Te Whakaraupapa DNA/RNA - Nanopore Sequencer

Ko te raupapatanga ONT he moroiti kotahi mo te wa-tuituru te hangarau raupapa tohu hiko i runga i nga nanopores, he rite tonu te maapono raupapa o ia turanga.Ko te DNA/RNA taurua-rua ka herea ki te pūmua nanoporous kua mau ki roto i te kiriata koiora me te wetewete i raro i te arataki o te pūmua motopaika, i raro i te mahi o te rereketanga ngaohiko mai i nga taha e rua o te kiriata koiora, ka haere nga whenu DNA/RNA i roto i te pūmua hongere nanopore i tetahi waahi. reiti.Na te rereketanga o nga ahuatanga matū o nga turanga rereke i runga i te whenu DNA/RNA, ka haere tetahi turanga kotahi, he ngota ngota DNA ranei i roto i te hongere nanopore, ka puta te huringa o nga tohu hiko rereke.Ma te kimi me te hono ki enei tohu, ka taea te tatau i nga momo turanga e rite ana, a ka taea te whakaoti i te kitenga o te raupapa.

Whakapā mai

Nga Taipitopito Ratonga

Hua Whakaaturanga

Nga Taipitopito Ratonga

Paerewa	Rahi Whare Pukapuka	Hua Raraunga Tikanga (Ia Pūtau)	Turanga-kotahi Tika	Nga tono
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90Gb/Putau	85-92%	Waeatanga SV, De novo, Whakaraupapatanga roa-katoa, Iso-Seq, Tohu ira, Te kitenga o te methylation DNA

Painga Ratonga

● Neke atu i te 5 tau te wheako i runga i te papa raupapa raupapa PacBio me nga mano tini kaupapa kati me nga momo momo.
● Ko BMKGENE he hoa mana o Oxford Nanopore, me te tohu tohu RNA/DNA rua.
● He tauira auraki o nga kaiwhakaraupapa me nga taputapu katoa me te nui o te whakaputanga raupapa.
● I runga i te papanga Nanopore, neke atu i te 10 nga rangahau kararehe me nga tipu Denovo kua whakaputaina i roto i nga pukapuka rongonui o te ao.

Nga Whakaritenga Tauira

Momo Tauira

Te nui

Kukukūtanga(Qubit ®)

Rōrahi

Maamaa

Ko etahi atu

DNA genomic

Kei runga i nga whakaritenga Raraunga

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5；

Maama te tihi i te 260 nm, karekau he poke

Me ine te kukū ma te Qubit me te Qubit/Nanopore ≤ 2

RNA katoa

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5；karekau he poke

Uara RIN ≥7.5

Rerengamahi Ratonga

Te whakarite tauira

Te hanga whare pukapuka

Whakaraupapa

Te tātari raraunga

Te tuku kaupapa

Tōmua: Te Whakaraupapa DNA / RNA - Ko te Kairangahau Illumina

Panuku: Whakaraupapa Wāhanga Whakanuia Tauwhāiti-Locus (SLAF-Seq)

Te Aromatawai Kounga Raraunga o te Tauira DNA

Ripanga 1. Nga tatauranga mo nga raraunga ma.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	maN50Len	cleanN90Len	maMeanLen	maMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9