Illumina me BGI
Ngā āhuatanga
●Paerewa:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten me BGI-DNB-T7
●Aratau raupapa:PE50, PE100, PE150, PE250
●Te whakahaere kounga o nga whare pukapuka i mua i te raupapa
●Te raupapa tuku raraunga me te QC:te tuku purongo QC me nga raraunga mata i roto i te whakatakotoranga fastq i muri i te whakakore me te tātari i nga panui Q30.
Painga Ratonga
●Te maha o nga ratonga Whakaraupapa:ka whiriwhiri pea te kaihoko ki te raupapa ma te ara, te rere o te pūtau, te nui ranei o nga raraunga.
●Te maha o nga papaaho:Ka taea te whakawhiti i nga whare pukapuka DNB ki nga papaaho Illumina
●He wheako nui i runga i te papaaho raupapa Illumina:me nga mano tini kaupapa kati me nga momo momo.
●Te tukunga o te ripoata a QC:me nga inenga kounga, te tika o nga raraunga me te mahinga katoa o te kaupapa raupapa.
●Te tukanga raupapa pakeke:me te wa poto hurihuri.
●Mana Mana Kounga: ka whakatinanahia e matou nga whakaritenga a QC hei whakapumau i te tukunga o nga hua o te kounga teitei.
Whakaritenga Tauira*
Te Raupapa Ara Wahi
| Raraunga Raraunga (X) | Kukū (qPCR/nM) | Rōrahi |
| X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| 50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
| X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Ara Kotahi (Illumina)
| Paerewa | Kukū (qPCR/nM) | Rōrahi |
| HiSeq X Tekau | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq X | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
I tua atu i te kukū me te tapeke moni, ka hiahiatia ano he tauira tihi pai.
Tena koa waea mai ki a maatau ki te kore o tauira e tutuki i nga whakaritenga rauemi timatanga.
Rerengamahi Ratonga
Te whakahaere kounga o te whare pukapuka
Whakaraupapa
Mana kounga raraunga
Te tuku kaupapa
Pūrongo QC Whare Pukapuka
Ka tukuna he purongo mo te kounga o te whare pukapuka i mua i te raupapatanga, te aromatawai i te nui o te whare pukapuka, me te wehewehenga.
Te raupapa QC ripoata
Ripanga 1. Nga tatauranga mo te raupapa raraunga.
| Tauira ID | BMKID | Panui mata | Raraunga Raw (bp) | Nga panui ma (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Whakaahua 1. Te tohatoha kounga i runga i nga panui i ia tauira
Whakaahua 2. Te tohatoha ihirangi turanga
Whakaahua 3. Te tohatoha o nga korero panui i roto i nga raraunga raupapa
