BMKCloud Log in
条形banner-03

Hua

BMKMANU S1000 Transcriptome Mokowā

Ko te whakahaere mokowā o ngā pūtau e whai wāhi nui ana i roto i ngā momo hātepe koiora, penei i te kuhu mai o te mate, te whanaketanga o te kukune, me era atu.Na te whakawhanaketanga o te hangarau, me ako te ahua o te kiko ultra-marama me te tino rerekeetanga hanganga o te whakaaturanga rapoi mokowhiti me te taumira teitei ake.E whakarato ana a BMKGENE i te ratonga whakamaarama mokowhiti mokowhiti, kotahi-mutu mai i nga tauira ki nga tirohanga koiora.

I whakamanahia e nga hangarau whakawhiti mokowhiti nga tirohanga hou i roto i nga waahi rangahau kanorau ma te whakatau i te whakaaturanga whakaaturanga ira me nga ihirangi mokowā i roto i nga tauira rereke.

maramara tuhi mokowā: BMKMANU S1000

Paerewa: Illumina NovaSeq Platform


Nga Taipitopito Ratonga

Bioinformatics

Hua Whakaaturanga

BMKMANU S1000 Mahinga Hangarau Transcriptome Mokowā

S1000.

Nga painga o BMKMANU S1000

1) Taumira iti-pūtau: Kei ia waahi hopu > 2 miriona Mokowā Waehere Paetukutuku me te diameter o te 2.5 µm me te mokowā o te 5 µm i waenga i nga pokapu waahi, ka taea te tātari tuhinga mokowā me te taumira iti-pūtau (5 µm).

s1000 (1)

2) Te tātari taumira taumata-maha: Te tātari taumata-maha ngawari mai i te 100 μm ki te 5 μm hei whakatau i nga ahuatanga o te kiko kanorau i te taumira tino pai.

s1000 (2)

3) Ko te whakamohiotanga o te tuhinga whanui: Ka taea te wetewete i nga tuhinga i hopukina mai i te kiriata kikokiko katoa, me te kore e herea ki te maha o nga ira e whaaia ana me te waahi kua tohua.

s1000 (3)

Whakatakotoranga Ratonga

Whare Pukapuka

Rautaki raupapa

Putanga Raraunga e taunaki ana

S1000 whare pukapuka cDNA

BMKMANU S1000-Illumina PE150

60Gb/tauira

Tauira Whakaritenga

Tauira

Tau

Rahi

Kounga RNA

OCT poraka kiko kua mau

2-3 poraka/ tauira

Approx.6.8x6.8x6.8 mm3

RIN≥7

Mo te roanga atu o nga korero mo te aratohu whakarite tauira me te rerenga mahi ratonga, tena koa korero ki a

Te Rerenga Mahi Ratonga

Tauira QC

Hoahoa whakamatautau

tuku tauira

Te tuku tauira

Whakamatau pairati

Whakamātau-mua

Waehere mokowā

Waehere mokowā

Te Whakaritenga Whare Pukapuka

Te hanga whare pukapuka

Whakaraupapa

Whakaraupapa

Te tātari raraunga

Te tātari raraunga

I muri i te hoko Ratonga

Nga ratonga muri-hoko


  • Tōmua:
  • Panuku:

  • 10x (9)

    Ko nga raraunga i hangaia e BMKMANU S1000 ka tātarihia ma te whakamahi i te raupaparorohiko "BSTMatrix", he mea hanga motuhake e BMKGENE, tae atu ki:

    1) Te whakaputanga matrix whakaputanga ira
    2) HE tukatuka whakaahua
    3) He hototahi ki te raupaparorohiko riipene tuatoru mo te tātari
    4) Ka awhina te "BSTViewer" ipurangi ki te whiwhi i nga hua tirohanga ki nga whakataunga rereke.

    1.Spot clustering

    s1000 (4)

    2.Tohaina mokowhiti

    s1000 (5)s1000 (6)

    Note: Whakatautaumata=13 (100 µm, maui); 7 (50 µm, matau)

    3.Whakaahua tohu te maha o te mapi wera whakarapu

    s1000 (7)

    4.Inter-tauira tātari raraunga

    s1000 (8)

     

    whiwhi korero

    Tuhia to korero ki konei ka tukuna mai ki a matou

    Tukuna mai to korero ki a matou: