BMKCloud Log in
条形banner-03

Hua

Te tātaritanga o te roopu genome-wide

Ko te rangahau hononga ira-whanui (GWAS) e whai ana ki te tautuhi i nga momo ira (genotype) e hono ana ki nga ahuatanga motuhake (phenotype).Ko te rangahau a GWAS he tirotiro i nga tohu ira e whakawhiti ana i te ira katoa o te maha o nga tangata takitahi me te matapae i nga hononga tohu-ira ma te tātari tauanga i te taumata taupori.Kua whakamahia nuitia i roto i te rangahau mo nga mate tangata me te keri ira mahi mo nga ahuatanga uaua o nga kararehe, tipu ranei.


Nga Taipitopito Ratonga

Hua Whakaaturanga

Whakaputa Whakaaturanga

whakaahua3

1.Ratonga Painga

● He nui nga Take Kaupapa: mai i tana whakaturanga i te tau 2009, kua oti e BMKGENE nga rau momo momo kaupapa i roto i te rangahau GWAS taupori, i awhina i nga kairangahau ki te whakaputa neke atu i te 100 tuhinga, a, kua eke te tauwehenga paanga ki te 500.
● Kaitātari ngaio.
● He huringa tātari poto.
● Te keri raraunga tika.

2. Whakaritenga Ratonga

Momo

Tauine Taupori

Rautaki raupapa me te hohonu

SLAF-GWAS Tau tauira ≥200 Rahi ira <400M, me te tohu-ira, ka tūtohuhia te WGS

Rahi Genome ≤ 1G, 100K Tohu me te 10X

1G ≤ Rahi Genome ≤ 2G, 200K Tohu me te 10X

Rahi Genome > 2G, 300K Tohu me te 10X

WGS-GWAS

Tau tauira ≥200

10X mo ia tauira

3. Kōwhiringa Rawa

动物1
动物2
whakaahua7

Nga momo rereke, nga momo iti, nga whenua whenua/putanga ira/whanau whakauru/nga rawa mohoao

Nga momo rereke, nga momo iti, nga whenua whenua

Hawhe-sib whanau/full-sib whanau/whanau mohoao

4. Te Whakamaramatanga o te Mataora

● Te tātari hononga-Genome-wide
● Te tātari me te tirotiro i nga SNP nui
● Tuhituhi mahi o te ira kaitono

5. Rere Mahi Mahi

Tauira QC

Hoahoa whakamatautau

tuku tauira

Te tuku tauira

Whakamatau pairati

tangohanga RNA

Te Whakaritenga Whare Pukapuka

Te hanga whare pukapuka

Whakaraupapa

Whakaraupapa

Te tātari raraunga

Te tātari raraunga

I muri i te hoko Ratonga

Nga ratonga muri-hoko


  • Tōmua:
  • Panuku:

  • a.Phenotype QC

    Hetogram tohatoha auau

    whakaahua9

    Tauanga tohu tohu

    whakaahua10

    b.Te tātari hononga (Tauira: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

    Whakatakotoranga QQ

    whakaahua11

    Manhattan Pikitia

    Ammonia_emmax_manhattan_00

    Tau

    Hautaka

    IF

    Taitara

    2022

    NC

    17.69

    Ko te turanga ira o te giga-chromosomes me te giga-genome o te peony rakau Paeonia ostii

    2015

    NP

    7.43

    Ko nga tapuwae o te kainga ka punga i nga rohe ira tangata whai hiranga agronomic i roto i te soybeans

    2018

    MP

    9.32

    Ko te resequence-genome-katoa o te kohinga o te ao katoa o nga whakaurunga rapeseed e whakaatu ana i te putake ira o te rerekeetanga o te momo rauropi.

    2022

    HR

    7.29

    Ko te tātari hononga-a-nui-a-ira e whakaatu ana i nga tirohanga irapoi ki te rereketanga o te rahi o te kakano merengi

    whiwhi korero

    Tuhia to korero ki konei ka tukuna mai ki a matou

    Tukuna mai to korero ki a matou: