MAHI MOROPII
Ko te kaha o te ahuwhenua ka whakaiti i te uaua o te whatunga moroiti me te nui o te taake kohatu matua i roto i nga pakiaka
Whakaraupapa Amplicon-katoa (ITS) |PacBio HIFI
Nga mea nui
AKua kaha ake te raru o te mahi ahuwhenua na te kino o nga paanga o te taiao tae atu ki te ngoikore o te whakamahi matūkai, te whakahekenga o te wai gound, te paheketanga o te kounga o te oneone, me etahi atu.He mahi nui te hapori microbial ki te hua me te mau tonu o te agroecosystem.Heoi ano, kaore i te maarama he pehea te paanga o nga punaha ahuwhenua ki te microbiota pakiaka.
Hoahoa Whakamatau
Nga whakamatautau
SKo nga tauira hinu me te pakiaka(DNA) i ahu mai i nga mara witi mai i nga whenua ahuwhenua 60 (20 ia)
Grouping: 1. Huihuinga (me te ngaki whenua);2. Huihuinga (kore-ngaki);3. Whenua pāmu pararopi
Srautaki whakatairite: Whakaraupapa amplicon roa-katoa (ITS)
Primers: ITS1F-ITS4 (e whai ana ki te rohe katoa o ITS ~630 bp)
Stüäpapa whakataurite: PacBio RS II
Te tātari bioinformatic
Hua
On te toharite o 357 OTU i tautuhia mo ia waahi me te katoa o nga OTU 837 o nga waahi 60 katoa.Ko te kanorau Arepa o nga hapori harore pakiaka kaore i tino rerekee i waenga i nga punaha ahuwhenua e toru.Heoi ano, e toru nga tautau motuhake i hanga i roto i te tātaritanga kanorau peta, e tohu ana i te kaha o nga paanga o te punaha ahuwhenua ki te hanganga hapori harore pakiaka.
Whakaahua 1. Te kanorau Arepa (te taupū Shannon me te hanganga hapori) me te tātaritanga kanorau peta (te tātari kanoi o nga taunga matua) mo nga hapori harore pakiaka
Ti tautuhia te taake kohatu matua i runga i te kupenga whanui o nga hapori harore puta noa i nga punaha ahuwhenua e toru: 10 nga pona o runga me te tohu teitei, te tino tata o te tino tata me te iti rawa o te waahi o waenga i tohua.E whitu o ratou no nga ota mycorrhizal.
Whakaahua 2. Ko te whatunga whanui mo nga hapori harore pakiaka o nga punaha ahuwhenua e toru
FKo nga hononga motuhake o te punaha patu i tohu he nui ake te hononga i roto i te whatunga pararopi e rua ake nga tapa me te maha atu o nga pona hono atu i te whatunga kore-tika me te whatunga tikanga.I tua atu, he nui ake te taake kohatu matua (taimana) i roto i te whatunga ahuwhenua waro ki era atu, i tautoko i tona uaua me te honohono.
Whakaahua 3. Nga kupenga harore pakiaka o te punaha ahuwhenua
Ai kitea te hononga kino i waenga i te kaha ahuwhenua me te hononga kupenga harore pakiaka.I kitea e te tātaritanga ngahere tupurangi nga kaitaraiwa o te taake kohatu matua: te ūkuikui oneone, te kiato rahi, te pH me te koroni mycorrhizal.
Whakaahua 4. Te kaha o te ahuwhenua me te hononga hononga ki nga punaha ahuwhenua e toru (A me B);Te tātari ngahere tupurangi(C) me te hononga i waenga i te kaha ahuwhenua me te koroni AMF (D)
Hangarau
Te raupapa amplicon roa-katoa
As “Te Whakatupuranga Tuatoru Whakaraupapa” ka eke ki runga i te atamira, kua hinga nga herenga o nga rohe kua whaaia me nga raru o te huihuinga de novo.Ko te Pacific Bioscience (PacBio) kua angitu te whakawhānui i te panui o nga raupapa ki te tekau kilopases, e taea ai e tatou te whiwhi i nga panui-roa o te 16s rRNA (1,000 bp-1,500 bp) i roto i te huakita, 18S rRNA ranei (1,500 bp-2,000 bp) me ITS rohe (400 bp-900 bp) i roto i te eukaryotics.Ko te tirohanga whanui mo te mara ira i tino whakanikoniko i te taumira o nga tohu momo me nga ira mahi.Ko te take roa e pa ana ki te tika o te turanga kua whakatauhia e te PacBio CCS whakatikatika whaiaro, e whakaputa ana i nga panui HIFI me te neke atu i te 99% te tika o te panui.
Mahinga i roto i te tuhipoka OTU
TKo nga painga o nga panui roa me te whakaputa nui, ka taea te whakanui ake i te tika o te tuhi korero me te whakatutuki i te whakatau "taumata-momo" i roto i te tohu moroiti.
Tohutoro
Banerjee, Samiran , et al."Ko te kaha o te ahuwhenua ka whakaiti i te uaua o te whatunga microbial me te nui o te taake kohatu matua i roto i nga pakiaka."Te ISME Journal (2019).
Hangarau me nga Tohu Ko te whainga ki te tohatoha i nga tono angitu hou o nga momo hangarau whakahiato teitei i roto i nga waahi rangahau me nga whakaaro maamaa i roto i te hoahoa whakamatautau me te keri raraunga.
Te wa tuku: Hanuere-08-2022