Genome harore

Ko nga Hangarau Biomarker e whakarato ana i te rangahau ira ira, ira pai me te pene-kaoti ira o te harore i runga i te whainga rangahau motuhake.Ko te raupapa ira, te huihuinga me te tuhinga mahi ka taea te whakatutuki ma te whakakotahi i te raupapa o muri-whakatupuranga + Te raupapa reanga tuatoru ki te whakatutuki i te huihuinga genome taumata-tiketike.Ka taea hoki te whakamahi hangarau Hi-C hei whakahaere i te huihuinga ira i te taumata chromosome.

Paparanga:PacBio Sequel II

Nanopore PromethION P48

Illumina NovaSeq Platform

Whakapā mai

Nga Taipitopito Ratonga

Hua Whakaaturanga

Painga Ratonga

● He maha nga rautaki raupapa e waatea ana mo nga whaainga rangahau rereke

● He tino mohio ki te whakahiato ira momo harore me te neke atu i te 10,000 pene-oti ira ira tangata kua huihui.

● Ngaio i muri-hoko roopu tautoko hangarau e whakatutuki ana i nga hiahia rangahau motuhake ake.

Whakatakotoranga Ratonga

Ratonga	Rautaki Raupapa	Kounga taurangi	Te wa huri-huringa
Mapi pai harore	Illumina 50X+Nanopore 100X	Contig N50≥2 Mb	35 ra mahi
Mapi pai harore	PacBio HiFi 30X	Contig N50≥2 Mb	35 ra mahi
Mapi harore pene-oti	Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X	ōwehenga pūnga Chromosome >90%	45 nga ra mahi

Ko nga rangahau bioinformatics

● Mana kounga raraunga raw

● Huihuinga Genome

● Te tātari wae o Genome

● Tohu mahi ira

● Te tātari iraira whakatairite

Nga Whakaritenga Tauira me te Tukunga

Whakaritenga Tauira:

MoNga tangohanga DNA:

Momo Tauira	Te nui	Te aro	Maamaa
Nga tangohanga DNA	＞ 1.2 μg	＞ 20 ng/μl	OD260/280= 1.6-2.5

Mo nga tauira kiko:

Momo tauira

Te maimoatanga tauira e taunaki ana

Te rokiroki tauira me te tuku

Te harore unicellular

Tirohia te rewena i raro i te karu karu ka kohia i roto i to raatau waahanga

Whakawhitihia te ahurea (kei roto tata ki te 3-4.5e9 nga pūtau) ki roto i te eppendorf 1.5, 2 ml ranei.(Kia mau ki te hukapapa)

Whakawhanahia te ngongo mo te 1 meneti i te 14000 g hei kohi huakita me te ata tango i te supernatant

Hirihia te ngongo ka whakatio i te huakita ki roto i te hauota wai mo te iti rawa 1-3 haora.Whakaorangia te ngongo ki roto i te pouaka pouaka -80 ℃.

Whakatiotia nga tauira ki roto i te hauota wai mo te 3-4 haora ka penapena ki roto i te hauota wai, -80 tohu ranei ki te rahui mo te wa roa.Ko te tuku tauira me te huka maroke e hiahiatia ana.

Te harore Tonotono

Ka tūtohuhia te kopa kei te tipu kaha.

Horoia te kiko ki te wai kore-endotoxin, ka 70% ethonal.

Tiakina te tauira ki roto i nga ngongo tangi.