifolium Ramat.)
Te Tuhituhi: Rangahau Whakaraupapa Whakaputaina: 2020.7
GWAS
Te tautuhi i tetahi ira kaitono e hono ana ki te ihirangi isofavone i roto i nga kakano soya ma te whakamahi i te hononga-a-ira-ira me te mapi hono
Tuhituhi: te Tuhituhi Tipu I whakaputaina: 2020.08
Ira Kunenga
Ko te tātaritanga ira tangata me te huihuinga de novo e whakaatu ana i te takenga mai o te raihi taru hei keemu whanaketanga
Journal: Tipu Molecular I whakaputaina: 2019.5
Tātari Wehenga Nui (BSA)
Ko te GmST1, e whakawaehere ana i te sulfotransferase, e whakaahuru ana ki nga riaka huaketo mosaic soybean G2 me G3
Journal: Plant, Cell & Environment I whakaputaina: 2021.04
Tohutoro
Sun X, Liu D, Zhang X, et al.SLAF-Seq: he tikanga pai mo te kitenga nui-nui de novo SNP me te tohu ira ma te whakamahi i te raupapa-a-teitei [J].Plos one, 2013, 8(3):e58700
Waiata X, Xu Y, Gao K, et al.Ko te hanga mapi ira tino teitei me te tautuhi i nga waahi e whakahaere ana i nga ahuatanga momo puawai i roto i te Chrysanthemum (Chrysanthemum × morifolium Ramat.).Hortic Res.2020;7:108.
Wu D, Li D, Zhao X, et al.Te tautuhi i tetahi ira kaitono e hono ana ki te ihirangi isoflavone i roto i nga kakano soya ma te whakamahi i te hononga ira-a-whanui me te mapi hono.Tipu J. 2020;104(4): 950-963.
Sun J, Ma D, Tang L, et al.Te Taatari Taupori Taupori me te Runanga o De Novo e whakaatu ana i te takenga mai o te raihi tarutaru hei keemu Whakawhanaketanga.Tipu Mol.2019;12(5):632-647.Tipu Mol.2018;11(11):1360-1376.
Zhao X, Jing Y, Luo Z, et al.Ko te GmST1, e whakawaehere ana i te sulfotransferase, ka whakaahuru ki nga riaka huaketo mosaic soybean G2 me G3.Taiao Pūtau tipu.2021;10.1111/pce.14066
Wā tuku: Hanuere-04-2022