● Wāhi Waehere Pūmua: mā te hopu me te whakaraupapa i te rohe whakawaehere pūmua, ka whakamahia te hWES ki te whakaatu i ngā rerekētanga e pā ana ki te hanganga pūmua;
● Tika Tino: me te hohonutanga o te raupapa raupapatanga, ka taea e te hWES te kimi i nga momo rereke noa me nga rereke onge me nga iarere iti iho i te 1%;
● Utu Whaihua: Ko te hWES ka puta mai i te 85% o nga huringa mate tangata mai i te 1% o te genome tangata;
● E rima nga tikanga QC tino e hipoki ana i te mahinga katoa me te Q30>85% kua whakamanahia.
Paerewa
| Whare Pukapuka
| Rautaki Hopu Exon
| Tūtohu Rautaki Whakaraupapa
|
Illumina NovaSeq Platform
| PE150 | Agilent SureSelect Tangata Katoa Exon V6 IDT xGen Exome Hyb Paewhiri V2 | 5 Gb 10 Gb |
Momo Tauira
| Te nui(Qubit® )
| Rōrahi
| Te aro
| Pure(NanoDrop™ ) |
DNA genomic
| ≥ 300 ng | ≥ 15 μL | ≥ 20 ng/μL | OD260/280=1.8-2.0 kahore he paheketanga, kahore he poke
|
Mo nga mate Mendelian/mate onge: te hohonu o te raupapa whai hua i runga ake i te 50×
Mo nga tauira pukupuku: te hohonu o te raupapa whai hua i runga ake i te 100×
1.Tautauranga Whakatikanga
Ripanga 1 Tauanga o te hua mapi
Ripanga 2 Tatauranga mo te hopu exome
2.Huritanga rereke
Whakaatu 1 Tatauranga o SNV me InDel
3.Atatari Ake
Whakaahua 2 Circos maata o Genome-whanui kino SNV me InDel
Ripanga 3 Te tirotiro i nga ira mate-mate